Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03712
• Subject: NM_001304418.2
• Aligned Length: 1680
• Identities: 1680
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCAGAGCACAGCAGAAATTCAGATCAAGAAGAACTTCTCGATGAGGAGATTAATGAAGATGAAATCTTGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAGAGCACAGCAGAAATTCAGATCAAGAAGAACTTCTCGATGAGGAGATTAATGAAGATGAAATCTTGGC  74

Query   75  CAACTTGTCTGCTGAAGAACTGAAAGAACTGCAGTCGGAAATGGAAGTCATGGCCCCTGACCCCAGCCTTCCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAACTTGTCTGCTGAAGAACTGAAAGAACTGCAGTCGGAAATGGAAGTCATGGCCCCTGACCCCAGCCTTCCCG  148

Query  149  TGGGAATGATTCAGAAAGATCAAACTGACAAGCCACCGACAGGAAACTTCAATCATAAATCTCTTGTTGATTAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGAATGATTCAGAAAGATCAAACTGACAAGCCACCGACAGGAAACTTCAATCATAAATCTCTTGTTGATTAT  222

Query  223  ATGTATTGGGAAAAGGCATCCAGGCGCATGCTGGAAGAGGAACGAGTTCCTGTCACCTTTGTGAAATCCGAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGTATTGGGAAAAGGCATCCAGGCGCATGCTGGAAGAGGAACGAGTTCCTGTCACCTTTGTGAAATCCGAGGA  296

Query  297  AAAGACTCAAGAAGAGCATGAAGAAATAGAAAAACGTAATAAAAATATGGCCCAGTATTTAAAAGAAAAGCTCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAGACTCAAGAAGAGCATGAAGAAATAGAAAAACGTAATAAAAATATGGCCCAGTATTTAAAAGAAAAGCTCA  370

Query  371  ATAATGAAATAGTTGCAAATAAAAGAGAATCAAAGGGCAGCAGCAATATCCAAGAAACAGATGAAGAAGATGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAATGAAATAGTTGCAAATAAAAGAGAATCAAAGGGCAGCAGCAATATCCAAGAAACAGATGAAGAAGATGAA  444

Query  445  GAAGAAGAAGATGATGATGATGACGACGAAGGAGAAGATGATGGTGAAGAGAGTGAAGAAACGAACAGAGAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGAAGAAGATGATGATGATGACGACGAAGGAGAAGATGATGGTGAAGAGAGTGAAGAAACGAACAGAGAAGA  518

Query  519  GGAAGGCAAAGCAAAGGAACAAATTAGAAATTGTGAGAACAACTGCCAGCAGGTAACTGACAAAGCATTCAAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAAGGCAAAGCAAAGGAACAAATTAGAAATTGTGAGAACAACTGCCAGCAGGTAACTGACAAAGCATTCAAAG  592

Query  593  AACAGAGAGACAGACCAGAGGCCCAAGAACAAAGTGAGAAAAAAATATCGAAATTAGATCCTAAGAAGTTAGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACAGAGAGACAGACCAGAGGCCCAAGAACAAAGTGAGAAAAAAATATCGAAATTAGATCCTAAGAAGTTAGCT  666

Query  667  CTAGACACCAGCTTTTTGAAGGTAAGTACAAGGCCTTCAGGAAACCAGACAGACCTGGATGGGAGCTTGAGGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTAGACACCAGCTTTTTGAAGGTAAGTACAAGGCCTTCAGGAAACCAGACAGACCTGGATGGGAGCTTGAGGAG  740

Query  741  AGTTAGGAAAAATGATCCTGACATGAAGGAACTCAACCTGAACAACATTGAAAACATCCCCAAAGAAATGTTAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTTAGGAAAAATGATCCTGACATGAAGGAACTCAACCTGAACAACATTGAAAACATCCCCAAAGAAATGTTAC  814

