Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03298
• Subject: NM_001366352.1
• Aligned Length: 786
• Identities: 582
• Gaps: 198

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------ATGGCGCTTGTC------  12
                                                                   .|||.|...|||      
Sbjct   1  ATGACGAAGGTGACGAAAGAGATGACGACACGCCGCCTGCCAGGCCGCGGCCGGCAGTGGAGAGCGTCCGCAAA  74

Query  13  -----CCCTGC-----CAGGTGCTGCGGATGGCAATCCTGCTGTCTTACTGCTCTATCCTGTGTAACTACAAGG  76
                |||.||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCGCGCCCGGCCAGTACAGGTGCTGCGGATGGCAATCCTGCTGTCTTACTGCTCTATCCTGTGTAACTACAAGG  148

Query  77  CCATCGAAATGCCCTCACACCAGACCTACGGAGGGAGCTGGAAATTCCTGACGTTCATTGATCTGGTTATCCAG  150
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CCATCGAAATGCCCTCACACCAGACCTACGGAGGGAGCTGGAAATTCCTGACGTTCATTGATCTGGTTATCCAG  222

Query 151  GCTGTCTTTTTTGGCATCTGTGTGCTGACTGATCTTTCCAGTCTTCTGACTCGAGGAAGTGGGAACCAGGAGCA  224
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCTGTCTTTTTTGGCATCTGTGTGCTGACTGATCTTTCCAGTCTTCTGACTCGAGGAAGTGGGAACCAGGAGCA  296

Query 225  AGAGAGGCAGCTCAAGAAGCTCATCTCTCTCCGGGACTGGATGTTAGCTGTGTTGGCCTTTCCTGTTGGGGTTT  298
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AGAGAGGCAGCTCAAGAAGCTCATCTCTCTCCGGGACTGGATGTTAGCTGTGTTGGCCTTTCCTGTTGGGGTTT  370

Query 299  TTGTTGTAGCAGTGTTCTGGATCATTTATGCCTATGACAGAGAGATGATATACCCGAAGCTGCTGGATAATTTT  372
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TTGTTGTAGCAGTGTTCTGGATCATTTATGCCTATGACAGAGAGATGATATACCCGAAGCTGCTGGATAATTTT  444

Query 373  ATCCCAGGGTGGCTGAATCACGGAATGCACACGACGGTTCTGCCCTTTATATTAATCGAGATGAGGACATCGCA  446
           ||||||||||||||||||||||||                                                  
Sbjct 445  ATCCCAGGGTGGCTGAATCACGGA--------------------------------------------------  468

Query 447  CCATCAGTATCCCAGCAGGAGCAGCGGACTTACCGCCATATGTACCTTCTCTGTTGGCTATATATTATGGGTGT  520
                                                                             ||||||||
Sbjct 469  ------------------------------------------------------------------ATGGGTGT  476

Query 521  GCTGGGTGCATCATGTAACTGGCATGTGGGTGTACCCTTTCCTGGAACACATTGGCCCAGGAGCCAGAATCATC  594
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477  GCTGGGTGCATCATGTAACTGGCATGTGGGTGTACCCTTTCCTGGAACACATTGGCCCAGGAGCCAGAATCATC  550

Query 595  TTCTTTGGGTCTACAACCATCTTAATGAACTTCCTGTACCTGCTGGGAGAAGTTCTGAACAACTATATCTGGGA  668
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551  TTCTTTGGGTCTACAACCATCTTAATGAACTTCCTGTACCTGCTGGGAGAAGTTCTGAACAACTATATCTGGGA  624

Query 669  TACACAGAAAAGTATGGAAGAAGAGAAAGAAAAGCCTAAATTGGAA  714
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct 625  TACACAGAAAAGTATGGAAGAAGAGAAAGAAAAGCC----------  660