Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03781
- Subject:
- XM_006718992.3
- Aligned Length:
- 1657
- Identities:
- 1253
- Gaps:
- 401
Alignment
Query 1 ATGAAGAAAAACAGAGAAAGATTCTGCAATAGAGAGAGAGAATTTGTATATAAATTTAAAGTAGGAAGTCAGTG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGAAAAACAGAGAAAGATTCTGCAATAGAGAGAGAGAATTTGTATATAAATTTAAAGTAGGAAGTCAGTG 74
Query 75 CTTAGAACTGAGAGTGCCACTCAAATTTCCTGTTCAAGAGAATGCCAGTCATTTGCATGGACGTCTGATGCTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTTAGAACTGAGAGTGCCACTCAAATTTCCTGTTCAAGAGAATGCCAGTCATTTGCATGGACGTCTGATGCTGC 148
Query 149 TGCACAGTTTACCGTGCTTTATAGAAAAAGACTTAAAAGAAGCTCTGACTCAGTTTATAGAAGAAGAATCCCTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCACAGTTTACCGTGCTTTATAGAAAAAGACTTAAAAGAAGCTCTGACTCAGTTTATAGAAGAAGAATCCCTC 222
Query 223 AGCGATTATGATAGAGATGCTGAAGCATCCCTGGCAGCTGTGAAATCAGGTGAAGTAGATTTACATCAGCTGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGCGATTATGATAGAGATGCTGAAGCATCCCTGGCAGCTGTGAAATCAGGTGAAGTAGATTTACATCAGCTGGC 296
Query 297 GAGTACATGGGCCAAAGCTTATGCTGAGACCACGTTAGAGCATGCAAGGCCTGAAGAACCCAGCTGGGATGAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGTACATGGGCCAAAGCTTATGCTGAGACCACGTTAGAGCATGCAAGGCCTGAAGAACCCAGCTGGGATGAAG 370
Query 371 ATTTTGCAGATGTGTACCATGACTTAATTCATTCTCCTGCCTCTGAAACTCTCTTAAATTTGGAACATAATTAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTTTGCAGATGTGTACCATGACTTAATTCATTCTCCTGCCTCTGAAACTCTCTTAAATTTGGAACATAATTAC 444
Query 445 TTTGTTAGTATCTCAGAACTGATTGGTGAAAGAGATGTGGAGCTGAAAAAATTACGAGAGAGACAAGGTATTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGTTAGTATCTCAGAACTGATTGGTGAAAGAGATGTGGAGCTGAAAAAATTACGAGAGAGACAAGGTATTGA 518
Query 519 AATGGAAAAAGTCATGCAGGAATTGGGAAAATCACTGACAGATCAAGATGTAAATTCACTGGCTGCTCAGCATT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATGGAAAAAGTCATGCAGGAATTGGGAAAATCACTGACAGATCAAGATGTAAATTCACTGGCTGCTCAGCATT 592
Query 593 TTGAATCCCAGCAAGACCTAGAAAATAAATGGTCGAATGAATTAAAACAATCAACTGCCATCCAAAAACAAGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGAATCCCAGCAAGACCTAGAAAATAAATGGTCGAATGAATTAAAACAATCAACTGCCATCCAAAAACAAGAG 666
Query 667 TATCAAGAATGGGTAATAAAACTTCACCAAGACCTAAAAAACCCCAACAACAGCTCCCTTAGTGAGGAAATTAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATCAAGAATGGGTAATAAAACTTCACCAAGACCTAAAAAACCCCAACAACAGCTCCCTTAGTGAGGAAATTAA 740
Query 741 AGTTCAGCCAAGTCAGTTCAGAGAATCTGTAGAAGCAATTGGAAGGATTTATGAGGAACAGAGAAAGTTAGAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTTCAGCCAAGTCAGTTCAGAGAATCTGTAGAAGCAATTGGAAGGATTTATGAGGAACAGAGAAAGTTAGAAG 814
Query 815 AAAGTTTTACCATTCACTTAGGAGCCCAGTTGAAGACCATGCATAATTTGAGATTGCTGAGAGCAGATATGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAAGTTTTACCATTCACTTAGGAGCCCAGTTGAAGACCATGCATAATTTGAGATTGCTGAGAGCAGATATGCTG 888
Query 889 GACTTCTGTAAGCATAAAAGAAATCATCGAAGTGGTGTGAAACTTCATCGGCTCCAAACAGCTCTGTCACTTTA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACTTCTGTAAGCATAAAAGAAATCATCGAAGTGGTGTGAAACTTCATCGGCTCCAAACAGCTCTGTCACTTTA 962
Query 963 TTCTACATCTCTCTGTGGCCTGGTTTTACTAGTAGATAATCGAATTAATTCATATAGTGGTATTAAAAGAGATT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTCTACATCTCTCTGTGGCCTGGTTTTACTAGTAGATAATCGAATTAATTCATATAGTGGTATTAAAAGAGATT 1036
Query 1037 TTGCCACAGTTTGCCAAGAATGCACTGACTTCCATTTCCCCCGAATTGAAGAGCAATTAGAAGTTGTCCAACAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGCCACAGTTTGCCAAGAATGCACTGACTTCCATTTCCCCCGAATTGAAGAGCAATTAGAAGTTGTCCAACAG 1110
Query 1111 GTGGTACTTTATGCTAGAACCCAGCGCAGGAGTAAATTGAAAGAATCACTTGATTCTGGAAACCAAAATGGAGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTGGTACTTTATGCTAGAACCCAGCGCAGGAGTAAATTGAAAGAATCACTTGATTCTGGAAACCAAAATGGAGG 1184
Query 1185 AAATGATGATAAGACTAAGAATGCTGAGAGGAACTATTTAAATGTTTTACCTGGGGAATTTTATATTACACGGC 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1185 AAATGATGATAAGACTAAGAATGCTGAGAGGAACTATTTAAATGTTTTACCT--GGAA---------------- 1240
Query 1259 ATTCTAATCTCTCAG-AAATCCATGTTGCTTTCCATCTCTGTGTGGATGACCATGTGAAATCGGGAAACATCAC 1331
||| ||| ||||.||.|.
Sbjct 1241 ---CTA------CAGAAAATACAAGC------------------------------------------------ 1257
Query 1332 TGCTCGTGATCCTGCCATTATGGGACTCCGAAATATACTCAAAGTTTGCTGTACCCATGACATCACAACAATAA 1405
Sbjct 1258 -------------------------------------------------------------------------- 1257
Query 1406 GCATTCCTCTCTTGCTGGTACATGATATGTCAGAGGAAATGACTATACCCTGGTGCTTAAGGAGAGCGGAACTT 1479
Sbjct 1258 -------------------------------------------------------------------------- 1257
Query 1480 GTGTTCAAGTGTGTCAAAGGTTTCATGATGGAAATGGCTTCATGGGATGGAGGAATTTCTAGGACAGTGCAATT 1553
Sbjct 1258 -------------------------------------------------------------------------- 1257
Query 1554 TCTAGTACCACAGAGTATTTCTGAAGAAATGTTTTATCAACTTAGTAACATGCTTCCCCAGATCTTCCGAGTAT 1627
Sbjct 1258 -------------------------------------------------------------------------- 1257
Query 1628 CATCAACACTCACTCTGACATCCAAGCAC 1656
Sbjct 1258 ----------------------------- 1257