Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03431
- Subject:
- NR_027632.1
- Aligned Length:
- 3294
- Identities:
- 2464
- Gaps:
- 793
Alignment
Query 1 -------ATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAATTGCTCCACTGAAAATCACAGTAT 67
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 1 AGAAATCATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAGTTGCTTCACTGAAAATGACAGTAT 74
Query 68 CAGAAGACACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAACATTCT 141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGAAGACACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAACATTCT 148
Query 142 TTATATCTGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATAAAGTCCCAGAATCTATTGGTTCTCCAGA 215
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 149 TTATATCTGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATGAAGTCCCAGATTCTATTGGTTCTCCAGA 222
Query 216 TCTTAGTGGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTTCTGTTT 289
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 TCTTTGTGGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACATTCTGTTT 296
Query 290 CTGAAACACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGATATAACTAGCTCTAATATGCAA 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTGAAACACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGACATAACTAGCTCTAATATGCAA 370
Query 364 ATATGTGGATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTCACCGAAGAAGAAAAGTATCAAAAGCTTCTCAGTGAAAATAA 437
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATATGTGGATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTAACCGAAGAAGAAAAGTATC-AAAGCTTCTCAGTGAAAATAA 443
Query 438 AATTAGAGATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTAAGAACTTTAACACAAATTTGTTTCAGTTGG 511
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 AATTAGAGATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTCAGAACTTTAACACAAATTTGTTTCAGTTGG 517
Query 512 GCCATAAATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTGGTACAA 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 GCCATAAATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTGGTACAA 591
Query 586 AGAGAGTGTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACGCAGTAGA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 592 AGAGAGTGTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACTCAGTAGA 665
Query 660 TAAGTCAAGGTCTGAAGCAGCAGTTAGGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATACAGAATTTCTCAGTA 733
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 666 TAAGTCAAGGTCTGAAGCAGCAGTTAAGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATAAAGAATTTCTCAGTA 739
Query 734 TAATTACCTCCAGCCAGGTTGC-TTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAAGGGAA 806
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 TAATTACCTCCAGCCAGGTTGCTTTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAAGGGAA 813
Query 807 TGTAAACATGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCAGCTTG 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TGTAAACATGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCAGCTTG 887
Query 881 ATGGTTTTACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTTGTCCT 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 ATGGTTTTACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTTGTCCT 961
Query 955 AAAACAGAAAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAACTTTT 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AAAACAGAAAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAACTTTT 1035
Query 1029 CAGTTCTGAAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTCCCAAC 1102
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CAGTTCTGAAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACATATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTCCCAAC 1109
Query 1103 TAAATACCTTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAGCTCTA 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TAAATACCTTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAGCTCTA 1183
Query 1177 TCTAGAGTCCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATGGATCG 1250
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 TCTGGAGTCCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATGGATCG 1257
Query 1251 GAGAAATGTGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCAGAAGT 1324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GAGAAATGTGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCAGAAGT 1331
Query 1325 ATAATTGTTTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATTCTGGC 1398
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 ATAATTGTTTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAAC--AAAATTCGGACCAAATTCTGGC 1403
Query 1399 TCTAAAGTGCCTTTAGCAACAGTTACAGTAATTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGGAGGAC 1472
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 TCTAAAGTGCCTTTAGCAACAGTTACAGTAAGTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGGAGGAC 1477
Query 1473 TGCAGCATTTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACAGATGTTGTTATTCATGAGGACC 1546
