Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03576
• Subject: NM_001257172.2
• Aligned Length: 1457
• Identities: 1269
• Gaps: 121

Alignment

Query    1  ATGGC--------CACCGACTCGT--------GGGCCCT--GGCGGTGGACGAGCAGGAAGCGGCTGTCAAGTC  56
            |||||        | |.|.|.|||        |.|||||  ||||||...|.|.||....||  ||||  .|.|
Sbjct    1  ATGGCTGGGGCTGC-CGGGCGCGTCCAAGATCGCGCCCTGCGGCGGTTTCCCATCACCCTGC--CTGT--GGGC  69

Query   57  GA--TGACCAATTTGCAGATCAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGG---TATTATCAAAACCAGTAC  125
            ||  |||.|||.|||||..|.||||||||||||.|||||.|||||||||||||   |.||.||||.||||.|.|
Sbjct   70  GACTTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGC  143

Query  126  CACTGCCGAGAAAACAGATGAAGAGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAA  199
            ||.|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  CAATGCAGAGAAGACAGATGAAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAA  217

Query  200  GCAACCTTGTTGATAACACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAACGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAG  273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  GCAACCTTGTTGATAACACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAG  291

Query  274  TCGTTTGAAGAGCTTCGGCTGAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCCATGGGCTTCAATCGACCCTCCAA  347
            ||.|||||||||||||||||                                                      
Sbjct  292  TCTTTTGAAGAGCTTCGGCT------------------------------------------------------  311

Query  348  GATACAAGAGAACGCATTACCCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCA  421
                                                   |||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  312  ---------------------------------------CCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTA  346

Query  422  CTGGTAAAACAGCTGCCTTTGTCTTAGCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTG  495
            |||||||||||||||||||.||..|.||||||||.||||.|||.||.||..||.|||.|||||||||||||||.
Sbjct  347  CTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTA  420

Query  496  TGCCTCTCCCCAACATATGAGCTGGCGCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGA  569
            ||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  421  TGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGA  494

Query  570  ACTGAAGCTTGCCTATGCCGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTG  643
            |||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  495  ACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTG  568

Query  644  GCACCCCTGGGACCGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTT  717
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  569  GCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTT  642

Query  718  CTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCC  791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  643  CTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCC  716

Query  792  CAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCC  865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717  CAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCC  790

Query  866  CAGACCCAAATGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGC  939
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  CAGACCCAAACGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGC  864

Query  940  AGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTT  1013
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  865  AGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTT  938

Query 1014  CTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGA  1087
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  939  CTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGA  1012

Query 1088  GTGGGGAGATGATGGTGGAGCAGAGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTG  1161
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013  GTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTG  1086

Query 1162  ACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGA  1235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087  ACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGA  1160

Query 1236  CAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCC  1309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161  CAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCC  1234

Query 1310  TGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAG  1383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235  TGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAG  1308

Query 1384  ATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1434
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309  ATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1359