Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03753
- Subject:
- XM_006497938.1
- Aligned Length:
- 1202
- Identities:
- 1019
- Gaps:
- 70
Alignment
Query 1 ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACTCGGGCGGTGCAGTTCACAGAGGA 74
Query 75 GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA 148
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGTTTGGCCAGGCTGAGAAGACGGAGCTTGACGCCCACTTTGAAAACCTCCTAGCTCGGGCAGACAGCACCA 148
Query 149 AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG 222
||||||||||||||..||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 AGAACTGGACAGAGCGGATCCTGAGGCAGACCGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCTCGAGTGGAGGAG 222
Query 223 TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC 296
|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCCTATATGAGAAGCTGGACAGAAAGGTGCCCTCGAGAGTCACCAATGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC 296
Query 297 AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC 370
.||.||.|||||.||||||||.||.|.|||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 297 GGAGGCAGCCAGCGAGCTGGGCCCCAGCACTCCCTACGGGAAGACGCTGATCAAGGTGTCAGAAGCTGAGAAGC 370
Query 371 AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG 444
..||.|||||.||.|||.|||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct 371 GCCTCGGAGCAGCAGAGCGGGATTTCATTCACACTGCCTCCCTCAGCTTCCTCACACCCCTGCGGAACTTCCTA 444
Query 445 GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA 518
||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 445 GAGGGGGACTGGAAAACGATTTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTGCAGAACCGGCGTCTTGACCTGGATGCCTGCAA 518
Query 519 AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACGACGGTGCCTGACTTTCAGGAGACTAGACCTC 592
|||..||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||| |.|.|||
Sbjct 519 AGCCCGGCTAAAGAAGGCCAAGGCAGCCGAAGCCAAAGCCACG------------TGTGAGG------------ 568
Query 593 GTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCG--CTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAGCAGGAGCTCC 664
||| ||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 569 -----------------------------GCGATCTTTGGAACGATGAAGTCGACAAGGCTGAGCAGGAGCTTC 613
Query 665 GCGTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAGTAGCACTCAC 738
|.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 614 GAGTGGCGCAGACAGAGTTTGACCGGCAGGCAGAAGTGACCCGTCTCCTGCTGGAGGGGATCAGCAGTACTCAT 687
Query 739 GTGAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCTACCGCCACAT 812
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 688 GTGAACCACCTTCGCTGCCTCCATGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTATGCACAGTGCTACCGCCACAT 761
Query 813 GCTGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAG---------------ATTTCCCGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGC 871
||||||..|||||||.|||||.||||| ||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 GCTGGATCTGCAGAAACAGCTAGGCAGCTCCCAGGGTGCCATATTTCCAGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGC 835
Query 872 CCGCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCCACCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCCCTCTGTGGCC 945
|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||..|||.|||.
Sbjct 836 CTGCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCTACCACCACTGCGGCCACCATGCCTGTGGTACCTACTGGGGCT 909
Query 946 AGCCTGGCCCCTCCAGGGGAGGCCTCGCTCTGCCTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGACCCGCAAAGC 1019
..|.||||||||||||..|||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 910 GTCTTGGCCCCTCCAGAAGAGGCAGCCCTCTGCCTGGAGGAGGTGGCTCCCCCAGCCAGTGGGACTCGAAAGGC 983
Query 1020 TCGGGTGCTCTATGACTACGAGGCAGCCGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCT 1093
.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 984 CCGGGTGCTCTACGACTACGAGGCAGCTGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCT 1057
Query 1094 ACAGCCTGCCTGGCATGGACCCTGACTGGCTCATTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTCCCTGTCACC 1167
||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1058 ACAGCCTGCCAGGCATGGATCCCGACTGGCTCATTGGTGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTTCCTGTCACC 1131
Query 1168 TACTTGGAACTGCTCAGC 1185
|||.|||||||.||||||
Sbjct 1132 TACCTGGAACTTCTCAGC 1149