Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03598
• Subject: NM_001354997.3
• Aligned Length: 939
• Identities: 828
• Gaps: 111

Alignment

Query   1  ATGGCATTGCTGGTGGACCGAGTGCGGGGCCACTGGCGAATCGCCGCCGGGCTCCTGTTCAACCTGCTGGTGTC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCATTGCTGGTGGACCGAGTGCGGGGCCACTGGCGAATCGCCGCCGGGCTCCTGTTCAACCTGCTGGTGTC  74

Query  75  CATCTGCATTGTGTTCCTCAACAAATGGATTTATGTGTACCACGGCTTCCCCAACATGAGCCTGACCCTGGTGC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CATCTGCATTGTGTTCCTCAACAAATGGATTTATGTGTACCACGGCTTCCCCAACATGAGCCTGACCCTGGTGC  148

Query 149  ACTTCGTGGTCACCTGGCTGGGCTTGTATATCTGCCAGAAGCTGGACATCTTTGCCCCCAAAAGTCTGCCGCCC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACTTCGTGGTCACCTGGCTGGGCTTGTATATCTGCCAGAAGCTGGACATCTTTGCCCCCAAAAGTCTGCCGCCC  222

Query 223  TCCAGGCTCCTCCTCCTGGCCCTCAGCTTCTGTGGCTTTGTGGTCTTCACTAACCTTTCTCTGCAGAACAACAC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TCCAGGCTCCTCCTCCTGGCCCTCAGCTTCTGTGGCTTTGTGGTCTTCACTAACCTTTCTCTGCAGAACAACAC  296

Query 297  CATAGGCACCTATCAGCTGGCCAAGGCCATGACCACGCCGGTGATCATAGCCATCCAGACCTTCTGCTACCAGA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CATAGGCACCTATCAGCTGGCCAAGGCCATGACCACGCCGGTGATCATAGCCATCCAGACCTTCTGCTACCAGA  370

Query 371  AAACCTTCTCCACCAGAATCCAGCTCACGCTGATTCCTATAACTTTAGGTGTAATCCTAAATTCTTATTACGAT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct 371  AAACCTTCTCCACCAGAATCCAGCTCACGC--------------------------------------------  400

Query 445  GTGAAGTTTAATTTCCTTGGAATGGTGTTTGCTGCTCTTGGTGTTTTAGTTACATCCCTTTATCAAGTGTGGGT  518
                                                                              |||||||
Sbjct 401  -------------------------------------------------------------------TGTGGGT  407

Query 519  AGGAGCCAAACAGCATGAATTACAAGTGAACTCAATGCAGCTGCTGTACTACCAGGCTCCGATGTCATCTGCCA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408  AGGAGCCAAACAGCATGAATTACAAGTGAACTCAATGCAGCTGCTGTACTACCAGGCTCCGATGTCATCTGCCA  481

Query 593  TGTTGCTGGTTGCTGTGCCCTTCTTTGAGCCAGTGTTTGGAGAAGGAGGAATATTTGGTCCCTGGTCAGTTTCT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482  TGTTGCTGGTTGCTGTGCCCTTCTTTGAGCCAGTGTTTGGAGAAGGAGGAATATTTGGTCCCTGGTCAGTTTCT  555

Query 667  GCTTTGCTTATGGTGCTGCTATCTGGAGTAATAGCTTTCATGGTGAACTTATCAATTTATTGGATCATTGGGAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 556  GCTTTGCTTATGGTGCTGCTATCTGGAGTAATAGCTTTCATGGTGAACTTATCAATTTATTGGATCATTGGGAA  629

Query 741  CACTTCACCTGTCACCTATAACATGTTCGGACACTTCAAGTTCTGCATTACTTTATTCGGAGGATATGTTTTAT  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 630  CACTTCACCTGTCACCTATAACATGTTCGGACACTTCAAGTTCTGCATTACTTTATTCGGAGGATATGTTTTAT  703

Query 815  TTAAGGATCCACTGTCCATTAATCAGGCCCTTGGCATTTTATGTACATTATTTGGCATTCTCGCCTATACCCAC  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 704  TTAAGGATCCACTGTCCATTAATCAGGCCCTTGGCATTTTATGTACATTATTTGGCATTCTCGCCTATACCCAC  777

Query 889  TTTAAGCTCAGTGAACAGGAAGGAAGTAGGAGTAAACTGGCACAACGTCCT  939
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778  TTTAAGCTCAGTGAACAGGAAGGAAGTAGGAGTAAACTGGCACAACGTCCT  828