Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02962
- Subject:
- NM_001039937.2
- Aligned Length:
- 2661
- Identities:
- 2622
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGCCCATCTTACTGTTCCTGATAGACACGTCTGCCTCTATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------ATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT 35
Query 75 GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36 GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT 109
Query 149 ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 110 ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG 183
Query 223 AATGAATTGAAAAACCTTCAGGCTGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTATT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 AATGAATTGAAAAACCTTCAGGCTGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTATT 257
Query 297 AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCTTTTTTCTTGGAGCCAGCAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 258 AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCTTTTTTCTTGGAGCCAGCAA 331
Query 371 TAATTATCACAATTACTGATGGGAGCAAGTTGACTACCACCAGTGGAGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 TAATTATCACAATTACTGATGGGAGCAAGTTGACTACCACCAGTGGAGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTT 405
Query 445 AATTCTCCTTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTCTTTGCATTAGTGTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406 AATTCTCCTTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTCTTTGCATTAGTGTT 479
Query 519 GCGGTTGCCTGGCACCATGTCAGTAGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTAGATGACTCTGCAATCACAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GCGGTTGCCTGGCACCATGTCAGTAGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTAGATGACTCTGCAATCACAC 553
Query 593 CAATGTGTGAAGTGACAGGCGGCCGTTCATATTCTGTGTGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAGTCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 CAATGTGTGAAGTGACAGGCGGCCGTTCATATTCTGTGTGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAGTCC 627
Query 667 TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAAGCAGGACCAGATCCTTCCCCTGTAGAAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAAGCAGGACCAGATCCTTCCCCTGTAGAAGA 701
Query 741 TGGGCAGCCAGATATATCAAGGCCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAACTCATATATGTCAGAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 TGGGCAGCCAGATATATCAAGGCCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAACTCATATATGTCAGAC 775
Query 815 CAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGTCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAAAATTCGCCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 CAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGTCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAAAATTCGCCA 849
Query 889 ACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAACCAATGGTTATTGATAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 ACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAACCAATGGTTATTGATAA 923
Query 963 ACTTCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAATTTATCCTGGAAAGGAAATCTCCTCAAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 ACTTCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAATTTATCCTGGAAAGGAAATCTCCTCAAA 997
Query 1037 CATGTTGGCAGGTGTACGTGAGCAATAGTGCAAAATACAGTGAACTTGGTCATCCTTTTGGTTACTTGAAAGCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 CATGTTGGCAGGTGTACGTGAGCAATAGTGCAAAATACAGTGAACTTGGTCATCCTTTTGGTTACTTGAAAGCC 1071
Query 1111 AGTACAGCACTGAACTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTATCCAGTCCTTCTTCCCCTCTTAGATGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 AGTACAGCACTGAACTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTATCCAGTCCTTCTTCCCCTCTTAGATGA 1145
Query 1185 CTTGTTTAAAGTGCATAAAGCAAAACCAACATTGAAGTGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAATGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 CTTGTTTAAAGTGCATAAAGCAAAACCAACATTGAAGTGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAATGC 1219
Query 1259 CTCCCTACTATCTTGGGCCCTTGAAGAAAGCTGTTAGGATGATGGGAGCACCTAACCTAATAGCAGACAGTATG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 CTCCCTACTATCTTGGGCCCTTGAAGAAAGCTGTTAGGATGATGGGAGCACCTAACCTAATAGCAGACAGTATG 1293
