Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03753
- Subject:
- XM_011239077.1
- Aligned Length:
- 1258
- Identities:
- 942
- Gaps:
- 212
Alignment
Query 1 ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACTCGGGCGGTGCAGTTCACAGAGGA 74
Query 75 GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA 148
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGTTTGGCCAGGCTGAGAAGACGGAGCTTGACGCCCACTTTGAAAACCTCCTAGCTCGGGCAGACAGCACCA 148
Query 149 AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG 222
||||||||||||||..||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 AGAACTGGACAGAGCGGATCCTGAGGCAGACCGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCTCGAGTGGAGGAG 222
Query 223 TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC 296
|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCCTATATGAGAAGCTGGACAGAAAGGTGCCCTCGAGAGTCACCAATGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC 296
Query 297 AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC 370
.||.||.|||||.||||||||.||.|.|||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 297 GGAGGCAGCCAGCGAGCTGGGCCCCAGCACTCCCTACGGGAAGACGCTGATCAAGGTGTCAGAAGCTGAGAAGC 370
Query 371 AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG 444
..||.|||||.||.|||.|||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct 371 GCCTCGGAGCAGCAGAGCGGGATTTCATTCACACTGCCTCCCTCAGCTTCCTCACACCCCTGCGGAACTTCCTA 444
Query 445 GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA 518
||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 445 GAGGGGGACTGGAAAACGATTTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTGCAGAACCGGCGTCTTGACCTGGATGCCTGCAA 518
Query 519 AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACG------------ACGGTGCCTGACTTTCAGG 580
|||..||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCCCGGCTAAAGAAGGCCAAGGCAGCCGAAGCCAAAGCCACGTGTGAGGGCGATACGGTGCCTGACTTTCAGG 592
Query 581 AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCGCTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAG 654
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 593 AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTATCGGCCAGCGCCTCCGCGCTTTGGAACGATGAAGTCGACAAGGCTGAG 666
Query 655 CAGGAGCTCCGCGTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAG 728
||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 667 CAGGAGCTTCGAGTGGCGCAGACAGAGTTTGACCGGCAGGCAGAAGTGACCCGTCTCCTGCTGGAGGGGATCAG 740
Query 729 TAGCACTCACGTGAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCT 802
.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 741 CAGTACTCATGTGAACCACCTTCGCTGCCTCCATGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTATGCACAGTGCT 814
Query 803 ACCGCCACATGCTGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAG------------------------------------- 839
||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||
Sbjct 815 ACCGCCACATGCTGGATCTGCAGAAACAGCTAGGCAGGTGTGGCTGGACCCAGGTCTCTGAGGCCCCCTATCTC 888
Query 840 ------------------------ATTTCCCGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCCGCCTCCCCACCCCTGA 889
||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 889 CCAGACCCACTCCCAGGGTGCCATATTTCCAGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCTGCCTCCCCACCCCTGA 962
Query 890 GCAGCACCTCACCCACCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCCCTCTGTGGCCAGCCTGGCCCCTCCAGGG 963
|||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||..|||.|||...|.||||||||||||..
Sbjct 963 GCAGCACCTCACCTACCACCACTGCGGCCACCATGCCTGTGGTACCTACTGGGGCTGTCTTGGCCCCTCCAGAA 1036
Query 964 GAGGCCTCGCTCTGCCTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGACCCGCAAAGCTCGGGTGCTCTATGACTA 1037
|||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1037 GAGGCAGCCCTCTGCCTGGAGGAGGTGGCTCCCCCAGCCAGTGGGACTCGAAAGGCCCGGGTGCTCTACGACTA 1110
Query 1038 CGAGGCAGCCGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCTACAGCCTGCCTGGCATGG 1111
|||||||||
Sbjct 1111 CGAGGCAGC----------------------------------------------------------------- 1119
Query 1112 ACCCTGACTGGCTCATTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTCCCTGTCACCTACTTGGAACTGCTCAGC 1185
Sbjct 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119