Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03753
• Subject: NM_001289710.1
• Aligned Length: 1185
• Identities: 1011
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACTCGGGCGGTGCAGTTCACAGAGGA  74

Query   75  GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA  148
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGTTTGGCCAGGCTGAGAAGACGGAGCTTGACGCCCACTTTGAAAACCTCCTAGCTCGGGCAGACAGCACCA  148

Query  149  AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG  222
            ||||||||||||||..||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  AGAACTGGACAGAGCGGATCCTGAGGCAGACCGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCTCGAGTGGAGGAG  222

Query  223  TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCTATATGAGAAGCTGGACAGAAAGGTGCCCTCGAGAGTCACCAATGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296

Query  297  AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC  370
            .||.||.|||||.||||||||.||.|.|||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  297  GGAGGCAGCCAGCGAGCTGGGCCCCAGCACTCCCTACGGGAAGACGCTGATCAAGGTGTCAGAAGCTGAGAAGC  370

Query  371  AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG  444
            ..||.|||||.||.|||.|||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct  371  GCCTCGGAGCAGCAGAGCGGGATTTCATTCACACTGCCTCCCTCAGCTTCCTCACACCCCTGCGGAACTTCCTA  444

Query  445  GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA  518
            ||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  445  GAGGGGGACTGGAAAACGATTTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTGCAGAACCGGCGTCTTGACCTGGATGCCTGCAA  518

Query  519  AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACGACGGTGCCTGACTTTCAGGAGACTAGACCTC  592
            |||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||                                 
Sbjct  519  AGCCCGGCTAAAGAAGGCCAAGGCAGCCGAAGCCAAAGCCA---------------------------------  559

Query  593  GTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCGCTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAGCAGGAGCTCCGC  666
                                          ||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  560  ------------------------------CGCTTTGGAACGATGAAGTCGACAAGGCTGAGCAGGAGCTTCGA  603

Query  667  GTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAGTAGCACTCACGT  740
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct  604  GTGGCGCAGACAGAGTTTGACCGGCAGGCAGAAGTGACCCGTCTCCTGCTGGAGGGGATCAGCAGTACTCATGT  677

Query  741  GAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCTACCGCCACATGC  814
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  678  GAACCACCTTCGCTGCCTCCATGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTATGCACAGTGCTACCGCCACATGC  751

Query  815  TGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAGATTTCCCGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCCGCCTCCCCACCCCTG  888
            ||||..|||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  752  TGGATCTGCAGAAACAGCTAGGCAGATTTCCAGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCTGCCTCCCCACCCCTG  825

Query  889  AGCAGCACCTCACCCACCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCCCTCTGTGGCCAGCCTGGCCCCTCCAGG  962
            ||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||..|||.|||...|.||||||||||||.
Sbjct  826  AGCAGCACCTCACCTACCACCACTGCGGCCACCATGCCTGTGGTACCTACTGGGGCTGTCTTGGCCCCTCCAGA  899

Query  963  GGAGGCCTCGCTCTGCCTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGACCCGCAAAGCTCGGGTGCTCTATGACT  1036
            .|||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  900  AGAGGCAGCCCTCTGCCTGGAGGAGGTGGCTCCCCCAGCCAGTGGGACTCGAAAGGCCCGGGTGCTCTACGACT  973

Query 1037  ACGAGGCAGCCGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCTACAGCCTGCCTGGCATG  1110
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  974  ACGAGGCAGCTGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCTACAGCCTGCCAGGCATG  1047

Query 1111  GACCCTGACTGGCTCATTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTCCCTGTCACCTACTTGGAACTGCTCAG  1184
            ||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1048  GATCCCGACTGGCTCATTGGTGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTTCCTGTCACCTACCTGGAACTTCTCAG  1121

Query 1185  C  1185
            |
Sbjct 1122  C  1122