Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03576
• Subject: NM_001257175.2
• Aligned Length: 1434
• Identities: 959
• Gaps: 450

Alignment

Query    1  ATGGCCACCGACTCGTGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCGGCTGTCAAGTCGATGACCAATTTGCAGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGGTATTATCAAAACCAGTACCACTGCCGAGAAAACAGATGAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAAGTGGAAGTCCTGCAACGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCGTTTGAAGAGCTTCGGCTGAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCCATGGGCTTCAATCGACCCTCCAAGATACAAGAGAACGCATTACCCA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCACTGGTAAAACAGCTGCCTTTGTC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  TTAGCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTGTGCCTCTCCCCAACATATGAGCT  518
                  |||||.||||.|||.||.||..||.|||.|||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ------ATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCT  68

Query  519  GGCGCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGAACTGAAGCTTGCCTATGCCGTTC  592
            .||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct   69  CGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTC  142

Query  593  GAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTGCTGGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  143  GAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGAC  216

Query  667  TGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  TGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGAT  290

Query  741  AGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  AGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTT  364

Query  815  TCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATCAAACTG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  365  TCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAACTG  438

Query  889  AAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCA  962
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  AAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCA  512

Query  963  GGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  GGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTA  586

Query 1037  GTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAGCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  587  GTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAG  660

Query 1111  AGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGG  1184
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  AGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGG  734

Query 1185  CATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  CATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATG  808

Query 1259  AGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  AGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGC  882

Query 1333  AAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  AAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGA  956

Query 1407  TTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  TTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  984