Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02966
- Subject:
- NM_133188.2
- Aligned Length:
- 1221
- Identities:
- 1082
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGAACAACTCGGGCGCCGACGAGATCGGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGAC 74
|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGAACAGCGCGGGCGCCGACGAAATCGGGAAGCTCTTTGTGGGCGGCCTGGACTGGAGTACCACTCAAGAGAC 74
Query 75 TCTGCGCAGCTACTTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGT 148
|||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCTACGCAGCTACTTTTCCCAGTATGGTGAGGTTGTGGATTGTGTCATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGT 148
Query 149 CTCGAGGCTTTGGGTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACG 222
||.||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 149 CTAGAGGCTTTGGATTTGTCAAGTTTAAAGACCCCAATTGTGTGGGGACAGTGCTGGCCAGCAGACCACACACC 222
Query 223 CTAGATGGCCGAAACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGA 296
||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||
Sbjct 223 CTAGATGGCCGAAATATCGACCCGAAGCCGTGCACACCTCGGGGGATGCAGCCAGAGCGAACACGGCCCAAGGA 296
Query 297 AGGATGGCAGAAAGGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATT 370
|||.|| ||||||||||||||||||.|.|||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 297 AGGCTG---GAAAGGACCCAGGAGCGACAGCAGCAAATCCAACAAGATCTTTGTCGGGGGCATTCCCCACAACT 367
Query 371 GTGGTGAGACAGAGCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCC 444
|.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 368 GCGGGGAGACGGAGCTCAGGGAGTACTTCAAGAAGTTTGGAGTGGTCACAGAGGTGGTTATGATCTATGATGCG 441
Query 445 GAGAAGCAGAGGCCCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACAT 518
|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 GAGAAGCAGCGGCCTCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACAT 515
Query 519 GCATTTTCACGACATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGC 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||.|
Sbjct 516 GCATTTTCACGACATCATGGGCAAAAAAGTGGAGGTTAAACGGGCTGAACCACGGGACAGCAAGAATCAAGCTC 589
Query 593 CGGGACAGCCAGGTGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCC 666
|.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||||..||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 590 CAGGACAGCCAGGAGCCAGCCAGTGGGGCAGCCGCGTGGCGCCCAGTGCAGCCAACGGCTGGGCAGGCCAGCCC 663
Query 667 CCGCCCACGTGGCAGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGG 740
||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 664 CCGCCCACGTGGCAACAAGGATATGGCCCACAAGGAATGTGGGTGCCAGCAGGACAGGCCATTGGTGGCTATGG 737
Query 741 ACCGCCCCCTGCAGGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTG 814
.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 738 CCCACCCCCTGCGGGCAGAGGAGCCCCGCCCCCGCCCCCACCCTTCACCTCCTACATTGTATCCACACCGCCTG 811
Query 815 GAGGCTTTCCCCCTCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCT 888
|||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 812 GAGGCTTCCCCCCACCACAGGGCTTCCCACAGGGCTATGGCGCCCCACCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGTCCT 885
Query 889 CCACCTCCACCGCCAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCT 962
||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct 886 CCTCCCCCACCCCCTGATCAGTTTGCCCCTCCAGGGGTCCCTCCTCCACCTGCCACCCCAGGGGCTGCCCCGCT 959
Query 963 GGCTTTCCCACCGCCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCT 1036
|||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 960 GGCCTTCCCACCACCTCCGTCTCAGGCTGCCCCAGACATGAGCAAACCCCCAACAGCCCAGCCGGACTTCCCCT 1033
Query 1037 ATGGTCAGTATGCAGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCT 1110
|||||||.||| |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1034 ATGGTCAATAT---GGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGCCAGGGCTTCTCGGACCCCAGCCAGCAGCCG 1104
Query 1111 CCTTCCTACGGGGGTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCA 1184
||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1105 CCCTCCTATGGGGGCCCCTCTGTACCAGGTTCGGGGGGTCCCCCCGCTGGCGGCAGTGGCTTCGGACGCGGGCA 1178
Query 1185 GAACCACAACGTGCAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC 1221
|||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1179 GAACCACAACGTGCAGGGCTTCCATCCCTACCGGCGC 1215