Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03652
• Subject: XM_017011021.1
• Aligned Length: 2772
• Identities: 2772
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCTCGATCACGACAACCCCCCCTTGTGACCGGCATCTCTCCAAATGAAGGGATACCATGGACGAAGGTCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTCGATCACGACAACCCCCCCTTGTGACCGGCATCTCTCCAAATGAAGGGATACCATGGACGAAGGTCAC  74

Query   75  AATCAGGGGAGAAAATCTGGGGACTGGCCCCACCGACCTCATAGGCTTGACCATTTGTGGACATAATTGCCTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AATCAGGGGAGAAAATCTGGGGACTGGCCCCACCGACCTCATAGGCTTGACCATTTGTGGACATAATTGCCTCC  148

Query  149  TGACGGCAGAATGGATGTCTGCAAGTAAAATAGTATGTCGAGTGGGACAAGCCAAAAATGACAAAGGAGACATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGACGGCAGAATGGATGTCTGCAAGTAAAATAGTATGTCGAGTGGGACAAGCCAAAAATGACAAAGGAGACATT  222

Query  223  ATTGTCACCACTAAGTCAGGTGGCAGAGGAACCTCAACAGTCTCTTTCAAGCTACTCAAACCTGAGAAAATAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGTCACCACTAAGTCAGGTGGCAGAGGAACCTCAACAGTCTCTTTCAAGCTACTCAAACCTGAGAAAATAGG  296

Query  297  CATTTTGGATCAGTCTGCTGTGTGGGTTGATGAAATGAATTATTATGATATGCGCACTGACAGGAACAAAGGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATTTTGGATCAGTCTGCTGTGTGGGTTGATGAAATGAATTATTATGATATGCGCACTGACAGGAACAAAGGAA  370

Query  371  TTCCGCCCTTGTCCTTACGTCCTGCTAACCCGCTTGGCATTGAGATTGAAAAAAGTAAATTTTCGCAGAAGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCCGCCCTTGTCCTTACGTCCTGCTAACCCGCTTGGCATTGAGATTGAAAAAAGTAAATTTTCGCAGAAGGAC  444

Query  445  TTAGAAATGCTATTCCATGGAATGAGTGCTGATTTTACAAGTGAGAATTTCTCAGCAGCCTGGTATCTTATAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTAGAAATGCTATTCCATGGAATGAGTGCTGATTTTACAAGTGAGAATTTCTCAGCAGCCTGGTATCTTATAGA  518

Query  519  GAATCACTCAAACACCAGTTTTGAGCAGCTCAAAATGGCAGTCACCAACCTAAAGAGACAGGCTAACAAGAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAATCACTCAAACACCAGTTTTGAGCAGCTCAAAATGGCAGTCACCAACCTAAAGAGACAGGCTAACAAGAAGA  592

Query  593  GTGAGGGCAGCCTGGCCTATGTGAAAGGCGGTCTCAGTACATTCTTCGAAGCACAGGATGCCCTCTCAGCCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGAGGGCAGCCTGGCCTATGTGAAAGGCGGTCTCAGTACATTCTTCGAAGCACAGGATGCCCTCTCAGCCATC  666

Query  667  CATCAAAAACTAGAAGCAGATGGAACGGAAAAAGTAGAAGGATCCATGACGCAGAAACTGGAGAATGTTCTGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATCAAAAACTAGAAGCAGATGGAACGGAAAAAGTAGAAGGATCCATGACGCAGAAACTGGAGAATGTTCTGAA  740

Query  741  CAGAGCAAGTAATACTGCAGACACATTGTTTCAAGAAGTATTAGGTCGGAAAGACAAGGCAGATTCCACTAGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGAGCAAGTAATACTGCAGACACATTGTTTCAAGAAGTATTAGGTCGGAAAGACAAGGCAGATTCCACTAGAA  814

Query  815  ATGCACTCAATGTGCTTCAGCGATTTAAGTTTCTTTTCAACCTTCCTCTAAATATTGAAAGGAATATTCAAAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGCACTCAATGTGCTTCAGCGATTTAAGTTTCTTTTCAACCTTCCTCTAAATATTGAAAGGAATATTCAAAAG  888

Query  889  GGTGATTATGATGTGGTTATTAATGATTATGAAAAGGCCAAGTCACTTTTTGGGAAAACGGAGGTGCAAGTTTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGATTATGATGTGGTTATTAATGATTATGAAAAGGCCAAGTCACTTTTTGGGAAAACGGAGGTGCAAGTTTT  962