Query  815  TGGACTTTGTCAATGCAATGAAGAAAAACAAGCACATCAAAACATTCAGTTTAGCCAATGTGGGTGCAGATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGACTTTGTCAATGCAATGAAGAAAAACAAGCACATCAAAACATTCAGTTTAGCCAATGTGGGTGCAGATGAG  888

Query  889  AATGTAGCATTTGCCTTGGCTAACATGTTGCGTGAAAATAGAAGCATCACCACTCTCAACATCGAGTCCAATTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATGTAGCATTTGCCTTGGCTAACATGTTGCGTGAAAATAGAAGCATCACCACTCTCAACATCGAGTCCAATTT  962

Query  963  CATCACAGGTAAAGGGATTGTGGCCATCATGAGGTGTCTCCAGTTTAATGAGACGCTAACTGAGCTTCGGTTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCACAGGTAAAGGGATTGTGGCCATCATGAGGTGTCTCCAGTTTAATGAGACGCTAACTGAGCTTCGGTTTC  1036

Query 1037  ACAATCAGAGGCACATGTTGGGTCACCATGCTGAAATGGAAATAGCCAGGCTTTTGAAGGCAAACAACACTCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAATCAGAGGCACATGTTGGGTCACCATGCTGAAATGGAAATAGCCAGGCTTTTGAAGGCAAACAACACTCTC  1110

Query 1111  CTGAAGATGGGCTACCATTTTGAGCTTCCGGGTCCCAGAATGGTGGTCACTAATCTGCTCACCAGGAATCAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGAAGATGGGCTACCATTTTGAGCTTCCGGGTCCCAGAATGGTGGTCACTAATCTGCTCACCAGGAATCAGGA  1184

Query 1185  TAAACAAAGGCAGAAACGACAGGAAGAGCAAAAACAGCAGCAACTCAAGGAACAGAAGAAGCTGATAGCCATGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAAACAAAGGCAGAAACGACAGGAAGAGCAAAAACAGCAGCAACTCAAGGAACAGAAGAAGCTGATAGCCATGT  1258

Query 1259  TAGAGAATGGGTTGGGGCTGCCCCCTGGGATGTGGGAGCTGTTGGGAGGACCCAAGCCAGATTCCAGAATGCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAGAGAATGGGTTGGGGCTGCCCCCTGGGATGTGGGAGCTGTTGGGAGGACCCAAGCCAGATTCCAGAATGCAG  1332

Query 1333  GAATTCTTCCAGCCACCGCCACCTCGGCCTCCCAACCCCCAAAATGTCCCCTTTAGTCAACGCAGTGAAATGAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAATTCTTCCAGCCACCGCCACCTCGGCCTCCCAACCCCCAAAATGTCCCCTTTAGTCAACGCAGTGAAATGAT  1406

Query 1407  GAAAAAGCCATCGCAGGCCCCGAAGTACAGGACAGACCCTGACTCCTTCCGGGTGGTGAAGCTGAAGAGAATCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAAAAGCCATCGCAGGCCCCGAAGTACAGGACAGACCCTGACTCCTTCCGGGTGGTGAAGCTGAAGAGAATCC  1480

Query 1481  AGCGCAAATCTCGGATGCCGGAAGCCAGAGAACCACCCGAGAAAACCAACCTCAAAGATGTCATCAAAACGCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCGCAAATCTCGGATGCCGGAAGCCAGAGAACCACCCGAGAAAACCAACCTCAAAGATGTCATCAAAACGCTC  1554

Query 1555  AAGCCAGTGCCGAGAAACAGGCCACCCCCATTGGTGGAAATCACTCCCAGAGATCAGCTGCTAAACGACATTCG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGCCAGTGCCGAGAAACAGGCCACCCCCATTGGTGGAAATCACTCCCAGAGATCAGCTGCTAAACGACATTCG  1628

Query 1629  TCACAGCAGTGTCGCCTATCTTAAACCTGTGCAACTGCCAAAAGAACTGGCG  1680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCACAGCAGTGTCGCCTATCTTAAACCTGTGCAACTGCCAAAAGAACTGGCG  1680