Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02966
- Subject:
- XM_011527909.3
- Aligned Length:
- 1675
- Identities:
- 1088
- Gaps:
- 566
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGAGACCGGCTTCCATTCTATGCGGAGTCCACGGTCTGCTCTGATCTTGCTGTGTGGAGTTGTTGTGTGCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGAAATGCTTGTGACCCTGCGAAGCGCCCTCCTGGCAAGTCCCCTGCAGGTGCGGTGGGTGCCATGCAGGAGGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGCTGAGCTTGGATGGAAGCAGGCCCTCTCTGCGGCAGATGGCGGCTCTCAGGACGCCATGGGTCTGCGGTGTC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCTTACCCACTGGGGGGGCTCGGCAGCCTGAGGAGCTCCCTCTTCCTGATGCAGAGCCCTCACTGCTCACTGCC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 ATGGAGGAGGCAGGAGATCCCGCCGGACCCCGCTTGGAGGGCTGGGCCTGGAGCATGCATGGGTGCGGGGTCAA 370
Query 1 -------------------------------------ATGAACAACTCGGGCGCCGACGAG------------- 24
..|.|| |||.|.| ||||.|.||
Sbjct 371 CGCCTCAGGAGACTTGGAGCTTGGGAGCCCCCTGTTCTGGGAC-ACTTGTG-GCCGTCCAGCTGCTGCCCTGGG 442
Query 25 -ATC----------GGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGACTCTGCGCAGCTAC 87
||| .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 AATCCACACCTGGAAGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGACTCTGCGCAGCTAC 516
Query 88 TTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGTCTCGAGGCTTTGG 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 TTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGTCTCGAGGCTTTGG 590
Query 162 GTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACGCTAGATGGCCGAA 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 GTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACGCTAGATGGCCGAA 664
Query 236 ACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGAAGGATGGCAGAAA 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 ACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGAAGGATGGCAGAAA 738
Query 310 GGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATTGTGGTGAGACAGA 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATTGTGGTGAGACAGA 812
Query 384 GCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCCGAGAAGCAGAGGC 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 GCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCCGAGAAGCAGAGGC 886
Query 458 CCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACATGCATTTTCACGAC 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 CCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACATGCATTTTCACGAC 960
Query 532 ATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGCCGGGACAGCCAGG 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGCCGGGACAGCCAGG 1034
Query 606 TGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCCCCGCCCACGTGGC 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 TGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCCCCGCCCACGTGGC 1108
Query 680 AGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGGACCGCCCCCTGCA 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 AGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGGACCGCCCCCTGCA 1182
Query 754 GGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTGGAGGCTTTCCCCC 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 GGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTGGAGGCTTTCCCCC 1256
Query 828 TCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCTCCACCTCCACCGC 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 TCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCTCCACCTCCACCGC 1330
Query 902 CAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCTGGCTTTCCCACCG 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 CAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCTGGCTTTCCCACCG 1404
Query 976 CCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCTATGGTCAGTATGC 1049
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 CCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCTATGGTCAGTATG- 1477
Query 1050 AGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCTCCTTCCTACGGGG 1123
|||| |||
Sbjct 1478 ---------------------------------------------------------GCCT----------GGG 1484
Query 1124 GTCC----CTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCAGAACCACAA 1193
.||| || |||| |||||||| |||.||||| |||||
Sbjct 1485 TTCCTATTCT-----CCAG-------------CCCCGCCG--GGCTGCGGC-----------------CCACA- 1520
Query 1194 CGTGCAAGGGTTCCACCCCTACCG--ACGC----------------- 1221
|...|.||.||..|.||..| |.||
Sbjct 1521 ----CTTTGTTTACAGTCTTATGGTCAGGCTGAGCAGTGATGTGGCC 1563