Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03082
• Subject: NM_001301855.1
• Aligned Length: 1026
• Identities: 924
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGAAGAAGAATGTTCTGTCGTCTCTCGCAGTTTACGCGGAAGATTCAGAGCCCGAGTCTGATGGCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGGGAAGAAGAATGTTCTGTCGTCTCTCGCAGTTTACGCGGAAGATTCAGAGCCCGAGTCTGATGGCGA  74

Query   75  GGCTGGAATCGAGGCGGTGGGCAGCGCGGCTGAGGAGAAAGGCGGATTGGTATCTGATGCCTATGGGGAGGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTGGAATCGAGGCGGTGGGCAGCGCGGCTGAGGAGAAAGGCGGATTGGTATCTGATGCCTATGGGGAGGATG  148

Query  149  ACTTTTCTCGTCTAGGGGGTGATGAAGATGGTTATGAAGAAGAAGAAGATGAGAACAGTAGACAGTCGGAAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTTTTCTCGTCTAGGGGGTGATGAAGATGGTTATGAAGAAGAAGAAGATGAGAACAGTAGACAGTCGGAAGAT  222

Query  223  GACGATTCAGAGACTGAAAAACCTGAGGCTGATGACCCA-----------------------------------  261
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  223  GACGATTCAGAGACTGAAAAACCTGAGGCTGATGACCCAAAGGAGAAGCTCGGCACAGTGACAGAGGCACCCAG  296

Query  262  -------------------------------------------------------------------AAGGATA  268
                                                                               |||||||
Sbjct  297  GGCTCAGCAAGCTCATGGCCCAGCTTGTTGGACTCAGAGGGCAGAAGAATCACATTCTAAACATGATAAGGATA  370

Query  269  ATACAGAAGCAGAAAAGCGAGACCCCCAGGAACTCGTGGCCTCCTTTTCTGAAAGAGTTCGGAACATGTCGCCT  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATACAGAAGCAGAAAAGCGAGACCCCCAGGAACTCGTGGCCTCCTTTTCTGAAAGAGTTCGGAACATGTCGCCT  444

Query  343  GATGAAATCAAGATCCCGCCAGAACCCCCTGGCAGATGTTCAAATCACTTGCAAGACAAGATCCAGAAGCTTTA  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGAAATCAAGATCCCGCCAGAACCCCCTGGCAGATGTTCAAATCACTTGCAAGACAAGATCCAGAAGCTTTA  518

Query  417  TGAACGAAAGATAAAGGAGGGAATGGATATGAACTACATTATCCAAAGGAAGAAAGAATTTCGGAACCCTAGCA  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAACGAAAGATAAAGGAGGGAATGGATATGAACTACATTATCCAAAGGAAGAAAGAATTTCGGAACCCTAGCA  592

Query  491  TCTACGAGAAGCTGATCCAGTTCTGTGCCATTGACGAGCTTGGCACCAACTACCCAAAGGATATGTTTGATCCC  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTACGAGAAGCTGATCCAGTTCTGTGCCATTGACGAGCTTGGCACCAACTACCCAAAGGATATGTTTGATCCC  666

Query  565  CATGGCTGGTCTGAGGACTCCTACTATGAGGCATTAGCCAAGGCCCAGAAAATTGAGATGGACAAATTGGAAAA  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATGGCTGGTCTGAGGACTCCTACTATGAGGCATTAGCCAAGGCCCAGAAAATTGAGATGGACAAATTGGAAAA  740

Query  639  GGCCAAAAAGGAGCGAACAAAAATTGAGTTTGTGACGGGCACCAAAAAAGGCACCACGACCAACGCCACGTCCA  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCAAAAAGGAGCGAACAAAAATTGAGTTTGTGACGGGCACCAAAAAAGGCACCACGACCAACGCCACGTCCA  814

Query  713  CCACCACTACCACTGCCAGCACAGCTGTTGCAGATGCTCAGAAGAGAAAGAGCAAGTGGGATTCGGCTATCCCA  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCACCACTACCACTGCCAGCACAGCTGTTGCAGATGCTCAGAAGAGAAAGAGCAAGTGGGATTCGGCTATCCCA  888

Query  787  GTGACAACGATAGCCCAGCCCACCATCCTCACCACCACAGCCACCCTGCCAGCTGTTGTCACGGTCACCACCAG  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGACAACGATAGCCCAGCCCACCATCCTCACCACCACAGCCACCCTGCCAGCTGTTGTCACGGTCACCACCAG  962

Query  861  CGCCAGCGGCTCCAAGACCACCGTCATCTCTGCTGTGGGCACCATTGTGAAGAAGGCCAAGCAG  924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCCAGCGGCTCCAAGACCACCGTCATCTCTGCTGTGGGCACCATTGTGAAGAAGGCCAAGCAG  1026