Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03449
• Subject: XM_006522175.3
• Aligned Length: 1354
• Identities: 1063
• Gaps: 182

Alignment

Query    1  ATGCTG--GCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGG----------CGTGCCTATGATTGTACCGGCAGC  62
            ||||.|  .|.|||.|.||.|..|.|||||      .|||          ||||...|||  |||.||  ||||
Sbjct    1  ATGCAGCATCCTCTGACGGGGGCCACCTGC------GTGGCACTCCCCAACGTGGGCATG--TGTCCC--CAGC  64

Query   63  T--------CCTT-ACCTTCCTGGACTGA-TTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCT  126
            |        |||| ||.||..||.|||.| ..|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct   65  TCTCCTGTGCCTTGACTTTTATGTACTTACAGCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCT  138

Query  127  CAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCA  200
            ||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  139  CAGCCTTATGCCTCAGCGCAGTTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCA  212

Query  201  CCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGC  274
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||
Sbjct  213  TCCCGCGCCAGAGTACACCGGCCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGC  286

Query  275  ACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCA  348
            ||||.||||||||   .||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  287  ACTCGGAGCAGAG---TGCTGACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCC  357

Query  349  CCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGT  422
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  358  CCGACCGACGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGT  431

Query  423  CTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATG  496
            .|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  432  GTCCAACATCCCTTTCCGGTTCCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATG  505

Query  497  TTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGAC  570
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  506  TTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGAC  579

Query  571  AGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGT  644
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  580  AGGGCGAGGGAGAAATTGCACGGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGT  653

Query  645  AATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACA  718
            .|||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  654  GATGACAAATAAGAAGACTGTCAACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACA  727

Query  719  GTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCC  792
            |.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  728  GCCCCGACTTCTATGCAGGCACGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCC  801

Query  793  AGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGG  866
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||
Sbjct  802  AGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGG  875

Query  867  GGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGG  940
            |||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  876  GGCTCACCTTCGAGGCCGTGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGG  949

Query  941  CCTACGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGC  1014
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  950  CCTATGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCCAGTGTATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGC  1023

Query 1015  TACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGA  1088
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1024  TATGCCCAGCCCACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGA  1097

Query 1089  AATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGC  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1098  AATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGC  1171

Query 1163  CCCCACCTACGGCGTTGGTGCCA---------------------------------------------------  1185
            |||||||||||||||||||||||                                                   
Sbjct 1172  CCCCACCTACGGCGTTGGTGCCATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGA  1245

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1246  CTTCCAGGCCTCTGCTGTCAGGCAGCTGAGCATCTGCCTGCCTCTCCTCCCCTTTTACAATTCATGTTTAAAGT  1319

Query 1186  ----------------------  1185
                                  
Sbjct 1320  CATAGTCGCCCAGGAGAGAAAG  1341