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 TGCAGCATTTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACGGATGTTGTTATTCATGAGGACC 1551
Query 1547 AATGGATTGGCGAGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTATT 1620
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 AATGGATTGGTGAGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTATT 1625
Query 1621 CAGCCTGAAGAATATTCCAGTGTAGTTAGTGAAGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAACA 1694
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 CAGCCTGAAGAATATTCCAGCGTAGTTAGTGACGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAACA 1699
Query 1695 TTCCTACCTCAGAGATCTTCCTCCGAGGCAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCACC 1768
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 TTCCTACCTCAGAGATCTTCCTCCGAGACAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCACC 1773
Query 1769 TTCAACCTGATGTATTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTCACTATACTGACAGAGGCAGTATACAGT 1842
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 TTCAACCTGATGTGTTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTC-CTATACTGACAGAGGCAGTATACAGT 1846
Query 1843 TATAGAGGACAGAAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTATT 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 TATAGAGGACAGAAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTATT 1920
Query 1917 ATGGGGTCCTGGAGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAAAGGAGTGGTTCTGATTAAAGCCCAGATTT 1990
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1921 ATGGGGTCCTGGAGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAAAGGAGTGGTTCTAATTAAAGCCCAGATTT 1994
Query 1991 CAGAGCTGGCATTTCCTATTACAGCATCTCAGAAGATAGCGCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTTTT 2064
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 CAGAGCTGGCATTTCCTCTTACAGCAGCTCAGAAGATAGCTCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTTTT 2068
Query 2065 TCTTCTCTTCCCAACATCGTATATACTGGTTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGGAT 2138
||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 TCTTCTCTTCCCAACATCATATATACTGGCTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGGAT 2142
Query 2139 CTACAAACAATGTTTTAGCTGCTTGCCATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGCCA 2212
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2143 CTACAAACAATGTTTTAGCTGCTTGCCATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGCCG 2216
Query 2213 TTGATGGAAGACATGATGTTTGTATCCGTGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTGCA 2286
||||||||||||||.||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 TTGATGGAAGACATAATGTTTACATCCGTGTAGAATCAAAACTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTGCA 2290
Query 2287 GACTGCCTCAACAGAGTGATAGTTCCTTCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTCGTGGCAGACCTGTTCCACTC 2360
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 CACTGCCTCAACAGAGTGATAGTTCCTTCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTTGTGGCAGACCTGTTCCACTC 2364
Query 2361 CTTGTTGGCAGTCAGCGCAGAACCTTGTGTATTAAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTATC 2434
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 CTTGTTGGCAGTCAGCGCAGAACCTTGTGTATTGAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTATC 2438
Query 2435 CATTACAACAAGATTTCTCCCTCCTGGATTTTTATCCTGACATTGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTC--- 2505
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439 CATTACAACAAGATTTCTCCCTCCTGGATTTTTATCCTGACATGGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTCTGA 2512
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2513 GGCCAGAGGAAGAAATTGCAGGCATTTCAAGGAAGAAGTACTGAAATGATTTGTCTTTTGAAATAAATGAATGA 2586
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2587 CAGGGCTTTTGCTTTGGATTTTTTATGAAATATATTTTACAAAGAGAATTGCACTAGATAAATTAAAACTTTTT 2660
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2661 TCTAAGAAAATCCTGTGAGGTTTAAAAAGATTGTTTTTGTCTTTTGGTTTCTTCCTTTCTTCTGGAGAAATGAT 2734
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2735 CTACCAGTCAAGGCAATATGTAGCAGATCCCTGGGAATTAAAGGTTTGCCCATTTGTTCACTGTATTTAGTCCC 2808
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2809 TGCTACATTCCAGGCATCGTACTAAGTATGGGGAACCACAGAGAAGACACTCCTTCAGAAACTGCTGCAGTGCT 2882
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2883 TTCGCTTATCCCTACCTAAAAAACCGTCAATGTGAAATCATTTCCTTGATTATAACTATAATGATAATGGATTA 2956
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2957 GTTTATATAAACCTATGTTTAGACAAGTTCAAGACAAGCGTGTCTTTCTATAAAAAGTATTGAAAGTGAAGGAA 3030
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 3031 ATGAGATCATGTTTCAATTTATTAAAGCAGGGAAGAGCGTTCTGTGGTTAGTTCGTGTCTAGGATTTGAGTGCC 3104
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 3105 TTACTGAATGTATTTACCAGCAAACATGTAGCAATCTGTTCTCTCATTGTGATTGTGGAAGAAGCTCATGTAAA 3178
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 3179 ATGATAGTCATTAATGAGGAAGTATGGCGTGGTACTTATTCTGTAAGCTCAGAGTATGCTGAGTGTTAATAGAT 3252
Query 2506 -------------------------------------- 2505
Sbjct 3253 TGTCATATTGCCTGAAAATAAATTCATGATGACATGAA 3290