Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03449
• Subject: XM_006522184.3
• Aligned Length: 1318
• Identities: 1009
• Gaps: 203

Alignment

Query    1  ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATGATTGTACCGGCAGCTCCTTACCTTCC  74
            |||.|||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||.|.||
Sbjct    1  ATGTTGGCGTCGCAAGGAGTCCTTCTGCATTCTTATGGCGTGCCCATGATTGTGCCTGCTGCCCCCTACTTCCC  74

Query   75  TGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGT  148
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||
Sbjct   75  GGGACTGATGCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTCAGCGCAGT  148

Query  149  TTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGGC  222
            |.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGTACACCGGC  222

Query  223  CAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGA  296
            ||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.||||||||   .||.||
Sbjct  223  CAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG---TGCTGA  293

Query  297  CACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAGA  370
            |||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  294  CACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCAGCCCCAGA  367

Query  371  CACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTC  444
            |||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||
Sbjct  368  CACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTTTCCGGTTC  441

Query  445  CGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCG  518
            ||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  CGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCG  515

Query  519  AGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACG  592
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  516  AGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTGCACG  589

Query  593  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTC  666
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  590  GTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGAAGACTGTC  663

Query  667  AACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCAC  740
            |||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  664  AACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTATGCAGGCAC  737

Query  741  GGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTG  814
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTG  811

Query  815  CAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGT  888
            |||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  812  CAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAGGCCGTGGT  885

Query  889  CGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||
Sbjct  886  CGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGTGTTGTTTACCA  959

Query  963  AGAGCCTG---TGTATGGCAATAAATTGCTGCAG--------GGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCC  1025
            .||   ||   |.|||||           |||||        ||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  960  GGA---TGGATTTTATGG-----------TGCAGACATTTATGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCC  1019

Query 1026  TACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTA  1099
            .|||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct 1020  CACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGA--------------------------------------------  1049

Query 1100  ACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACG  1173
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  ---------CAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACG  1114

Query 1174  GCGTTGGTGCCA--------------------------------------------------------------  1185
            ||||||||||||                                                              
Sbjct 1115  GCGTTGGTGCCATGAATGCTTTTGCGCCCTTGACCGATGCCAAGACTAGGAGCCATGCTGATGATGTGGGTCTC  1188

Query 1186  ------------------------------------------------------------  1185
                                                                        
Sbjct 1189  GTTCTTTCTTCATTGCAGGCTAGTATATACCGAGGGGGATACAACCGTTTTGCTCCATAT  1248