Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02903
- Subject:
- XM_017319142.1
- Aligned Length:
- 1772
- Identities:
- 1364
- Gaps:
- 259
Alignment
Query 1 ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC 74
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||
Sbjct 1 ATGGGTGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTAGCGGCCAAAGTAAGAGC 74
Query 75 AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 75 AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGTGCAGACCACCTGCTGGCTG 148
Query 149 ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC 222
|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 ACGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCAGAGATGCAACCTGCACCCCAGAACAAGCGCCGCCTCTCCCTCGTC 222
Query 223 TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCC---CAGCATTAGGAAGCCCGCAGGC----GAGGGCC 289
|||||.|||.|.||.|||||||||.|||||||.|||.| |||| .||||||| ||| |||||||
Sbjct 223 TCCAATGGCCGATATGAGGGCAGCATCTCAGATGAGGCAGTCAGC---GGGAAGCC----GGCTATAGAGGGCC 289
Query 290 CTCAGCCTCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTG 363
|.|||||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||..||.||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 290 CCCAGCCCCACGTGTACACCATCTCTAGAGAGCCCGCCCTGCTACCTGGCTCTGAAGCTGAAGCCATTGAGCTA 363
Query 364 GCGGTGGTGAAGGGG------CGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGG 431
||.|||||.||.||| |.||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 364 GCAGTGGTAAAAGGGAGGAGACAGCGGGAACGGCACCCTCACCACCACAGCCAGCCCCTGCGTGCCAGCCCAGG 437
Query 432 TGGCAGCCGGGAGGACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCG 505
..||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 438 CAGCAGCCGGGAGGACATCAGCAGGCCCTGCCAAAGCTGGGCAGGAAGCCGCCAGGGCTCCAAAGAGTGCCCAG 511
Query 506 GATGTGCCCAGCTGGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCC 579
|||||||||||||||..|||||.|||.|..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||| .||||
Sbjct 512 GATGTGCCCAGCTGGTCCCTGGTCCCTCTTCTCGGGCCTTTGGGCTGGAGCAGCCACCTCTACCTGAG-GCTCC 584
Query 580 -GGTCGCCGCAAGAAGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGT 652
||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||||||||.||..||||.||.||||||||||
Sbjct 585 TGGCCGCCACAAGAAGCTGGAAAGGATGTATAGCGTTGATGGAGTGTCTGATGATGTCCCCATCCGTACCTGGT 658
Query 653 TCCCCAAGGAAAATCTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGCGGTGTTCAGGGGCTACGCGGAG 726
|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 659 TCCCCAAGGAAAACCTTTTCAGCTTCCAGACGGCAACCACAACTATGCAAGC---------------------- 710
Query 727 AGGAAGCGCCGGAAACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGT 800
|.||| .|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711 -------------------------------CATCT----------CGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGT 743
Query 801 CGGCAGCCGGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACC 874
.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 TGGCAGTCGGCGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGTCGCGAACGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACC 817
Query 875 CCACCCCCATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCACGCTG 948
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 818 CCACCCCTATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTACAGAGCTCACACTGCACCCTG 891
Query 949 GACGAGGCCTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAAGGCTT 1022
||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 892 GATGAGGCTTGTGAGGACCTGGACTGGGACACAGAGAAAGGTCTGGAGGCCATGGCCTGCAACACCGAGGGCTT 965
Query 1023 CGTGCCACCAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCGCCGGG 1096
|.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||.|.|
Sbjct 966 CTTGCCACCCAAGGTCATGCTCATCTCCTCCAAGGTGCCAAAGGCCGAGTATATCCCTACTATCATCCGCAGAG 1039
Query 1097 ATGACCCCTCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGATAGAG 1170
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1040 ATGACCCGTCCATCATTCCCATCCTCTACGACCACGAGCATGCAACCTTCGAGGACATCCTGGAGGAAATAGAG 1113
Query 1171 AGGAAGCTGAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGC----------------- 1227
|.|||..|||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1114 AAGAAATTGAACATCTATCACAAGGGGGCCAAGATCTGGAAGATGCTGATTTTCTGCCAGGTAGAAGCAGCCTT 1187
Query 1228 -------------------------------------------------------------------------- 1227
Sbjct 1188 TCCTTTCCTCCCCAGGAAAAGAGGGCAGTGTGGTATGGGTAGGGCCCCAAGATCTTACTCAGTGTGGGCGTGTC 1261
Query 1228 -------------------------------------------------------------------------- 1227
Sbjct 1262 CATGTGGTACATTTGTGGACGACATGCACACGCCTCATCCTAGCCTCCCCCTAGCACTCCTGAGGCCTGACCGT 1335
Query 1228 ---------CAGGGAGGTCCTGGACACCTCTATCTCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAA 1292
|||||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336 GACCTCTTTCAGGGCGGCCCTGGACACCTTTATTTGCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAA 1409
Query 1293 GGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGAAGCGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCA 1366
|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1410 GGAAGAGGACATGATCCACTTCTGGAAGAGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAGGTGAACCCCGAGCCGAATGTCA 1483
Query 1367 TCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCCAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATG 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1484 TCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCTAACGGGGAGAAGCTATTCCAGAACCTCAGGACCCTCATG 1557
Query 1441 ACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTCACCCCTGGAGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTT 1514
||.|||||.|.|||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1558 ACCCCTTACAAGGTTACCTTTGAGTCGCCTCTCGAGCTGTCTGCCCAAGGGAAGCAGATGATTGAGACCTACTT 1631
Query 1515 TGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG 1584
||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1632 TGACTTCCGGCTGTACCGCCTGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCAAAGCTGCTGGACTTTGATGACGTCCTG 1701