Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03831
- Subject:
- XM_006501967.3
- Aligned Length:
- 2331
- Identities:
- 1897
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 ATGAGACTAAAGATATCTCTTTTAAAAGAACCAAAGCATCAAGAATTAGTAAGCTGTGTGGGCTGGACTACTGC 74
||||||||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGAGACTGAAGATATCTCTCTCAAAGGAACCAAAGCATCAAGAATTAGTGAGCTGTGTGGGTTGGACTACGGC 74
Query 75 TGAAGAGCTGTATTCATGTAGTGATGATCACCAGATAGTGAAGTGGAACTTGTTAACCAGTGAAACAACTCAAA 148
.||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.|..|.||
Sbjct 75 GGAGGAGCTGTACTCATGCAGTGACGACCACCAGATCGTCAAGTGGAACCTGCTAACCAGTGAAACCAGCCTAA 148
Query 149 TAGTAAAGCTTCCTGATGATATTTACCCTATTGATTTTCACTGGTTTCCAAAAAGTTTGGGTGTAAAGAAACAA 222
||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||..||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||.
Sbjct 149 TAGTCAAGCTGCCTGATGACATCTACCCGATAGACCTTCACTGGTTTCCAAAGAGTTTAGGCATAAAGAAACAG 222
Query 223 ACCCAGGCAGAAAGCTTTGTCCTCACAAGTTCTGATGGTAAATTTCATCTGATTTCCAAGTTAGGAAGAGTGGA 296
||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACGCAGGCAGAAAGCTTCGTCCTCACAAGCTCTGATGGTAAGTTTCATCTGATTTCCAAGTTAGGAAGAGTGGA 296
Query 297 AAAAAGTGTAGAAGCTCACTGTGGAGCAGTACTTGCAGGAAGATGGAATTATGAAGGAACAGCATTAGTTACAG 370
|||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 297 AAAGAGTGTAGAAGCTCACTGTGGGGCTGTGCTCGCAGGACGATGGAATTATGAGGGGACTGCATTAGTGACAG 370
Query 371 TTGGAGAAGATGGACAAATAAAAATTTGGTCAAAGACTGGGATGCTTAGATCAACTTTAGCTCAGCAAGGAACA 444
|||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 TTGGAGAAGATGGACAAGTGAAAATCTGGTCAAAGACAGGGATGCTCAGATCAACTTTAGCCCAGCAAGGAACA 444
Query 445 CCAGTGTATTCAGTAGCGTGGGGCCCTGATTCAGAAAAGGTTCTTTATACAGCAGGCAAGCAGCTAATCATTAA 518
||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 445 CCAGTGTACTCAGTAGCCTGGGGCCCTGATTCAGAAAAGGTTCTTTATACAGCAGGCAAACAGCTCATCATTAA 518
Query 519 ACCTCTTCAACCAAATGCTAAAGTTTTGCAGTGGAAAGCTCATGATGGCATTATTTTAAAAGTAGATTGGAACT 592
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 519 ACCTCTTCAACCAAATGCTAAAGTTTTACAGTGGAAAGCCCATGATGGCATCATTTTAAAAGTCGACTGGAACT 592
Query 593 CGGTCAATGATCTTATTTTATCTGCTGGTGAAGACTGTAAATATAAGGTATGGGATAGTTACGGCCGCCCACTG 666
|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||...|||
Sbjct 593 CAGTGAATGACCTTATTTTATCTGCGGGTGAAGACTGTAAGTATAAGGTTTGGGATAGTTATGGCCGCGTGCTG 666
Query 667 TACAATTCACAACCTCATGAGCATCCCATTACTTCAGTTGCCTGGGCTCCAGATGGAGAATTATTTGCTGTTGG 740
|||...||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 667 TACGGCTCCCAGCCTCATGAGCACCCCATCACCTCAGTGGCCTGGGCTCCAGATGGGGAGTTATTTGCCGTTGG 740
Query 741 ATCGTTTCATACTTTACGCTTGTGTGATAAAACTGGGTGGTCATATGCATTAGAAAAACCCAACACTGGCAGCA 814
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATCGTTTCATACGTTACGCTTGTGTGATAAAACTGG-------------------------------------- 776
Query 815 TATTTAATATTGCATGGTCTATCGATGGCACTCAGATTGCTGGAGCCTGTGGAAATGGACATGTCGTTTTTGCA 888
Sbjct 777 -------------------------------------------------------------------------- 776
Query 889 CATGTGGTGGAACAACATTGGGAGTGGAAAAATTTTCAAGTAACATTAACGAAAAGAAGAGCCATGCAGGTTCG 962
||||||
Sbjct 777 --------------------------------------------------------------------GGTTCG 782
Query 963 TAATGTTCTTAATGATGCAGTGGATTTACTGGAATTCCGTGATAGAGTCATTAAAGCATCTTTGAACTATGCAC 1036
.||.|||||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.||||
Sbjct 783 CAACGTTCTCAATGATGCCGTGGATCTCCTGGAGTTCCGGGACAGAGTCATTAAAGCATCCTTAAACCACGCAC 856
Query 1037 ACTTAGTTGTTTCAACGTCTCTTCAATGTTACGTGTTCTCCACGAAGAACTGGAACACACCAATTATATTTGAT 1110
||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 857 ACTTGGTGGTCTCCACGTCCCTGCAGTGCTACGTGTTCTCTACGAAGAACTGGAATACACCACTTATATTTGAT 930
