Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03753
• Subject: XM_006497939.1
• Aligned Length: 1200
• Identities: 1011
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACTCGGGCGGTGCAGTTCACAGAGGA  74

Query   75  GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA  148
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGTTTGGCCAGGCTGAGAAGACGGAGCTTGACGCCCACTTTGAAAACCTCCTAGCTCGGGCAGACAGCACCA  148

Query  149  AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG  222
            ||||||||||||||..||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  AGAACTGGACAGAGCGGATCCTGAGGCAGACCGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCTCGAGTGGAGGAG  222

Query  223  TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCTATATGAGAAGCTGGACAGAAAGGTGCCCTCGAGAGTCACCAATGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296

Query  297  AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC  370
            .||.||.|||||.||||||||.||.|.|||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  297  GGAGGCAGCCAGCGAGCTGGGCCCCAGCACTCCCTACGGGAAGACGCTGATCAAGGTGTCAGAAGCTGAGAAGC  370

Query  371  AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG  444
            ..||.|||||.||.|||.|||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct  371  GCCTCGGAGCAGCAGAGCGGGATTTCATTCACACTGCCTCCCTCAGCTTCCTCACACCCCTGCGGAACTTCCTA  444

Query  445  GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA  518
            ||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  445  GAGGGGGACTGGAAAACGATTTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTGCAGAACCGGCGTCTTGACCTGGATGCCTGCAA  518

Query  519  AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACGACGGTGCCTGACTTTCAGGAGACTAGACCTC  592
            |||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||                                 
Sbjct  519  AGCCCGGCTAAAGAAGGCCAAGGCAGCCGAAGCCAAAGCCA---------------------------------  559

Query  593  GTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCGCTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAGCAGGAGCTCCGC  666
                                          ||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  560  ------------------------------CGCTTTGGAACGATGAAGTCGACAAGGCTGAGCAGGAGCTTCGA  603

Query  667  GTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAGTAGCACTCACGT  740
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct  604  GTGGCGCAGACAGAGTTTGACCGGCAGGCAGAAGTGACCCGTCTCCTGCTGGAGGGGATCAGCAGTACTCATGT  677

Query  741  GAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCTACCGCCACATGC  814
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  678  GAACCACCTTCGCTGCCTCCATGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTATGCACAGTGCTACCGCCACATGC  751

Query  815  TGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAG---------------ATTTCCCGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCC  873
            ||||..|||||||.|||||.|||||               ||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  752  TGGATCTGCAGAAACAGCTAGGCAGCTCCCAGGGTGCCATATTTCCAGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCT  825

Query  874  GCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCCACCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCCCTCTGTGGCCAG  947
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||..|||.|||...
Sbjct  826  GCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCTACCACCACTGCGGCCACCATGCCTGTGGTACCTACTGGGGCTGT  899

Query  948  CCTGGCCCCTCCAGGGGAGGCCTCGCTCTGCCTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGACCCGCAAAGCTC  1021
            |.||||||||||||..|||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|
Sbjct  900  CTTGGCCCCTCCAGAAGAGGCAGCCCTCTGCCTGGAGGAGGTGGCTCCCCCAGCCAGTGGGACTCGAAAGGCCC  973

Query 1022  GGGTGCTCTATGACTACGAGGCAGCCGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCTAC  1095
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  974  GGGTGCTCTACGACTACGAGGCAGCTGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCTAC  1047

Query 1096  AGCCTGCCTGGCATGGACCCTGACTGGCTCATTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTCCCTGTCACCTA  1169
            ||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1048  AGCCTGCCAGGCATGGATCCCGACTGGCTCATTGGTGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTTCCTGTCACCTA  1121

Query 1170  CTTGGAACTGCTCAGC  1185
            |.|||||||.||||||
Sbjct 1122  CCTGGAACTTCTCAGC  1137