Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03184
• Subject: NM_009182.3
• Aligned Length: 1140
• Identities: 1052
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAGAAACTGCAAAATGGCCCGGGTCGCCAGTGTGCTGGGGCTGGTCATGCTCAGCGTCGCCCTGCTGATTTT  74
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAAATTGCAAAATGGCCCGAGTCGCCAGTGTGCTAGGGCTGGTCATGCTCAGCGTGGCCCTGCTGATTTT  74

Query   75  ATCGCTCATCAGCTACGTGTCCCTGAAAAAGGAGAACATCTTCACCACTCCCAAGTACGCCAGCCCGGGGGCGC  148
            ||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCGCTTATCAGCTACGTGTCTCTGAAAAAGGAGAACATCTTCACCACTCCCAAGTACGCCAGCCCGGGGGCGC  148

Query  149  CCCGAATGTACATGTTCCACGCGGGATTCCGGTCACAATTTGCGCTGAAGTTTCTAGACCCGTCATTCGTGCCC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct  149  CCCGAATGTACATGTTCCACGCGGGATTCCGGTCACAGTTTGCACTGAAGTTTCTAGACCAGTCATTTGTGCCC  222

Query  223  ATTACGAATTCTCTCACCCAGGAACTCCAAGAGAAACCTTCTAAGTGGAAATTTAATCGGACAGCGTTTTTACA  296
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTACGAATTCTCTCACCCATGAACTCCAAGAGAAACCTTCTAAATGGACATTTAATCGGACAGCGTTTTTACA  296

Query  297  TCAAAGGCAAGAAATTCTTCAGCATGTCGATGTAATAAAAAATTTTTCTTTGACCAAGAATAGTGTTCGGATTG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  297  TCAAAGGCAAGAAATTCTTCAGCATGTCGATGTAATAAAAAATTTTTCTTTGACCAAGAGTAGTGTTCGGATTG  370

Query  371  GACAACTGATGCACTATGATTATTCCAGCCATAAATATGTTTTCTCTATTAGCAATAACTTCCGGTCACTTCTT  444
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  GACAACTAATGCATTATGATTATTCCAGCCATAAATATGTCTTCTCGATTAGCAATAACTTCCGGTCCCTGCTC  444

Query  445  CCAGATGTGTCACCCATTATGAACAAGCATTATAATATTTGTGCTGTGGTTGGAAATAGTGGGATCCTGACAGG  518
            |||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||
Sbjct  445  CCAGATGTGTCGCCCATTATGAATAAGCGTTATAATGTTTGTGCTGTGGTTGGAAACAGTGGAATCTTGACAGG  518

Query  519  GAGCCAGTGTGGACAAGAAATAGATAAATCAGATTTTGTTTTCCGTTGCAATTTCGCCCCTACGGAGGCTTTCC  592
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  519  GAGTCAGTGTGGACAAGAAATAGATAAATCAGATTTTGTTTTTCGATGCAATTTTGCCCCGACAGAGGCTTTCC  592

Query  593  AAAGAGATGTTGGAAGAAAAACCAATCTTACCACCTTCAACCCCAGCATCCTGGAAAAATATTACAACAATCTC  666
            |.|.||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  593  ACAAAGATGTTGGAAGGAAAACCAACCTCACAACCTTCAATCCGAGCATCTTAGAGAAATATTACAACAATCTT  666

Query  667  TTGACTATTCAGGACCGTAACAACTTTTTCCTCAGTTTAAAAAAGCTTGACGGGGCCATTCTTTGGATCCCTGC  740
            ||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  TTAACCATTCAGGACCGTAACAACTTCTTCCTCAGTTTAAAAAAGCTTGATGGGGCCATACTTTGGATCCCTGC  740

Query  741  ATTTTTCTTCCACACTTCAGCAACTGTGACCAGGACATTAGTTGACTTTTTTGTTGAACACAGAGGTCAGTTAA  814
            ||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||..||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTTTTCTTCCACACTTCTGCAACTGTAACGAGAACGCTAGTGGATTTTTTTGTTGAGCACAGAGGTCAGTTAA  814

Query  815  AAGTCCAACTGGCTTGGCCGGGAAATATAATGCAACATGTCAACAGGTACTGGAAAAACAAACATTTGTCACCT  888
            |.|||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.
Sbjct  815  AGGTCCAGTTGGCTTGGCCTGGAAATATCATGCAACATGTCAACAGGTACTGGAAAAACAAACACCTGTCACCC  888

Query  889  AAACGGCTGAGCACAGGTATTCTTATGTACACCCTTGCATCAGCAATATGTGAAGAGATCCACTTGTATGGATT  962
            |||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  AAACGACTGAGCACAGGTATCCTAATGTATACTCTTGCATCTGCAATATGTGAAGAGATCCACTTGTACGGTTT  962

Query  963  TTGGCCGTTTGGATTTGACCCCAACACAAGGGAAGATCTTCCATACCATTACTATGACAAAAAAGGAACCAAAT  1036
            .|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGGCCCTTTGGATTTGACCCCAACACCAGGGAGGATCTGCCCTACCACTACTATGACAAAAAAGGAACCAAAT  1036

Query 1037  TTACCACCAAGTGGCAGGAGTCCCACCAGCTGCCTGCTGAGTTTCAGCTGCTGTACCGAATGCATGGGGAAGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTACCACCAAGTGGCAGGAGTCTCACCAGCTGCCTGCTGAGTTTCAGCTGCTCTATCGAATGCATGGGGAAGGG  1110

Query 1111  CTCACCAAGCTGACTCTGTCACACTGTGCC  1140
            |||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCACGAAGCTCACTCTGTCACACTGTGCC  1140