Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03238
• Subject: XM_006501930.2
• Aligned Length: 1234
• Identities: 1065
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGATGAAGAAGAACAATTCCGCCAAGCGGGGACCTCAGGATGGAAACCAGCAGCCTGCACCGCCCGAGAAGGT  74
               ||||||||||.|...||||.||||||                        |.||||..|||||||||||||
Sbjct    1  ---ATGAAGAAGAGCGGCTCCGGCAAGCG------------------------GTCTGCGGCGCCCGAGAAGGT  47

Query   75  CGGCTGGGTCCGGAAATTCTGCGGGAAAGGGATTTTCAGGGAGATTTGGAAAAACCGCTATGTGGTGCTGAAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  CGGCTGGGTCCGGAAATTCTGCGGGAAAGGGATTTTCAGGGAGATTTGGAAAAACCGCTATGTGGTGCTGAAAG  121

Query  149  GGGACCAGCTCTACATCTCTGAGAAGGAGGTAAAAGATGAGAAAAATATTCAAGAGGTATTTGACCTGAGTGAC  222
            |.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  122  GCGACCAGCTCTACGTCTCCGAGAAGGAGGTAAAAGATGAGAAAAACAGTCAGGAGGTGTTTGACCTGAGTGAC  195

Query  223  TATGAGAAGTGTGAAGAGCTCCGGAAGTCCAAGAGCAGGAGCAAGAAAAATCATAGCAAGTTTACTCTTGCCCA  296
            |||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||.
Sbjct  196  TATGAGAAGTGCGAAGAGCTCCGGAAATCCAAGAGCAGGAGCAAGAAAAATCACAGCAAGTTCACCCTGGCCCG  269

Query  297  CTCCAAACAGCCCGGTAACACGGCACCCAACCTGATCTTCCTGGCAGTGAGTCCAGAAGAGAAGGAATCGTGGA  370
            .|.||.||||||.||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  270  GTGCAGACAGCCGGGCACCACGGCACCCAACCTCATCTTCCTGGCCGTGAGTCCTGAAGAGAAGGAGTCATGGA  343

Query  371  TCAATGCCCTCAACTCTGCCATCACCCGAGCCAAGAACCGTATCTTGGATGAGGTCACCGTTGAGGAGGACAGC  444
            ||||.|||||.|..||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  TCAACGCCCTGAGTTCTGCCATTACCAGAGCTAAAAACCGTATCTTGGATGAGGTCACCGTTGAGGAGGACAGC  417

Query  445  TATCTTGCCCATCCCACTCGAGACAGGGCAAAAATCCAGCACTCCCGCCGCCCCCCAACAAGGGGACACCTAAT  518
            |||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.||
Sbjct  418  TATCTTGCCCACCCTACTCGAGACAGAGCAAAAATCCAACACTCCCGCCGTCCTCCAACCCGGGGACACCTCAT  491

Query  519  GGCTGTGGCTTCCACCTCTACCTCGGATGGGATGCTGACCTTGGACTTGATCCAAGAGGAAGACCCTTCCCCTG  592
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  GGCTGTGGCTTCGACCTCTACCTCAGATGGGATGCTAACATTAGACCTGATCCAAGAGGAAGACCCTTCCCCTG  565

Query  593  AGGAACCAACCTCTTGTGCTGAGAGCTTTCGGGTTGACCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCAGGGAGCCGG  666
            ||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.
Sbjct  566  AGGAGCCAGCCTCTTGTGCTGAGAGCTTCCGGGTCGATCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCTGGCAGTCGA  639

Query  667  CGGAGAGCGGACTCAGACCGCATCCAGCCCTC--CGCAGACCGGGCAAGCAGTCTCTCCCGACCTTGGGAAAAA  738
            ||||||||||||||||||.|.|||||||||||  |||||  |||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct  640  CGGAGAGCGGACTCAGACAGGATCCAGCCCTCTTCGCAG--CGGGCAAGCAGCCTTTCTCGGCCTTGGGAAAAA  711

Query  739  ACAGACAAAGGGGCCACCTACACCCCCCAGGCACCCAAGAAGTTGACGCCC----ACAGAGAAAGGCCGCTGCG  808
            .|||||||.||.|||.||||||||||.||.||||..||||||||    |||    ||||||||..||||.||.|
Sbjct  712  CCAGACAAGGGAGCCCCCTACACCCCACAAGCACTGAAGAAGTT----CCCCAGTACAGAGAAGAGCCGATGTG  781

Query  809  CCTCCCTGGAGGAGATCCTATCTCAGCGGGATGCTGCCTCTGCCCGCACCCTCCAGCTGCGGGCTGAGGAACCC  882
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||..|||||.|.||||||.||||.||.||.|..|||||||||.||
Sbjct  782  CCTCCCTGGAGGAGATCCTATCCCAGAGGGACACTGCCCCAGCCCGCCCCCTTCACCTTCAAGCTGAGGAATCC  855

Query  883  CCAACCCCTG-CCCTCCCCAACCCGGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGGAGA  955
            |.|.|||||| ||||.||| |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  856  CTACCCCCTGTCCCTGCCC-AGCCAGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGAAGA  928

Query  956  CTCAGGAGCTTCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGAGATGGGAAGCGAAAGGCCAAGGACCCCCCTCGGTCTCCG  1029
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|.||||||.
Sbjct  929  CTCAGGAGCTGCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGTGACGGCAAGCGGAAGGCCAAGGACCCCCCACAGTCTCCA  1002

Query 1030  CCGGATTCTGAGTCAGAGCAGCTGCTGCTGGAGACGGAACGGCTGCTGGGAGAGGCATCATCGAATTGGAGCCA  1103
            ||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1003  CCCGACTCGGAGTCGGAGCAGCTGCTGCTGGAGACAGAGAGGCTGCTGGGAGAGGCTTCCTCCAACTGGAGCCA  1076

Query 1104  GGCAAAGAGGGTGCTGCAGGAGGTCAGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGACAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT  1177
            |||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  GGCAAAGAGAGTGCTGCAGGAAGTCCGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGGCAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT  1150

Query 1178  CCCACCTCAGACAGACCACCCCGCACAGTCAGTACCGGAAGAGCCTGATG  1227
            |||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1151  CCCACCTCAGACAGACCTCCCAGCACAGTCAATACCGGAAGAGCCTGATG  1200