Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02962
• Subject: XM_006518680.3
• Aligned Length: 2666
• Identities: 2459
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGCCCATCTTACTGTTCCTGATAGACACGTCTGCCTCTATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCATCTTACTGTTCCTGATAGACACGTCTGCCTCTATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT  74

Query   75  GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT  148

Query  149  ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG  222

Query  223  AATGAATTGAAAAACCTTCAGGCTGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTATT  296
            ||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  AATGAACTGAAAAACCTTCAGGCAGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTGTT  296

Query  297  AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCTTTTTTCTTGGAGCCAGCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCCTTTTTCTTGGAGCCAGCAA  370

Query  371  TAATTATCACAATTACTGATGGGAGCAAGTTGACTACCACCAGTGGAGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTT  444
            ||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  TAATAATTACAATCACTGATGGGAGCAAGTTGACTACTACTAGTGGTGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTG  444

Query  445  AATTCTCCTTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTCTTTGCATTAGTGTT  518
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|
Sbjct  445  AATTCGCCGTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTATTTGCTTTAGTGCT  518

Query  519  GCGGTTGCCTGGCACCATGTCAGTAGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTAGATGACTCTGCAATCACAC  592
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  519  GCGGTTGCCTGGCACCATGTCGGTGGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTGGATGATTCTGCTATCACAC  592

Query  593  CAATGTGTGAAGTGACAGGCGGCCGTTCATATTCTGTGTGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAGTCC  666
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  CAATGTGTGAAGTGACAGGAGGCCGGTCATACTCTGTATGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAATCC  666

Query  667  TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAAGCAGGACCAGATCCTTCCC---CTGTAGA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||   |||.||.
Sbjct  667  TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAGGCAGGACCAGATCCTCCCCCTGCTGAAGC  740

Query  738  AGATGGGCAGCCAGATATATCAAGGCCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAACTCATATATGTCA  811
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  741  AGAGGGGCAGCCAGATATATCAAGACCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAGCTCATATATGTCA  814

Query  812  GACCAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGTCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAAAATTCG  885
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  GACCAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGCCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAGAATTCT  888

Query  886  CCAACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAACCAATGGTTATTGA  959
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  CCAACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAGCCAATGGTTATTGA  962

Query  960  TAAACTTCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAATTTATCCTGGAAAGGAAATCTCCTC  1033
            .|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAATTGCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAGTTTATTCTAGAAAGGAAATCTCCTC  1036

Query 1034  AAACATGTTGGCAGGTGTACGTGAGCAATAGTGCAAAATACAGTGAACTTGGTCATCCTTTTGGTTACTTGAAA  1107
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|.|||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  AAACGTGTTGGCAGGTGTATGTGAGCAATAGTGCAAAGTATAATGAACTTGGCCATCCCTTTGGTTACTTGAAA  1110

Query 1108  GCCAGTACAGCACTGAACTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTATCCAGTCCTTCTTCCCCTCTTAGA  1181
            ||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1111  GCTAGTACAGCACTGACCTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTACCCAGTCCTCCTTCCTCTATTAGA  1184

Query 1182  TGACTTGTTTAAAGTGCATAAAGCAAAACCAACATTGAAGTGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAA  1255
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGACTTGTTCAAAGTGCACAAAGCAAAACCAACTCTGAAATGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAA  1258

Query 1256  TGCCTCCCTACTATCTTGGGCCCTTGAAGAAAGCTGTTAGGATGATGGGAGCACCTAACCTAATAGCAGACAGT  1329
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1259  TGCCTCCCTACTATCTTGGGCCCCTGAAGAAAGCTGTTAGAATGATGGGTGCACCTAATCTGATAGCAGACAGT  1332

Query 1330  ATGGAATATGGACTTAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAACTGAGTCAACAGGCCAAAATAGAATCTGA  1403
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  ATGGAGTATGGACTCAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAATTGAGTCAACAGGCCAAAATTGAATCTGA  1406

Query 1404  TCGAGTCATTGGATCTGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAGACTGGAATAAAAGTCCGGAGCCGATCACATGGTT  1477
            |.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1407  TAGAGTCATCGGATCCGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAAACTGGAATTAAAGTCCGAAGCCGGTCACATGGGT  1480

Query 1478  TATCAATGGCATATAGGAAAGATTTTCAACAACTCCTCCAGGGAATTTCAGAGGATGTCCCTCACAGACTGCTA  1551
            |.||||||||..|||||||||.||||   |||.|.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||
Sbjct 1481  TGTCAATGGCGCATAGGAAAGGTTTT---CAAGTGCTGCAGGGTATTTCGGAGGATGTCCCCCACAGGTTGCTA  1551

Query 1552  GACCTTAATATGAAGGAATACACTGGGTTCCAAGTTGCTTTGCTGAATAAGGATTTGAAGCCACAGACATTTAG  1625
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1552  GACCTTAATATGAAGGAGTACACTGGGTTCCAGGTTGCTTTACTAAATAAGGATTTGAAGCCTCAGACCTTTAG  1625