Query 1333 GAATATGGACTTAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAACTGAGTCAACAGGCCAAAATAGAATCTGATCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 GAATATGGACTTAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAACTGAGTCAACAGGCCAAAATAGAATCTGATCG 1367
Query 1407 AGTCATTGGATCTGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAGACTGGAATAAAAGTCCGGAGCCGATCACATGGTTTAT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 AGTCATTGGATCTGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAGACTGGAATAAAAGTCCGGAGCCGATCACATGGTTTAT 1441
Query 1481 CAATGGCATATAGGAAAGATTTTCAACAACTCCTCCAGGGAATTTCAGAGGATGTCCCTCACAGACTGCTAGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 CAATGGCATATAGGAAAGATTTTCAACAACTCCTCCAGGGAATTTCAGAGGATGTCCCTCACAGACTGCTAGAC 1515
Query 1555 CTTAATATGAAGGAATACACTGGGTTCCAAGTTGCTTTGCTGAATAAGGATTTGAAGCCACAGACATTTAGAAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 CTTAATATGAAGGAATACACTGGGTTCCAAGTTGCTTTGCTGAATAAGGATTTGAAGCCACAGACATTTAGAAA 1589
Query 1629 TGCTTATGACATACCAAGACGAAATCTTTTGGATCACTTAACAAGAATGAGATCTAATCTTTTGAAGAGCACTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1590 TGCTTATGACATACCAAGACGAAATCTTTTGGATCACTTAACAAGAATGAGATCTAATCTTTTGAAGAGCACTC 1663
Query 1703 GCAGATTTCTGAAAGGACAGGACGAAGATCAAGTGCACAGTGTTCCTATAGCACAAATGGGGAACTACCAGGAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664 GCAGATTTCTGAAAGGACAGGACGAAGATCAAGTGCACAGTGTTCCTATAGCACAAATGGGGAACTACCAGGAA 1737
Query 1777 TACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCACTAAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCACGAAGGTTGCATACATTTGGCAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 TACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCACTAAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCACGAAGGTTGCATACATTTGGCAA 1811
Query 1851 CCCCTTTAAGCTGGATAAGAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAAAATAAAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812 CCCCTTTAAGCTGGATAAGAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAAAATAAAC 1885
Query 1925 ATAAACGACCCGGAGAACCAAATATGCAAGGGATCCCTAAAAGACGTCGGTGTATGTCTCCACTACTAAGAGGC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886 ATAAACGACCCGGAGAACCAAATATGCAAGGGATCCCTAAAAGACGTCGGTGTATGTCTCCACTACTAAGAGGC 1959
Query 1999 AGACAGCAGAATCCTGTTGTAAACAATCATATTGGGGGAAAAGGACCACCTGCACCTACAACTCAAGCACAGCC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1960 AGACAGCAGAATCCTGTTGTAAACAATCATATTGGGGGAAAAGGACCACCTGCACCTACAACTCAAGCACAGCC 2033
Query 2073 AGATCTTATTAAACCTCTTCCTCTTCATAAAATTTCAGAAACCACTAATGATTCGATAATACATGATGTGGTTG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 AGATCTTATTAAACCTCTTCCTCTTCATAAAATTTCAGAAACCACTAATGATTCGATAATACATGATGTGGTTG 2107
Query 2147 AAAATCATGTTGCAGACCAACTTTCATCAGACATTACACCAAATGCTATGGATACGGAATTTTCAGCATCTTCT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2108 AAAATCATGTTGCAGACCAACTTTCATCAGACATTACACCAAATGCTATGGATACGGAATTTTCAGCATCTTCT 2181
Query 2221 CCAGCCAGTTTACTGGAACGGCCAACCAATCATATGGAGGCTCTTGGTCATGACCATTTAGGAACCAATGACCT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2182 CCAGCCAGTTTACTGGAACGGCCAACCAATCATATGGAGGCTCTTGGTCATGACCATTTAGGAACCAATGACCT 2255
Query 2295 CACTGTTGGTGGATTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAGATAAAGAACAATGTGCTGAAGAGAACATACCAG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2256 CACTGTTGGTGGATTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAGATAAAGAACAATGTGCTGAAGAGAACATACCAG 2329
Query 2369 CATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGCAGAAGCCATGAAGAGGTCAATACTGAACTAAAAGCA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2330 CATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGCAGAAGCCATGAAGAGGTCAATACTGAACTAAAAGCA 2403
Query 2443 CAAATAATGAAAGAGATCCGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACTTTACTGAAGCATGTGCAAGG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2404 CAAATAATGAAAGAGATCCGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACTTTACTGAAGCATGTGCAAGG 2477
Query 2517 CAGTTTACAAACAAGACTAATATTTTTACAAAATGTCATTAAAGAAGCATCAAGGTTTAAAAAACGAATGCTAA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2478 CAGTTTACAAACAAGACTAATATTTTTACAAAATGTCATTAAAGAAGCATCAAGGTTTAAAAAACGAATGCTAA 2551
Query 2591 TAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAGATCAACCATATTAATAGCAAT 2661
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2552 TAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAGATCAACCATATTAATAGCAAT 2622