Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02962
• Subject: NM_008715.2
• Aligned Length: 2663
• Identities: 2459
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGCCCATCTTACTGTTCCTGATAGACACGTCTGCCTCTATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCATCTTACTGTTCCTGATAGACACGTCTGCCTCTATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT  74

Query   75  GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT  148

Query  149  ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG  222

Query  223  AATGAATTGAAAAACCTTCAGGCTGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTATT  296
            ||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  AATGAACTGAAAAACCTTCAGGCAGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTGTT  296

Query  297  AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCTTTTTTCTTGGAGCCAGCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCCTTTTTCTTGGAGCCAGCAA  370

Query  371  TAATTATCACAATTACTGATGGGAGCAAGTTGACTACCACCAGTGGAGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTT  444
            ||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  TAATAATTACAATCACTGATGGGAGCAAGTTGACTACTACTAGTGGTGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTG  444

Query  445  AATTCTCCTTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTCTTTGCATTAGTGTT  518
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|
Sbjct  445  AATTCGCCGTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTATTTGCTTTAGTGCT  518

Query  519  GCGGTTGCCTGGCACCATGTCAGTAGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTAGATGACTCTGCAATCACAC  592
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  519  GCGGTTGCCTGGCACCATGTCGGTGGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTGGATGATTCTGCTATCACAC  592

Query  593  CAATGTGTGAAGTGACAGGCGGCCGTTCATATTCTGTGTGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAGTCC  666
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  CAATGTGTGAAGTGACAGGAGGCCGGTCATACTCTGTATGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAATCC  666

Query  667  TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAAGCAGGACCAGATCCTTCCCCTGTAGAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||..|||||
Sbjct  667  TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAGGCAGGACCAGATCCTCCCCCTGCTGAAGA  740

Query  741  TGGGCAGCCAGATATATCAAGGCCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAACTCATATATGTCAGAC  814
            .||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGGCAGCCAGATATATCAAGACCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAGCTCATATATGTCAGAC  814

Query  815  CAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGTCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAAAATTCGCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  815  CAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGCCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAGAATTCTCCA  888

Query  889  ACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAACCAATGGTTATTGATAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  889  ACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAGCCAATGGTTATTGACAA  962

Query  963  ACTTCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAATTTATCCTGGAAAGGAAATCTCCTCAAA  1036
            |.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTGCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAGTTTATTCTAGAAAGGAAATCTCCTCAAA  1036

Query 1037  CATGTTGGCAGGTGTACGTGAGCAATAGTGCAAAATACAGTGAACTTGGTCATCCTTTTGGTTACTTGAAAGCC  1110
            |.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1037  CGTGTTGGCAGGTGTATGTGAGCAATAGTGCAAAGTATAATGAACTTGGCCATCCCTTTGGTTACTTGAAAGCT  1110

Query 1111  AGTACAGCACTGAACTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTATCCAGTCCTTCTTCCCCTCTTAGATGA  1184
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1111  AGTACAGCACTGACCTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTACCCAGTCCTCCTTCCTCTATTAGATGA  1184

Query 1185  CTTGTTTAAAGTGCATAAAGCAAAACCAACATTGAAGTGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAATGC  1258
            ||||||.||||||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTGTTCAAAGTGCACAAAGCAAAACCAACTCTGAAATGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAATGC  1258

Query 1259  CTCCCTACTATCTTGGGCCCTTGAAGAAAGCTGTTAGGATGATGGGAGCACCTAACCTAATAGCAGACAGTATG  1332
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCCCTACTATCTTGGGCCCCTGAAGAAAGCTGTTAGAATGATGGGTGCACCTAATCTGATAGCAGACAGTATG  1332

Query 1333  GAATATGGACTTAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAACTGAGTCAACAGGCCAAAATAGAATCTGATCG  1406
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 1333  GAGTATGGACTCAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAATTGAGTCAACAGGCCAAAATTGAATCTGATAG  1406

Query 1407  AGTCATTGGATCTGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAGACTGGAATAAAAGTCCGGAGCCGATCACATGGTTTAT  1480
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1407  AGTCATCGGATCCGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAAACTGGAATTAAAGTCCGAAGCCGGTCACATGGGTTGT  1480

Query 1481  CAATGGCATATAGGAAAGATTTTCAACAACTCCTCCAGGGAATTTCAGAGGATGTCCCTCACAGACTGCTAGAC  1554
            |||||||..|||||||||.||||   |||.|.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||||||
Sbjct 1481  CAATGGCGCATAGGAAAGGTTTT---CAAGTGCTGCAGGGTATTTCGGAGGATGTCCCCCACAGGTTGCTAGAC  1551

Query 1555  CTTAATATGAAGGAATACACTGGGTTCCAAGTTGCTTTGCTGAATAAGGATTTGAAGCCACAGACATTTAGAAA  1628
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1552  CTTAATATGAAGGAGTACACTGGGTTCCAGGTTGCTTTACTAAATAAGGATTTGAAGCCTCAGACCTTTAGAAA  1625

