Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03781
- Subject:
- NM_001346155.1
- Aligned Length:
- 1656
- Identities:
- 1527
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 ATGAAGAAAAACAGAGAAAGATTCTGCAATAGAGAGAGAGAATTTGTATATAAATTTAAAGTAGGAAGTCAGTG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGAAAAACAGAGAAAGATTCTGCAATAGAGAGAGAGAATTTGTATATAAATTTAAAGTAGGAAGTCAGTG 74
Query 75 CTTAGAACTGAGAGTGCCACTCAAATTTCCTGTTCAAGAGAATGCCAGTCATTTGCATGGACGTCTGATGCTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTTAGAACTGAGAGTGCCACTCAAATTTCCTGTTCAAGAGAATGCCAGTCATTTGCATGGACGTCTGATGCTGC 148
Query 149 TGCACAGTTTACCGTGCTTTATAGAAAAAGACTTAAAAGAAGCTCTGACTCAGTTTATAGAAGAAGAATCCCTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCACAGTTTACCGTGCTTTATAGAAAAAGACTTAAAAGAAGCTCTGACTCAGTTTATAGAAGAAGAATCCCTC 222
Query 223 AGCGATTATGATAGAGATGCTGAAGCATCCCTGGCAGCTGTGAAATCAGGTGAAGTAGATTTACATCAGCTGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGCGATTATGATAGAGATGCTGAAGCATCCCTGGCAGCTGTGAAATCAGGTGAAGTAGATTTACATCAGCTGGC 296
Query 297 GAGTACATGGGCCAAAGCTTATGCTGAGACCACGTTAGAGCATGCAAGGCCTGAAGAACCCAGCTGGGATGAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGTACATGGGCCAAAGCTTATGCTGAGACCACGTTAGAGCATGCAAGGCCTGAAGAACCCAGCTGGGATGAAG 370
Query 371 ATTTTGCAGATGTGTACCATGACTTAATTCATTCTCCTGCCTCTGAAACTCTCTTAAATTTGGAACATAATTAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTTTGCAGATGTGTACCATGACTTAATTCATTCTCCTGCCTCTGAAACTCTCTTAAATTTGGAACATAATTAC 444
Query 445 TTTGTTAGTATCTCAGAACTGATTGGTGAAAGAGATGTGGAGCTGAAAAAATTACGAGAGAGACAAGGTATTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGTTAGTATCTCAGAACTGATTGGTGAAAGAGATGTGGAGCTGAAAAAATTACGAGAGAGACAAGGTATTGA 518
Query 519 AATGGAAAAAGTCATGCAGGAATTGGGAAAATCACTGACAGATCAAGATGTAAATTCACTGGCTGCTCAGCATT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATGGAAAAAGTCATGCAGGAATTGGGAAAATCACTGACAGATCAAGATGTAAATTCACTGGCTGCTCAGCATT 592
Query 593 TTGAATCCCAGCAAGACCTAGAAAATAAATGGTCGAATGAATTAAAACAATCAACTGCCATCCAAAAACAAGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGAATCCCAGCAAGACCTAGAAAATAAATGGTCGAATGAATTAAAACAATCAACTGCCATCCAAAAACAAGAG 666
Query 667 TATCAAGAATGGGTAATAAAACTTCACCAAGACCTAAAAAACCCCAACAACAGCTCCCTTAGTGAGGAAATTAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATCAAGAATGGGTAATAAAACTTCACCAAGACCTAAAAAACCCCAACAACAGCTCCCTTAGTGAGGAAATTAA 740
Query 741 AGTTCAGCCAAGTCAGTTCAGAGAATCTGTAGAAGCAATTGGAAGGATTTATGAGGAACAGAGAAAGTTAGAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTTCAGCCAAGTCAGTTCAGAGAATCTGTAGAAGCAATTGGAAGGATTTATGAGGAACAGAGAAAGTTAGAAG 814
Query 815 AAAGTTTTACCATTCACTTAGGAGCCCAGTTGAAGACCATGCATAATTTGAGATTGCTGAGAGCAGATATGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAAGTTTTACCATTCACTTAGGAGCCCAGTTGAAGACCATGCATAATTTGAGATTGCTGAGAGCAGATATGCTG 888
Query 889 GACTTCTGTAAGCATAAAAGAAATCATCGAAGTGGTGTGAAACTTCATCGGCTCCAAACAGCTCTGTCACTTTA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACTTCTGTAAGCATAAAAGAAATCATCGAAGTGGTGTGAAACTTCATCGGCTCCAAACAGCTCTGTCACTTTA 962
Query 963 TTCTACATCTCTCTGTGGCCTGGTTTTACTAGTAGATAATCGAATTAATTCATATAGTGGTATTAAAAGAGATT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTCTACATCTCTCTGTGGCCTGGTTTTACTAGTAGATAATCGAATTAATTCATATAGTGGTATTAAAAGA---- 1032
Query 1037 TTGCCACAGTTTGCCAAGAATGCACTGACTTCCATTTCCCCCGAATTGAAGAGCAATTAGAAGTTGTCCAACAG 1110
Sbjct 1033 -------------------------------------------------------------------------- 1032
Query 1111 GTGGTACTTTATGCTAGAACCCAGCGCAGGAGTAAATTGAAAGAATCACTTGATTCTGGAAACCAAAATGGAGG 1184
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 ---------------------------------------------------GATTCTGGAAACCAAAATGGAGG 1055
Query 1185 AAATGATGATAAGACTAAGAATGCTGAGAGGAACTATTTAAATGTTTTACCTGGGGAATTTTATATTACACGGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056 AAATGATGATAAGACTAAGAATGCTGAGAGGAACTATTTAAATGTTTTACCTGGGGAATTTTATATTACACGGC 1129
Query 1259 ATTCTAATCTCTCAGAAATCCATGTTGCTTTCCATCTCTGTGTGGATGACCATGTGAAATCGGGAAACATCACT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 ATTCTAATCTCTCAGAAATCCATGTTGCTTTCCATCTCTGTGTGGATGACCATGTGAAATCGGGAAACATCACT 1203
Query 1333 GCTCGTGATCCTGCCATTATGGGACTCCGAAATATACTCAAAGTTTGCTGTACCCATGACATCACAACAATAAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204 GCTCGTGATCCTGCCATTATGGGACTCCGAAATATACTCAAAGTTTGCTGTACCCATGACATCACAACAATAAG 1277
Query 1407 CATTCCTCTCTTGCTGGTACATGATATGTCAGAGGAAATGACTATACCCTGGTGCTTAAGGAGAGCGGAACTTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278 CATTCCTCTCTTGCTGGTACATGATATGTCAGAGGAAATGACTATACCCTGGTGCTTAAGGAGAGCGGAACTTG 1351
Query 1481 TGTTCAAGTGTGTCAAAGGTTTCATGATGGAAATGGCTTCATGGGATGGAGGAATTTCTAGGACAGTGCAATTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352 TGTTCAAGTGTGTCAAAGGTTTCATGATGGAAATGGCTTCATGGGATGGAGGAATTTCTAGGACAGTGCAATTT 1425
Query 1555 CTAGTACCACAGAGTATTTCTGAAGAAATGTTTTATCAACTTAGTAACATGCTTCCCCAGATCTTCCGAGTATC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 CTAGTACCACAGAGTATTTCTGAAGAAATGTTTTATCAACTTAGTAACATGCTTCCCCAGATCTTCCGAGTATC 1499
Query 1629 ATCAACACTCACTCTGACATCCAAGCAC 1656
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 ATCAACACTCACTCTGACATCCAAGCAC 1527