Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03398
Subject:
NM_001329606.2
Aligned Length:
1266
Identities:
1266
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGACCATCCTAGTAGGGAAAAGGATGAAAGACAACGGACAACTAAACCCATGGCACAAAGGAGTGCACACTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACCATCCTAGTAGGGAAAAGGATGAAAGACAACGGACAACTAAACCCATGGCACAAAGGAGTGCACACTG  74

Query   75  CTCTCGACCATCTGGCTCCTCATCGTCCTCTGGGGTTCTTATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTCGACCATCTGGCTCCTCATCGTCCTCTGGGGTTCTTATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA  148

Query  149  TAGGATGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCAATCAAACTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGGATGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCAATCAAACTG  222

Query  223  GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAGCTTCATTTAGAGTACAGATTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAGCTTCATTTAGAGTACAGATTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA  296

Query  297  AGGTCTCCCACAGGTGTATTACTTTGGACCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGTCTCCCACAGGTGTATTACTTTGGACCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA  370

Query  371  GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG  444

Query  445  CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG  518

Query  519  TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG  592

Query  593  AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG  666

Query  667  CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG  740

Query  741  CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA  814

Query  815  ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG  888

Query  889  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC  962

Query  963  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGATTCTGGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGATTCTGGTG  1036

Query 1037  CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAATCAGGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAATCAGGTG  1110

Query 1111  GTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATCCCACGGGAGCCCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATCCCACGGGAGCCCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCA  1184

Query 1185  TGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAAGTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACTGCTCAGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAAGTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACTGCTCAGC  1258

Query 1259  GCCACAAG  1266
            ||||||||
Sbjct 1259  GCCACAAG  1266