Query  963  CAAGAAATATTATGCTGAAGTAGAAACAAGGATTGAAGCTTTAAGAGAATTACTTCTGGATAAATTGCTTGAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGAAATATTATGCTGAAGTAGAAACAAGGATTGAAGCTTTAAGAGAATTACTTCTGGATAAATTGCTTGAGA  1036

Query 1037  CACCATCAACTTTACATGACCAAAAACGTTACATAAGGTACCTGTCTGACCTTCATGCGTCTGGTGACCCTGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACCATCAACTTTACATGACCAAAAACGTTACATAAGGTACCTGTCTGACCTTCATGCGTCTGGTGACCCTGCT  1110

Query 1111  TGGCAATGCATTGGAGCCCAACACAAGTGGATCCTTCAGCTCATGCACAGTTGCAAAGAGGGCTACGTGAAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGGCAATGCATTGGAGCCCAACACAAGTGGATCCTTCAGCTCATGCACAGTTGCAAAGAGGGCTACGTGAAAGA  1184

Query 1185  TCTGAAAGGTAACCCAGGCCTGCACAGTCCCATGTTGGATCTTGATAATGATACACGTCCCTCAGTGTTGGGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTGAAAGGTAACCCAGGCCTGCACAGTCCCATGTTGGATCTTGATAATGATACACGTCCCTCAGTGTTGGGCC  1258

Query 1259  ATCTCAGTCAGACAGCGTCCCTGAAGAGGGGCAGCAGCTTTCAGTCTGGTCGAGACGACACGTGGAGATACAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCTCAGTCAGACAGCGTCCCTGAAGAGGGGCAGCAGCTTTCAGTCTGGTCGAGACGACACGTGGAGATACAAA  1332

Query 1333  ACTCCCCACAGGGTGGCCTTTGTTGAAAAATTGACAAAACTCGTCTTGAGCCAGCTGCCTAACTTCTGGAAACT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTCCCCACAGGGTGGCCTTTGTTGAAAAATTGACAAAACTCGTCTTGAGCCAGCTGCCTAACTTCTGGAAACT  1406

Query 1407  CTGGATCTCCTACGTTAATGGAAGCCTCTTCAGTGAGACTGCTGAGAAGTCAGGCCAGATTGAAAGATCAAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGGATCTCCTACGTTAATGGAAGCCTCTTCAGTGAGACTGCTGAGAAGTCAGGCCAGATTGAAAGATCAAAGA  1480

Query 1481  ATGTAAGGCAAAGACAAAATGATTTTAAGAAAATGATTCAGGAAGTAATGCACTCCCTGGTGAAGCTTACCCGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGTAAGGCAAAGACAAAATGATTTTAAGAAAATGATTCAGGAAGTAATGCACTCCCTGGTGAAGCTTACCCGC  1554

Query 1555  GGAGCCCTGCTTCCCCTCAGCATCCGGGATGGGGAAGCCAAGCAGTACGGAGGCTGGGAGGTGAAGTGCGAGCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGAGCCCTGCTTCCCCTCAGCATCCGGGATGGGGAAGCCAAGCAGTACGGAGGCTGGGAGGTGAAGTGCGAGCT  1628

Query 1629  CTCCGGACAGTGGCTCGCTCACGCCATCCAGACTGTAAGACTTACTCATGAATCGTTGACTGCCCTTGAAATTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTCCGGACAGTGGCTCGCTCACGCCATCCAGACTGTAAGACTTACTCATGAATCGTTGACTGCCCTTGAAATTC  1702

Query 1703  CTAATGACCTGTTACAGACTATCCAGGATCTCATCTTGGATCTCCGAGTACGTTGCGTAATGGCCACGTTGCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTAATGACCTGTTACAGACTATCCAGGATCTCATCTTGGATCTCCGAGTACGTTGCGTAATGGCCACGTTGCAG  1776

Query 1777  CACACGGCGGAAGAAATAAAGAGATTAGCTGAAAAAGAAGACTGGATTGTTGACAATGAAGGACTGACTTCTCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CACACGGCGGAAGAAATAAAGAGATTAGCTGAAAAAGAAGACTGGATTGTTGACAATGAAGGACTGACTTCTCT  1850

