Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02903
• Subject: XM_006498202.3
• Aligned Length: 1598
• Identities: 1277
• Gaps: 175

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGGGTGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTAGCGGCCAAAGTAAGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGTGCAGACCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCAGAGATGCAACCTGCACCCCAGAACAAGCGCCGCCTCTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCC---CAGCATTAGGAAGCCCGCAGGC----GAGGGCC  289
            |||||.|||.|.||.|||||||||.|||||||.|||.|   ||||   .|||||||    |||    |||||||
Sbjct  223  TCCAATGGCCGATATGAGGGCAGCATCTCAGATGAGGCAGTCAGC---GGGAAGCC----GGCTATAGAGGGCC  289

Query  290  CTCAGCCTCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTG  363
            |.|||||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||..||.||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  290  CCCAGCCCCACGTGTACACCATCTCTAGAGAGCCCGCCCTGCTACCTGGCTCTGAAGCTGAAGCCATTGAGCTA  363

Query  364  GCGGTGGTGAAGGGG------CGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGG  431
            ||.|||||.||.|||      |.||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  364  GCAGTGGTAAAAGGGAGGAGACAGCGGGAACGGCACCCTCACCACCACAGCCAGCCCCTGCGTGCCAGCCCAGG  437

Query  432  TGGCAGCCGGGAGGACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCG  505
            ..||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  438  CAGCAGCCGGGAGGACATCAGCAGGCCCTGCCAAAGCTGGGCAGGAAGCCGCCAGGGCTCCAAAGAGTGCCCAG  511

Query  506  GATGTGCCCAGCTGGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCC  579
            |||||||||||||||..|||||.|||.|..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||| .||||
Sbjct  512  GATGTGCCCAGCTGGTCCCTGGTCCCTCTTCTCGGGCCTTTGGGCTGGAGCAGCCACCTCTACCTGAG-GCTCC  584

Query  580  -GGTCGCCGCAAGAAGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGT  652
             ||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||||||||.||..||||.||.||||||||||
Sbjct  585  TGGCCGCCACAAGAAGCTGGAAAGGATGTATAGCGTTGATGGAGTGTCTGATGATGTCCCCATCCGTACCTGGT  658

Query  653  TCCCCAAGGAAAATCTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGCGGTGTTCAGGGGCTACGCGGAG  726
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||                      
Sbjct  659  TCCCCAAGGAAAACCTTTTCAGCTTCCAGACGGCAACCACAACTATGCAAGC----------------------  710

Query  727  AGGAAGCGCCGGAAACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGT  800
                                           |.|||          .|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  -------------------------------CATCT----------CGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGT  743

Query  801  CGGCAGCCGGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACC  874
            .|||||.|||.||||||||||||||                                                 
Sbjct  744  TGGCAGTCGGCGGGTGAAGGCCCAG-------------------------------------------------  768

Query  875  CCACCCCCATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCACGCTG  948
                                                     |||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  769  -----------------------------------------AGCAGTGACCTACAGAGCTCACACTGCACCCTG  801

Query  949  GACGAGGCCTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAAGGCTT  1022
            ||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||.|||||||.|||||
Sbjct  802  GATGAGGCTTGTGAGGACCTGGACTGGGACACAGAGAAAGGTCTGGAGGCCATGGCCTGCAACACCGAGGGCTT  875

Query 1023  CGTGCCACCAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCGCCGGG  1096
            |.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||.|.|
Sbjct  876  CTTGCCACCCAAGGTCATGCTCATCTCCTCCAAGGTGCCAAAGGCCGAGTATATCCCTACTATCATCCGCAGAG  949

Query 1097  ATGACCCCTCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGATAGAG  1170
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  950  ATGACCCGTCCATCATTCCCATCCTCTACGACCACGAGCATGCAACCTTCGAGGACATCCTGGAGGAAATAGAG  1023

Query 1171  AGGAAGCTGAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCCTGGACA  1244
            |.|||..|||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1024  AAGAAATTGAACATCTATCACAAGGGGGCCAAGATCTGGAAGATGCTGATTTTCTGCCAGGGCGGCCCTGGACA  1097

Query 1245  CCTCTATCTCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGA  1318
            |||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1098  CCTTTATTTGCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATCCACTTCTGGA  1171

Query 1319  AGCGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTG  1392
            ||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  AGAGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAGGTGAACCCCGAGCCGAATGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTG  1245

Query 1393  GGGAACCCCAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTC  1466
            ||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||.|||||
Sbjct 1246  GGGAACCCTAACGGGGAGAAGCTATTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACCCCTTACAAGGTTACCTTTGAGTC  1319

Query 1467  ACCCCTGGAGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGA  1540
            .||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct 1320  GCCTCTCGAGCTGTCTGCCCAAGGGAAGCAGATGATTGAGACCTACTTTGACTTCCGGCTGTACCGCCTGTGGA  1393

Query 1541  AGAGCCGCCAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1584
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1394  AGAGCCGCCAGCACTCAAAGCTGCTGGACTTTGATGACGTCCTG  1437