Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03753
Subject:
XM_006497937.1
Aligned Length:
1197
Identities:
1073
Gaps:
12

Alignment

Query    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACTCGGGCGGTGCAGTTCACAGAGGA  74

Query   75  GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA  148
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGTTTGGCCAGGCTGAGAAGACGGAGCTTGACGCCCACTTTGAAAACCTCCTAGCTCGGGCAGACAGCACCA  148

Query  149  AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG  222
            ||||||||||||||..||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  AGAACTGGACAGAGCGGATCCTGAGGCAGACCGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCTCGAGTGGAGGAG  222

Query  223  TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCTATATGAGAAGCTGGACAGAAAGGTGCCCTCGAGAGTCACCAATGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296

Query  297  AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC  370
            .||.||.|||||.||||||||.||.|.|||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  297  GGAGGCAGCCAGCGAGCTGGGCCCCAGCACTCCCTACGGGAAGACGCTGATCAAGGTGTCAGAAGCTGAGAAGC  370

Query  371  AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG  444
            ..||.|||||.||.|||.|||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct  371  GCCTCGGAGCAGCAGAGCGGGATTTCATTCACACTGCCTCCCTCAGCTTCCTCACACCCCTGCGGAACTTCCTA  444

Query  445  GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA  518
            ||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  445  GAGGGGGACTGGAAAACGATTTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTGCAGAACCGGCGTCTTGACCTGGATGCCTGCAA  518

Query  519  AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACG------------ACGGTGCCTGACTTTCAGG  580
            |||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||            |||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCCGGCTAAAGAAGGCCAAGGCAGCCGAAGCCAAAGCCACGTGTGAGGGCGATACGGTGCCTGACTTTCAGG  592

Query  581  AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCGCTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAG  654
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  593  AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTATCGGCCAGCGCCTCCGCGCTTTGGAACGATGAAGTCGACAAGGCTGAG  666

Query  655  CAGGAGCTCCGCGTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAG  728
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct  667  CAGGAGCTTCGAGTGGCGCAGACAGAGTTTGACCGGCAGGCAGAAGTGACCCGTCTCCTGCTGGAGGGGATCAG  740

Query  729  TAGCACTCACGTGAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCT  802
            .||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  CAGTACTCATGTGAACCACCTTCGCTGCCTCCATGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTATGCACAGTGCT  814

Query  803  ACCGCCACATGCTGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAGATTTCCCGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCCGCC  876
            ||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  ACCGCCACATGCTGGATCTGCAGAAACAGCTAGGCAGATTTCCAGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCTGCC  888

Query  877  TCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCCACCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCCCTCTGTGGCCAGCCT  950
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||..|||.|||...|.|
Sbjct  889  TCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCTACCACCACTGCGGCCACCATGCCTGTGGTACCTACTGGGGCTGTCTT  962

Query  951  GGCCCCTCCAGGGGAGGCCTCGCTCTGCCTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGACCCGCAAAGCTCGGG  1024
            |||||||||||..|||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||
Sbjct  963  GGCCCCTCCAGAAGAGGCAGCCCTCTGCCTGGAGGAGGTGGCTCCCCCAGCCAGTGGGACTCGAAAGGCCCGGG  1036

Query 1025  TGCTCTATGACTACGAGGCAGCCGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCTACAGC  1098
            |||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCTCTACGACTACGAGGCAGCTGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCTACAGC  1110

Query 1099  CTGCCTGGCATGGACCCTGACTGGCTCATTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTCCCTGTCACCTACTT  1172
            |||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 1111  CTGCCAGGCATGGATCCCGACTGGCTCATTGGTGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTTCCTGTCACCTACCT  1184

Query 1173  GGAACTGCTCAGC  1185
            ||||||.||||||
Sbjct 1185  GGAACTTCTCAGC  1197