Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03442
Subject:
NM_026574.3
Aligned Length:
1559
Identities:
1510
Gaps:
3

Alignment

Query    1  MASELGARDDGGCTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDSNPLLPQSGDPLIQVKE  74
            |||||||.|||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct    1  MASELGAGDDGSSTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDNNPLLPESGDPLIQVKE  74

Query   75  EPPNSLLGETSGAGSSGMLNTYSLNGVLQSESKCDKGNLYNFSKLKKSRKWLKSILLSDESSEADSQSE--DDD  146
            |||||||||||||.|||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.
Sbjct   75  EPPNSLLGETSGASSSGLLNPYSLNGVLQSESKSDKGNLYNFSKLKKSRKWLKSILLSDESSEADSQSEDNDDE  148

Query  147  EEELNLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKELQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKA  220
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  149  EEELSLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKELQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEDKKLKA  222

Query  221  KLKKVKKKRRRDEELSSEESPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANK  294
            ||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  KLKKVKKKRRRDEEFSSEESPRHHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANK  296

Query  295  QKASARNLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKRAEKEALEQ  368
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  QKSSARNLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKRAEKEALEQ  370

Query  369  RKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQEDY  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  RKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQEDY  444

Query  443  DSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNG  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  DSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAALRAADKSGSGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNG  518

Query  517  KLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFV  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  KLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFV  592

Query  591  PKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVR  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  PKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVR  666

Query  665  WKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMI  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  WKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMI  740

Query  739  LKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQF  812
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  LKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILTYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQF  814

Query  813  RKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRV-LSPFAPDYIQRSLFHRKGINEE  885
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.| ||||||||||.||||||||||.
Sbjct  815  RKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYEISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLKVLLSPFAPDYIQQSLFHRKGINEG  888

Query  886  SCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSF  959
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|.|||.|||||||||||.|||||
Sbjct  889  SCFSFLRFIDVSPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWAEPDGTSHQSYLRNKDFLLGVDFPLSF  962

Query  960  PNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEY  1033
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  PNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDHVVHQRRSATSSLRCCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEY  1036

Query 1034  ERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALD  1107
            ||.||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ERGVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELATDWLSRRSQFFPEPAGGLLSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALD  1110

Query 1108  VLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGL  1181
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1111  VLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQTRNDIFVFLLSTRAGGL  1184

Query 1182  GINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFK  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFK  1258

Query 1256  PDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPF  1329
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  PDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEESNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPF  1332

Query 1330  VPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASI  1403
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  VPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPPDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASI  1406

Query 1404  TGSVSDTVNGISIQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGSTAKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAA  1477
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGSVSDTVNGISIQEVPAAGRGHSARSRGRPKGSGSTAKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAA  1480

Query 1478  YGYNVSKGISASSPLQTSLVRPAGLADFGPSSASSPLSSPLSKGNNVPGNPKNLHMTSSLAPDSLVRKQGKGTN  1551
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1481  YGYNVSKGISASSPLQTSIVRPAGLADFGPSSASSPLSSPLNKGNNIPGTPKSLHMTSSLASDSLIRKQGKGTN  1554

Query 1552  PSGGR  1556
            |||||
Sbjct 1555  PSGGR  1559