Query 1626  AAATGCTTATGACATACCAAGACGAAATCTTTTGGATCACTTAACAAGAATGAGATCTAATCTTTTGAAGAGCA  1699
            |||.||||||||.|||||||||||.||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1626  AAACGCTTATGATATACCAAGACGGAACCTTCTGGATCATTTAACAAGAATGAGATCGAACCTTTTAAAGAGCA  1699

Query 1700  CTCGCAGATTTCTGAAAGGACAGGACGAAGATCAAGTGCACAGTGTTCCTATAGCACAAATGGGGAACTACCAG  1773
            |.||||.||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1700  CCCGCAAATTTCTTAAAGGCCAGGATGAAGATCAAGTGCACAGTGTACCTATAGCACAAATGGGGAATTACCAG  1773

Query 1774  GAATACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCACTAAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCACGAAGGTTGCATACATTTGG  1847
            |||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  GAATACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCATTGAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCTCGAAGGTTGCATACATTTGG  1847

Query 1848  CAACCCCTTTAAGCTGGATAAGAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAAAATA  1921
            |||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1848  CAATCCCTTTAAACTGGATAAAAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAGAATA  1921

Query 1922  AACATAAACGACCCGGAGAACCAAATATGCAAGGGATCCCTAAAAGACGTCGGTGTATGTCTCCACTACTAAGA  1995
            ||||.||.||.||.|||||.||||..||||||||||||||.||||||||.||||||...||||||||..|.|||
Sbjct 1922  AACACAAGCGGCCTGGAGAGCCAAGCATGCAAGGGATCCCAAAAAGACGCCGGTGTGCCTCTCCACTCTTGAGA  1995

Query 1996  GGCAGACAGCAGAATCCTGTTGTAAACAATCATATTGGGGGAAAAGGACCACCTGCACCTACAACTCAAGCACA  2069
            |||.||..|||||..||||.|||.||||.|||.||.||.||.|||||||||||||||||.|..||.||||||||
Sbjct 1996  GGCCGAAGGCAGAGCCCTGCTGTGAACAGTCACATCGGAGGGAAAGGACCACCTGCACCCATGACGCAAGCACA  2069

Query 2070  GCCAGATCTTATTAAACCTCTTCCTCTTCATAAAATTTCAGAAACCACTAATGATTCGATAATACATGATGTGG  2143
            |||||.||||||||||||.||||||||.|||||      ||||.|||||||||||||.|||.||.|||||||||
Sbjct 2070  GCCAGGTCTTATTAAACCCCTTCCTCTGCATAA------AGAAGCCACTAATGATTCAATAGTAGATGATGTGG  2137

Query 2144  TTGAAAATCATGTTGCAGACCAACTTTCATCAGACATTACACCAAATGCTATGGATACGGAATTTTCAGCATCT  2217
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||
Sbjct 2138  TTGAAAATCATGTTGCTGACCAACTTTCATCAGACATGACACCAAATGCTATGGATACTGAATTTTTAACATCT  2211

Query 2218  TCTCC--AGCCAGTTTACTGGAACGGCCAACCAATCATATGGAGGCTCTTGGTCATGACCATTTAGGAACCAAT  2289
            .|.||  |.|   |||  ||||||...||||||||||||..|||||.|||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 2212  CCCCCTAATC---TTT--TGGAACCATCAACCAATCATACAGAGGCCCTTGGTCATGAACATTTAGGAAACAAT  2280

Query 2290  GACCTCACTGTTGGTGGATTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAGATAAAGAACAATGTGCTGAAGAGAACAT  2363
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||.||||||||.||
Sbjct 2281  GACCTCACTGTTGGTGGGTTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAAATAAAGAACAAAGTGCCGAAGAGAATAT  2354

Query 2364  ACCAGCATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGCAGAAGCCATGAAGAGGTCAATACTGAACTAA  2437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2355  ACCAGCATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGTAGAAGCCATGAAGAGGTCAACACTGAACTAA  2428

Query 2438  AAGCACAAATAATGAAAGAGATCCGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACTTTACTGAAGCATGTG  2511
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2429  AAGCACAAATAATGAAAGAGATCAGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACCTTACTGAAGCATGTG  2502

Query 2512  CAAGGCAGTTTACAAACAAGACTAATATTTTTACAAAATGTCATTAAAGAAGCATCAAGGTTTAAAAAACGAAT  2585
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 2503  CAAGGCAGTTTACAAACAAGGCTAATATTCTTACAAAATGTCATTAAGGAAGCATCCAGGTTTAAGAAACGAAT  2576

Query 2586  GCTAATAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAGATCAACCATATTAATAGCA  2659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2577  GCTAATAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAAATCAACCATATTAATAGCA  2650

Query 2660  AT  2661
            ||
Sbjct 2651  AT  2652