Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03795
• Subject: NM_001366489.2
• Aligned Length: 1569
• Identities: 1410
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCGTGGACCAGCATGGCTCTTGCTGCCTCTGGCATCTACTTCTACAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCGTGGACCAGCATGGCTCTTGCTGCCTCTGGCATCTACTTCTACAG  74

Query   75  TAACAAGTACTTGGACCCTAATGACTTTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCAGTTGCTACGACGGCTGTCATCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAACAAGTACTTGGACCCTAATGACTTTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCAGTTGCTACGACGGCTGTCATCA  148

Query  149  GTTACGACTACCTCACTTCCCTGAAGAGTGTCCCTTATGGCTCAGAGGAGTACTTGCAGCTGAGATCTAAGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTTACGACTACCTCACTTCCCTGAAGAGTGTCCCTTATGGCTCAGAGGAGTACTTGCAGCTGAGATCTAAGGTG  222

Query  223  CACCTTCGCTCTGCCAGGCGTCTCTGTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACCTTCATCAAGGTGGGCCAGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACCTTCGCTCTGCCAGGCGTCTCTGTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACCTTCATCAAGGTGGGCCAGCA  296

Query  297  CCTGGGGGCTCTGGACTACCTGTTGCCAGAGGAGTACACCAGCACGCTGAAGGTACTGCACAGCCAGGCTCCAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGGGGGCTCTGGACTACCTGTTGCCAGAGGAGTACACCAGCACGCTGAAGGTACTGCACAGCCAGGCTCCAC  370

Query  371  AGAGCAGCATGCAAGAGATCCGCCAGGTCATCCGAGAAGATCTGGGCAAGGAGATCCATGATTTGTTCCAGAGC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  371  AGAGCAGCATGCAAGAGATCCGCCAGGTCATCCGAGAAGATCTGGGCAA-------------------------  419

Query  445  TTCGATGACACCCCTCTGGGGACGGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCAGTGCTGCATGATGGGCGGACGGT  518
                                                                                      
Sbjct  420  --------------------------------------------------------------------------  419

Query  519  GGCCGTGAAGGTCCAGCACCCAAAGGTGCGGGCTCAGAGCTCGAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTCGTTC  592
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  420  ------------------------------------------------------------GGAGGTGCTCGTTC  433

Query  593  TGGCTGTGAAGCAGCTGTTCCCAGAGTTTGAGTTTATGTGGCTTGTGGATGAAGCCAAGAAGAACCTGCCTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  TGGCTGTGAAGCAGCTGTTCCCAGAGTTTGAGTTTATGTGGCTTGTGGATGAAGCCAAGAAGAACCTGCCTTTG  507

Query  667  GAGCTGGATTTCCTCAATGAAGGGAGGAATGCTGAGAAGGTGTCCCAGATGCTCAGGCATTTTGACTTCTTGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  GAGCTGGATTTCCTCAATGAAGGGAGGAATGCTGAGAAGGTGTCCCAGATGCTCAGGCATTTTGACTTCTTGAA  581

Query  741  GGTCCCCCGAATCCACTGGGACCTGTCCACGGAGCGGGTCCTCCTGATGGAGTTTGTGGATGGCGGGCAGGTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  GGTCCCCCGAATCCACTGGGACCTGTCCACGGAGCGGGTCCTCCTGATGGAGTTTGTGGATGGCGGGCAGGTCA  655

Query  815  ATGACAGAGACTACATGGAGAGGAACAAGATCGACGTCAATGAGATCTCACGCCACCTGGGCAAGATGTATAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  656  ATGACAGAGACTACATGGAGAGGAACAAGATCGACGTCAATGAGATCTCACGCCACCTGGGCAAGATGTATAGT  729

Query  889  GAGATGATCTTCGTCAATGGCTTCGTGCACTGCGATCCCCACCCCGGCAATGTACTGGTGCGGAAGCACCCCGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  GAGATGATCTTCGTCAATGGCTTCGTGCACTGCGATCCCCACCCCGGCAATGTACTGGTGCGGAAGCACCCCGG  803

Query  963  CACGGGAAAGGCGGAGATTGTCCTGTTGGACCATGGGCTTTACCAGATGCTCACGGAAGAATTCCGCCTGAATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  CACGGGAAAGGCGGAGATTGTCCTGTTGGACCATGGGCTTTACCAGATGCTCACGGAAGAATTCCGCCTGAATT  877

Query 1037  ACTGCCACCTCTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGAAGAGAGTGAAGGAGTACAGCCAGCGACTGGGAGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  878  ACTGCCACCTCTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGAAGAGAGTGAAGGAGTACAGCCAGCGACTGGGAGCC  951

Query 1111  GGGGATCTCTACCCCTTGTTTGCCTGCATGCTGACGGCGCGATCGTGGGACTCGGTCAACAGAGGCATCAGCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  952  GGGGATCTCTACCCCTTGTTTGCCTGCATGCTGACGGCGCGATCGTGGGACTCGGTCAACAGAGGCATCAGCCA  1025

Query 1185  AGCTCCCGTCACTGCCACTGAGGACTTAGAGATTCGCAACAACGCGGCCAACTACCTCCCCCAGATCAGCCATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  AGCTCCCGTCACTGCCACTGAGGACTTAGAGATTCGCAACAACGCGGCCAACTACCTCCCCCAGATCAGCCATC  1099

Query 1259  TCCTCAACCACGTGCCGCGCCAGATGCTGCTCATCTTGAAGACCAACGACCTGCTGCGTGGCATTGAGGCCGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  TCCTCAACCACGTGCCGCGCCAGATGCTGCTCATCTTGAAGACCAACGACCTGCTGCGTGGCATTGAGGCCGCC  1173

Query 1333  CTGGGCACCCGCGCCAGCGCCAGCTCCTTTCTCAACATGTCACGTTGCTGCATCAGAGCGCTAGCTGAGCACAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  CTGGGCACCCGCGCCAGCGCCAGCTCCTTTCTCAACATGTCACGTTGCTGCATCAGAGCGCTAGCTGAGCACAA  1247

Query 1407  GAAGAAGAATACCTGTTCATTCTTCAGAAGGACCCAGATCTCTTTCAGCGAGGCCTTCAACTTATGGCAGATCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  GAAGAAGAATACCTGTTCATTCTTCAGAAGGACCCAGATCTCTTTCAGCGAGGCCTTCAACTTATGGCAGATCA  1321

Query 1481  ACCTCCATGAGCTCATCCTGCGTGTGAAGGGGTTGAAGCTGGCTGACCGGGTCTTGGCCCTAATATGCTGGCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  ACCTCCATGAGCTCATCCTGCGTGTGAAGGGGTTGAAGCTGGCTGACCGGGTCTTGGCCCTAATATGCTGGCTG  1395

Query 1555  TTCCCTGCTCCACTC  1569
            |||||||||||||||
Sbjct 1396  TTCCCTGCTCCACTC  1410