Query 1851  ACCATGTCAGTTTGAACAGTGCATCGTGTGTTCTCTGCAGTCACTGAAGGGGGTTCTGGAGTGCAAGCCGGGAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACCATGTCAGTTTGAACAGTGCATCGTGTGTTCTCTGCAGTCACTGAAGGGGGTTCTGGAGTGCAAGCCGGGAG  1924

Query 1925  AGGCCAGTGTCTTCCAACAACCTAAAACACAGGAGGAGGTTTGCCAGCTAAGCATCAATATAATGCAGGTTTTT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGCCAGTGTCTTCCAACAACCTAAAACACAGGAGGAGGTTTGCCAGCTAAGCATCAATATAATGCAGGTTTTT  1998

Query 1999  ATATACTGTCTGGAACAGTTGAGCACCAAGCCTGATGCAGATATAGATACTACACATCTCTCTGTTGATGTTTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATATACTGTCTGGAACAGTTGAGCACCAAGCCTGATGCAGATATAGATACTACACATCTCTCTGTTGATGTTTC  2072

Query 2073  TTCCCCTGACTTGTTTGGAAGTATCCATGAAGACTTCAGCTTGACCTCAGAACAGCGCCTTTTGATAGTCCTAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTCCCCTGACTTGTTTGGAAGTATCCATGAAGACTTCAGCTTGACCTCAGAACAGCGCCTTTTGATAGTCCTAA  2146

Query 2147  GTAATTGCTGCTATCTAGAACGTCACACCTTCCTAAATATCGCAGAACATTTTGAAAAGCACAACTTCCAGGGA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GTAATTGCTGCTATCTAGAACGTCACACCTTCCTAAATATCGCAGAACATTTTGAAAAGCACAACTTCCAGGGA  2220

Query 2221  ATAGAAAAAATCACACAGGTTAGCATGGCCTCATTGAAAGAACTAGATCAAAGACTCTTTGAAAATTACATCGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATAGAAAAAATCACACAGGTTAGCATGGCCTCATTGAAAGAACTAGATCAAAGACTCTTTGAAAATTACATCGA  2294

Query 2295  GTTGAAAGCAGATCCCATCGTTGGCTCCTTAGAACCTGGAATTTATGCAGGATATTTTGATTGGAAGGACTGCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GTTGAAAGCAGATCCCATCGTTGGCTCCTTAGAACCTGGAATTTATGCAGGATATTTTGATTGGAAGGACTGCC  2368

Query 2369  TGCCTCCAACAGGTGTCAGAAACTATTTAAAAGAAGCACTGGTGAATATAATTGCCGTGCATGCAGAGGTGTTC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGCCTCCAACAGGTGTCAGAAACTATTTAAAAGAAGCACTGGTGAATATAATTGCCGTGCATGCAGAGGTGTTC  2442

Query 2443  ACCATTTCCAAAGAACTGGTCCCTCGGGTACTATCCAAGGTGATAGAAGCAGTTTCTGAAGAGCTCAGTCGACT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACCATTTCCAAAGAACTGGTCCCTCGGGTACTATCCAAGGTGATAGAAGCAGTTTCTGAAGAGCTCAGTCGACT  2516

Query 2517  GATGCAGTGTGTTTCATCCTTCAGCAAAAATGGAGCTTTACAGGCGAGACTTGAAATCTGTGCTTTGAGGGACA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GATGCAGTGTGTTTCATCCTTCAGCAAAAATGGAGCTTTACAGGCGAGACTTGAAATCTGTGCTTTGAGGGACA  2590

Query 2591  CTGTGGCTGTTTACCTGACACCCGAAAGCAAGTCAAGTTTTAAGCAGGCTTTGGAAGCCCTGCCCCAGCTTTCC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CTGTGGCTGTTTACCTGACACCCGAAAGCAAGTCAAGTTTTAAGCAGGCTTTGGAAGCCCTGCCCCAGCTTTCC  2664

Query 2665  AGTGGAGCAGATAAAAAGTTACTGGAAGAGCTCCTGAACAAGTTCAAGAGTAGCATGCACTTGCAGCTCACCTG  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AGTGGAGCAGATAAAAAGTTACTGGAAGAGCTCCTGAACAAGTTCAAGAGTAGCATGCACTTGCAGCTCACCTG  2738

Query 2739  TTTCCAAGCAGCTTCTTCAACCATGATGAAAACA  2772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TTTCCAAGCAGCTTCTTCAACCATGATGAAAACA  2772