Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03576
• Subject: NM_001190786.1
• Aligned Length: 1489
• Identities: 1268
• Gaps: 62

Alignment

Query    1  ATG--GCCACCGACTCGTGGGCC-------CTGGC--GGT---GGACGAGCAGGA-----AGC----GGCTGTC  51
            |||  |    ||.|.||..||||       |||||  |||   ||.|||||..||     |||    |.|   |
Sbjct    1  ATGTTG----CGCCGCGATGGCCGGAGCTGCTGGCCGGGTCGAGGTCGAGCCCGAGCCCGAGCCCAAGCC---C  67

Query   52  AAG-TCG----------------------------ATGACCAATTTGCAGATCAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCA  96
            ||| |||                            .|||.|||.|||||..|.|||||.||||||.|||||.||
Sbjct   68  AAGCTCGGAATCCACTTTCCCTGCCCCTGACTGGTTTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAGGAGAAAATCAAACCA  141

Query   97  GATACCAATGG---TATTATCAAAACCAGTACCACTGCCGAGAAAACAGATGAAGAGGAGAAAGAGGACAGAGC  167
            |||.|||||||   |.||.|.||.||||.|.|.|...|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  142  GATGCCAATGGTGCTGTTGTTAAGACCAATGCAAACACAGAGAAGACAGAGGAAGATGAGAAAGAGGACAGAGC  215

Query  168  TGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAAC  241
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..
Sbjct  216  TGCTCAGTCTTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAATCTTGTGGATAACACCAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGA  289

Query  242  GGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCGTTTGAAGAGCTTCGGCTGAAACCACAGCTTCTCCAGGGA  315
            ||||.||||.||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  290  GGGACCCAAGCTCCCCGCTCTACTCAGTGAAGTCCTTCGAAGAGCTTCGCCTGAAACCACAGCTTCTCCAGGGA  363

Query  316  GTCTATGCCATGGGCTTCAATCGACCCTCCAAGATACAAGAGAACGCATTACCCATGATGCTTGCTGAACCCCC  389
            ||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||||
Sbjct  364  GTCTATGCTATGGGTTTCAACCGCCCTTCCAAAATACAGGAAAATGCATTGCCTTTGATGCTTGCTGAACCCCC  437

Query  390  ACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCACTGGTAAAACAGCTGCCTTTGTCTTAGCCATGCTCAGCCGAG  463
            ||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|||||||||.||
Sbjct  438  ACAGAACTTAATTGCCCAGTCTCAGTCTGGTACGGGTAAAACAGCTGCCTTTGTTTTGGCTGTGCTCAGCCAAG  511

Query  464  TGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTGTGCCTCTCCCCAACATATGAGCTGGCGCTTCAAACAGGAAAA  537
            |.|||||..||.|||..|...||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  512  TAGAGCCTGCAAACAAGTTTGCCCAGTGTCTCTGCCTCTCTCCAACCTATGAGCTTGCTCTTCAAACAGGAAAA  585

Query  538  GTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGAACTGAAGCTTGCCTATGCCGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAG  611
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct  586  GTGATTGAGCAGATGGGCAAGTTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAACAAATTGGAGAG  659

Query  612  AGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGT  685
            .||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||.||||
Sbjct  660  GGGTCAGAAGGTGAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCCGGGACCGTCTTGGACTGGTGCTCCAAGCTGAAGT  733

Query  686  TCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAA  759
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  734  TCATTGACCCCAAGAAGATCAAGGTGTTTGTTCTGGACGAGGCTGATGTGATGATAGCGACTCAGGGCCACCAA  807

Query  760  GATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGA  833
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  808  GACCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGAAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCGGCCACCTTTGAAGA  881

Query  834  CTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCC  907
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||..|.|||||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  882  CTCGGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAGGTGGTCCCAGACCCCAACATCATCAAGCTGAAGCGTGAGGAGGAGACTC  955

Query  908  TGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTAC  981
            ||||.||||||||.||||||||.|||||.||||..|.||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.
Sbjct  956  TGGACACCATCAAACAGTACTACGTCCTCTGCAATAACAGAGAGGAGAAGTTCCAGGCCCTGTGCAATCTGTAT  1029

Query  982  GGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCT  1055
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1030  GGGGCCATCACCATCGCCCAAGCCATGATCTTCTGCCATACCCGCAAAACAGCTAGCTGGCTGGCAGCAGAGCT  1103

Query 1056  CTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAGCAGAGGGCTGCGGTGATTGAGC  1129
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1104  CTCAAAAGAGGGCCACCAGGTGGCCCTGCTGAGTGGAGAGATGATGGTGGAGCAGAGGGCTGCGGTGATCGAGC  1177

Query 1130  GCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTG  1203
            ||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 1178  GCTTCCGAGAAGGCAAAGAGAAGGTTCTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGTGGTATCGATGTTGAACAGGTG  1251

Query 1204  TCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGAT  1277
            ||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1252  TCTGTCGTCATCAATTTTGACCTCCCTGTGGACAAGGACGGGAACCCAGACAATGAGACCTACCTGCACCGCAT  1325

Query 1278  CGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCC  1351
            .||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1326  TGGGCGCACTGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGTCTGGCGGTCAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAATATCC  1399

Query 1352  TGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAA  1425
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400  TCAACAGGATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGACTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAA  1473

Query 1426  ATAGCCAAC  1434
            ||.||||||
Sbjct 1474  ATCGCCAAC  1482