Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03298
Subject:
XM_006512812.3
Aligned Length:
793
Identities:
499
Gaps:
242

Alignment

Query   1  ATGGCGCTTGTCCCCTGCCAGGTGCTGCGGATGGCAATCCTGCTGTCTTACTGCTCTATCCTGTGTAACTACAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct   1  ATGGCGCTTGTCCCCTGCCAGGTGCTGCGGGTAGCAATCCTGCTATCCTATTGCTCCATCCTGTGCAACTACAA  74

Query  75  GGCCATCGAAATGCCCTCACACCAGACCTACGGAGGGAGCTGGAAATTCCTGACGTTCATTGATCTGGTTATCC  148
           ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||       
Sbjct  75  GGCCATCGAAATGCCCTCGCATCAGACCTACGGAGGCAGCTGGAAGTTCCTGACCTTCATTGATCTG-------  141

Query 149  AGGCTGTCTTTTTTGGCATCTGTGTGCTGACTGATCTTTCCAGTCTTCTGACTCGAGGAAGTGGGAACCAGGAG  222
                                                                                     
Sbjct 142  --------------------------------------------------------------------------  141

Query 223  CAAGAGAGGCAGCTCAAGAAGCTCATCTCTCTCCGGGACTGGATGTTAGCTGTGTTGGCCTTTCCTGTTGGGGT  296
                                                                                     
Sbjct 142  --------------------------------------------------------------------------  141

Query 297  TTTTGTTGTAGCAGTGTTCTGGATCATTTATGCCTATGACAGAGAGATGATATACCCGAAG-CTGCTGGATAAT  369
            ||||||||.||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||| ||| .||||.||.||.
Sbjct 142  -TTTGTTGTTGCGGTGTTCTGGACCATCTATGCCTATGACAGAGAGATGATATACCC-AAGATTGCTTGACAAC  213

Query 370  TTTATCCCAGGGTGGCTGAATCACGGAATGCACACGACGGTTCTGCCCTTTATATTAATCGAGATGAGGACATC  443
           ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 214  TTTATCCCAGGGTGGCTGAACCATGGAATGCACACAACGGTTTTGCCCTTTATATTGATCGAGATGAGAACATC  287

Query 444  GCACCATCAGTATCCCAGCAGGAGCAGCGGACTTACCGCCATATGTACCTTCTCTGTTGGCTATATATTATGGG  517
           .||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 288  CCACCATCAGTATCCCAGCAGGAGCAGTGGACTCGCCGCCATATGCACCTTCTCCGTGGGCTATATATTATGGG  361

Query 518  TGTGCTGGGTGCATCATGTAACTGGCATGTGGGTGTACCCTTTCCTGGAACACATTGGCCCAGGAGCCAGAATC  591
           ||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||
Sbjct 362  TGTGCTGGATACATCATGTCACCGGCATGTGGGTGTACCCTTTCCTGGAACATATTGGCTCAGGAGCCAGGATC  435

Query 592  ATCTTCTTTGGGTCTACAACCATCTTAATGAACTTCCTGTACCTGCTGGGAGAAGTTCTGAACAACTATATCTG  665
           ||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||.|||||||||
Sbjct 436  ATCTTCTTTGGGTCAACAACCATCCTAATGAATTTCCTGTACCTGCTTGGAGAAGTACTAAACAGCTATATCTG  509

Query 666  GGATACACAGAAAAGTATGGAAG-------------AAGAGA-------------AAG-------AAAAGCCT-  705
           |||||||||||.||    ..|||             ||||.|             |||       |||  ||| 
Sbjct 510  GGATACACAGAGAA----CAAAGGCTCCTTCTTGTCAAGACACCCAATCTTCTCTAAGCTGTGCCAAA--CCTG  577

Query 706  ----AAAT---TGGAA-------------------------------------  714
               ||||   ||.||                                     
Sbjct 578  TCCAAAATCTATGTAAAGATACATTCATGCTGGAAGGTGGGAAGGCGAGAGCT  630