Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03366
Subject:
NM_019780.1
Aligned Length:
558
Identities:
491
Gaps:
12

Alignment

Query   1  ATGGCTGGGCACAGATTGGTGTTGGTATTAGGAGATCTGCACATCCCACACCGGTGCAACAGTTTGCCAGCTAA  74
           |||            ||||||||||||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||||.||.||
Sbjct   1  ATG------------TTGGTGTTGGTACTAGGAGATCTGCACATTCCGCACCGGTGCAACAGCCTGCCGGCCAA  62

Query  75  ATTCAAAAAACTCCTGGTGCCAGGAAAAATTCAGCACATTCTCTGCACAGGAAACCTTTGCACCAAAGAGAGTT  148
           .||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  63  GTTTAAAAAACTCCTGGTGCCAGGAAAAATCCAGCACATCCTCTGCACCGGCAACCTCTGCACCAAGGAGAGCT  136

Query 149  ATGACTATCTCAAGACTCTGGCTGGTGATGTTCATATTGTGAGAGGAGACTTCGATGAGAATCTGAATTATCCA  222
           |.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 137  ACGACTATCTCAAGACTCTGGCTGGCGACGTCCACATCGTGAGAGGAGACTTCGATGAGAATCTGAATTACCCA  210

Query 223  GAACAGAAAGTTGTGACTGTTGGACAGTTCAAAATTGGTCTGATCCATGGACATCAAGTTATTCCATGGGGAGA  296
           |||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 211  GAACAAAAGGTTGTGACTGTGGGCCAGTTCAAGATCGGTCTGATCCACGGACACCAAGTTATTCCGTGGGGAGA  284

Query 297  TATGGCCAGCTTAGCCCTGTTGCAGAGGCAATTTGATGTGGACATTCTTATCTCGGGACACACACACAAATTTG  370
           .|||||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 285  CATGGCTAGCTTAGCCCTGCTGCAGAGGCAGTTTGATGTGGACATTCTTATCTCAGGACACACACACAAATTTG  358

Query 371  AAGCATTTGAGCATGAAAATAAATTCTACATTAATCCAGGTTCTGCCACTGGGGCATATAATGCCTTGGAAACA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 359  AAGCATTTGAGCATGAAAATAAATTCTACATTAACCCAGGTTCTGCCACTGGGGCCTATAATGCCTTGGAAACA  432

Query 445  AACATTATTCCATCATTTGTGTTGATGGATATCCAGGCTTCTACAGTGGTCACCTATGTGTATCAGCTAATTGG  518
           ||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct 433  AACATTATTCCATCGTTTGTGCTGATGGACATCCAGGCTTCTACTGTGGTCACTTACGTCTATCAACTAATTGG  506

Query 519  AGATGATGTGAAAGTAGAACGAATCGAATACAAAAAACCT  558
           ||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||..|.
Sbjct 507  AGATGACGTCAAAGTAGAACGAATTGAGTATAAAAAGTCG  546