Query 1629  TGCTTATGACATACCAAGACGAAATCTTTTGGATCACTTAACAAGAATGAGATCTAATCTTTTGAAGAGCACTC  1702
            .||||||||.|||||||||||.||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1626  CGCTTATGATATACCAAGACGGAACCTTCTGGATCATTTAACAAGAATGAGATCGAACCTTTTAAAGAGCACCC  1699

Query 1703  GCAGATTTCTGAAAGGACAGGACGAAGATCAAGTGCACAGTGTTCCTATAGCACAAATGGGGAACTACCAGGAA  1776
            |||.||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1700  GCAAATTTCTTAAAGGCCAGGATGAAGATCAAGTGCACAGTGTACCTATAGCACAAATGGGGAATTACCAGGAA  1773

Query 1777  TACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCACTAAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCACGAAGGTTGCATACATTTGGCAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  TACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCATTGAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCTCGAAGGTTGCATACATTTGGCAA  1847

Query 1851  CCCCTTTAAGCTGGATAAGAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAAAATAAAC  1924
            .||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1848  TCCCTTTAAACTGGATAAAAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAGAATAAAC  1921

Query 1925  ATAAACGACCCGGAGAACCAAATATGCAAGGGATCCCTAAAAGACGTCGGTGTATGTCTCCACTACTAAGAGGC  1998
            |.||.||.||.|||||.||||..||||||||||||||.||||||||.||||||...||||||||..|.||||||
Sbjct 1922  ACAAGCGGCCTGGAGAGCCAAGCATGCAAGGGATCCCAAAAAGACGCCGGTGTGCCTCTCCACTCTTGAGAGGC  1995

Query 1999  AGACAGCAGAATCCTGTTGTAAACAATCATATTGGGGGAAAAGGACCACCTGCACCTACAACTCAAGCACAGCC  2072
            .||..|||||..||||.|||.||||.|||.||.||.||.|||||||||||||||||.|..||.|||||||||||
Sbjct 1996  CGAAGGCAGAGCCCTGCTGTGAACAGTCACATCGGAGGGAAAGGACCACCTGCACCCATGACGCAAGCACAGCC  2069

Query 2073  AGATCTTATTAAACCTCTTCCTCTTCATAAAATTTCAGAAACCACTAATGATTCGATAATACATGATGTGGTTG  2146
            ||.||||||||||||.||||||||.|||||      ||||.|||||||||||||.|||.||.||||||||||||
Sbjct 2070  AGGTCTTATTAAACCCCTTCCTCTGCATAA------AGAAGCCACTAATGATTCAATAGTAGATGATGTGGTTG  2137

Query 2147  AAAATCATGTTGCAGACCAACTTTCATCAGACATTACACCAAATGCTATGGATACGGAATTTTCAGCATCTTCT  2220
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||.|.
Sbjct 2138  AAAATCATGTTGCTGACCAACTTTCATCAGACATGACACCAAATGCTATGGATACTGAATTTTTAACATCTCCC  2211

Query 2221  CC--AGCCAGTTTACTGGAACGGCCAACCAATCATATGGAGGCTCTTGGTCATGACCATTTAGGAACCAATGAC  2292
            ||  |.|   |||  ||||||...||||||||||||..|||||.|||||||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 2212  CCTAATC---TTT--TGGAACCATCAACCAATCATACAGAGGCCCTTGGTCATGAACATTTAGGAAACAATGAC  2280

Query 2293  CTCACTGTTGGTGGATTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAGATAAAGAACAATGTGCTGAAGAGAACATACC  2366
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||.||||||||.|||||
Sbjct 2281  CTCACTGTTGGTGGGTTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAAATAAAGAACAAAGTGCCGAAGAGAATATACC  2354

Query 2367  AGCATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGCAGAAGCCATGAAGAGGTCAATACTGAACTAAAAG  2440
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2355  AGCATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGTAGAAGCCATGAAGAGGTCAACACTGAACTAAAAG  2428

Query 2441  CACAAATAATGAAAGAGATCCGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACTTTACTGAAGCATGTGCAA  2514
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2429  CACAAATAATGAAAGAGATCAGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACCTTACTGAAGCATGTGCAA  2502

Query 2515  GGCAGTTTACAAACAAGACTAATATTTTTACAAAATGTCATTAAAGAAGCATCAAGGTTTAAAAAACGAATGCT  2588
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2503  GGCAGTTTACAAACAAGGCTAATATTCTTACAAAATGTCATTAAGGAAGCATCCAGGTTTAAGAAACGAATGCT  2576

Query 2589  AATAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAGATCAACCATATTAATAGCAAT  2661
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2577  AATAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAAATCAACCATATTAATAGCAAT  2649