Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03660
• Subject: XM_024450351.1
• Aligned Length: 2136
• Identities: 1683
• Gaps: 453

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCTGCCAGCAGTCGCGGTACCACAGCTTCTCGTCCGCGTCGAGATTACAGCCACGGCCTTCAGGAGTGAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CATAGACGAATCCTTTCTCACAGAAGACAAGAGCACCCAGAATCGCAAGCTTCTTCAGAAACGAAGGACGCTGA  148

Query    1  --------------ATGGGTGGGCACCTGTCCCCATGGCCCACATACACCAGTGGCCAGACCATTTTGCAAAAT  60
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGGTCAGTTCTCCATGGGTGGGCACCTGTCCCCATGGCCCACATACACCAGTGGCCAGACCATTTTGCAAAAT  222

Query   61  CGAAAACCCTGTTCAGATGACTACCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCC  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAAAACCCTGTTCAGATGACTACCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCC  296

Query  135  CCAGTACTTGGAGGAACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCC  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGTACTTGGAGGAACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCC  370

Query  209  AGGAACTAAGGCTGCAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGACTTCAAAACGTACAAGCCATTA  282
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct  371  AGGAACTAAGGCTGC-----------------------------------------------------------  385

Query  283  CTATCCTCCATCAAGAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCT  356
                                                                                      
Sbjct  386  --------------------------------------------------------------------------  385

Query  357  GAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATG  430
                                                                                      
Sbjct  386  --------------------------------------------------------------------------  385

Query  431  AAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCA  504
                                                                                      
Sbjct  386  --------------------------------------------------------------------------  385

Query  505  TTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGC  578
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  386  ----------AGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGC  449

Query  579  CTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAG  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  450  CTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAG  523

Query  653  GCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAG  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  524  GCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAG  597

Query  727  ATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGAC  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598  ATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGAC  671

Query  801  CAACAAGGATCTTCAGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCATGAGATCC  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  672  CAACAAGGATCTTCAGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCATGAGATCC  745

Query  875  TCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCAGCGCACT  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  746  TCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCAGCGCACT  819

Query  949  TCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGC  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  820  TCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGC  893

Query 1023  TGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAG  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894  TGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAG  967

Query 1097  ACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAG  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  968  ACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAG  1041

Query 1171  AAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGA  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042  AAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGA  1115

Query 1245  GACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATA  1318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116  GACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATA  1189

Query 1319  CTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAG  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190  CTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAG  1263

Query 1393  CGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAG  1466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264  CGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAG  1337

Query 1467  TCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAG  1540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338  TCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAG  1411

Query 1541  AGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGC  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412  AGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGC  1485

Query 1615  TCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGA  1688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1486  TCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGA  1559

Query 1689  GAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGC  1762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560  GAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGC  1633

Query 1763  TGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTC  1836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634  TGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTC  1707

Query 1837  CAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGC  1910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1708  CAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGC  1781

Query 1911  CCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782  CCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1845