Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03753
• Subject: NM_001346806.1
• Aligned Length: 1212
• Identities: 1073
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACTCGGGCGGTGCAGTTCACAGAGGA  74

Query   75  GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA  148
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGTTTGGCCAGGCTGAGAAGACGGAGCTTGACGCCCACTTTGAAAACCTCCTAGCTCGGGCAGACAGCACCA  148

Query  149  AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG  222
            ||||||||||||||..||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  AGAACTGGACAGAGCGGATCCTGAGGCAGACCGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCTCGAGTGGAGGAG  222

Query  223  TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCTATATGAGAAGCTGGACAGAAAGGTGCCCTCGAGAGTCACCAATGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296

Query  297  AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC  370
            .||.||.|||||.||||||||.||.|.|||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  297  GGAGGCAGCCAGCGAGCTGGGCCCCAGCACTCCCTACGGGAAGACGCTGATCAAGGTGTCAGAAGCTGAGAAGC  370

Query  371  AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG  444
            ..||.|||||.||.|||.|||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct  371  GCCTCGGAGCAGCAGAGCGGGATTTCATTCACACTGCCTCCCTCAGCTTCCTCACACCCCTGCGGAACTTCCTA  444

Query  445  GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA  518
            ||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  445  GAGGGGGACTGGAAAACGATTTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTGCAGAACCGGCGTCTTGACCTGGATGCCTGCAA  518

Query  519  AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACG------------ACGGTGCCTGACTTTCAGG  580
            |||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||            |||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCCGGCTAAAGAAGGCCAAGGCAGCCGAAGCCAAAGCCACGTGTGAGGGCGATACGGTGCCTGACTTTCAGG  592

Query  581  AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCGCTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAG  654
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  593  AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTATCGGCCAGCGCCTCCGCGCTTTGGAACGATGAAGTCGACAAGGCTGAG  666

Query  655  CAGGAGCTCCGCGTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAG  728
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct  667  CAGGAGCTTCGAGTGGCGCAGACAGAGTTTGACCGGCAGGCAGAAGTGACCCGTCTCCTGCTGGAGGGGATCAG  740

Query  729  TAGCACTCACGTGAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCT  802
            .||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  CAGTACTCATGTGAACCACCTTCGCTGCCTCCATGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTATGCACAGTGCT  814

Query  803  ACCGCCACATGCTGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAG---------------ATTTCCCGGCACCTTCGTGGGC  861
            ||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||               ||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  ACCGCCACATGCTGGATCTGCAGAAACAGCTAGGCAGCTCCCAGGGTGCCATATTTCCAGGCACCTTCGTGGGC  888

Query  862  ACCACAGAGCCCGCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCCACCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCC  935
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  889  ACCACAGAGCCTGCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCTACCACCACTGCGGCCACCATGCCTGTGGTACC  962

Query  936  CTCTGTGGCCAGCCTGGCCCCTCCAGGGGAGGCCTCGCTCTGCCTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGA  1009
            ..|||.|||...|.||||||||||||..|||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  963  TACTGGGGCTGTCTTGGCCCCTCCAGAAGAGGCAGCCCTCTGCCTGGAGGAGGTGGCTCCCCCAGCCAGTGGGA  1036

Query 1010  CCCGCAAAGCTCGGGTGCTCTATGACTACGAGGCAGCCGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTC  1083
            |.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCGAAAGGCCCGGGTGCTCTACGACTACGAGGCAGCTGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTC  1110

Query 1084  ATCACTGTCTACAGCCTGCCTGGCATGGACCCTGACTGGCTCATTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGT  1157
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCACTGTCTACAGCCTGCCAGGCATGGATCCCGACTGGCTCATTGGTGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGT  1184

Query 1158  CCCTGTCACCTACTTGGAACTGCTCAGC  1185
            .||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 1185  TCCTGTCACCTACCTGGAACTTCTCAGC  1212