Query 1111 CTCAAAGAAGGAACTGTTAGTTTGATTCTGCAGGCAGAAAGACATTTTCTTCTTGTAGATGGTAGTAGTATCTA 1184
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||..|..|||||||
Sbjct 931 CTCAAAGAAGGAACTGTTAGTTTAATTCTGCAGGCAGAAAGACATTTTCTTCTGGTGGATGGCGGGGGTATCTA 1004
Query 1185 TTTATATTCATATGAAGGGCGCTTTATTTCATCTCCAAAATTTCCTGGAATGAGAACAGATATTCTGAATGCAC 1258
..|..|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1005 CCTGCACTCTTATGAAGGGCGCTTCATTTCTTCTCCAAAGTTTCCTGGCATGAGAACAGACATCCTGAACGCTC 1078
Query 1259 AGACTGTGTCTTTGAGTAATGATACCATAGCAATAAGAGACAAAGCTGATGAAAAAATAATCTTCCTCTTTGAG 1332
|||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||..|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1079 AGACTGTGTCTCTGAGCAATGACACGATAGCAATAAAGGACAAAGCTGACGAGAAGATAATCTTCCTCTTTGAG 1152
Query 1333 GCATCAACCGGAAAGCCGTTAGGTGATGGAAAGTTTCTTTCTCATAAGAATGAAATCTTGGAAATTGCTCTGGA 1406
||.|||||.|||||.||..||||.|||||.||..||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1153 GCGTCAACTGGAAAACCCCTAGGGGATGGGAAACTTCTTTCTCATAAGAATGAAATCTCAGAAATTGCTCTGGA 1226
Query 1407 TCAAAAAGGACTTACCAATGATAGAAAAATTGCTTTCATTGATAAAAATAGAGATCTCTGTATCACTTCTGTGA 1480
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||..|||||.|||||||
Sbjct 1227 TCAAAAAGGACTTACCAATGACAGAAAAATTGCTTTCATTGACAAGAACAGAGATCTCTACATCACCTCTGTGA 1300
Query 1481 AACGATTTGGGAAGGAAGAACAAATTATCAAGCTTGGAACAATGGTGCATACTTTGGCATGGAACGATACATGC 1554
|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||...|||||||||
Sbjct 1301 AACGATTTGGGAAAGAAGAACAGATTATTAAACTTGGAACCATGGTACATACTTTGGCATGGTGTGATACATGC 1374
Query 1555 AATATCCTTTGTGGACTTCAAGATACTCGATTTATAGTGTGGTATTACCCCAATACAGTTTATGTGGACAGAGA 1628
||||||||.||||||.||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||
Sbjct 1375 AATATCCTCTGTGGAATTCAAGATACTCGATTCACAGTATGGTATTACCCTAATACCATTTATGTGGACAGAGA 1448
Query 1629 CATTTTGCCTAAAACATTATATGAAAGGGATGCAAGTGAATTTAGTAAAAATCCCCATATTGTGAGTTTTGTTG 1702
||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||.|||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1449 CATTCTGCCTAAAACATTGTACGAAAGAGATGCAAGTGAATATAGTAAAAACCCGCATATAGTGAGTTTTGTTG 1522
Query 1703 GAAATCAAGTAACTATTAGAAGAGCTGATGGCTCCCTGGTTCACATCAGCATAACACCATATCCTGCTATTCTC 1776
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||.||.|||
Sbjct 1523 GAAATCAGGTAACTATAAGAAGAGCTGATGGCTCCCTGGTGCACATCAGCATATCACCGTACCCCGCCATCCTC 1596
Query 1777 CATGAATATGTAAGCAGTTCAAAATGGGAAGATGCTGTGAGACTTTGTCGCTTTGTTAAGGAGCAAACCATGTG 1850
|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1597 CATGAGTATGTGAGCAGCTCCAAGTGGGAAGAGGCTGTAAGGCTTTGCCGCTTTGTTAAGGAGCAAAGCATGTG 1670
Query 1851 GGCTTGTCTAGCTGCTATGGCAGTTGCTAATCGAGATATGACTACTGCAGAAATAGCCTATGCAGCAATTGGTG 1924
||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1671 GGCTTGCCTAGCGGCTATGGCTGTTGCTAATCGAGATATGGTCACTGCAGAAATAGCCTATGCAGCAGTTGGGG 1744
Query 1925 AAATTGATAAGGTTCAGTACATCAATTCTATAAAAAATCTTCCATCTAAAGAATCAAAAATGGCCCACATACTA 1998
||||||||||.||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1745 AAATTGATAAAGTTCGGTACATCAATGCTATAAAAGATCTTCCATCTAGAGAGTCAAAAATGGCCCACATACTC 1818
Query 1999 CTGTTTAGTGGGAACATACAGGAGGCTGAAATAGTACTTCTTCAGGCTGGCCTTGTTTATCAAGCAATCCAGAT 2072
.||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1819 ATGTTTAGTGGGAACATCCAGGAGGCTGAAACAGTCCTGCTCCAGGCTGGCCTTGTTTATCAAGCCATACAGAT 1892
Query 2073 CAATATTAATCTCTACAACTGGGAAAGGGCACTGGAATTGGCTGTAAAATACAAAACACATGTTGATACAGTTC 2146
|||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1893 CAACATTAATCTCTATAACTGGGAAAGGGCGCTGGAGTTGGCTGTAAAATACAAAACCCACGTTGATACAGTGC 1966
Query 2147 TTGCTTACCGTCAAAAGTTTTTGGAGACATTTGGTAAACAGGAAACTAATAAACGATACTTGCATTATGCAGAA 2220
|.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1967 TCGCTTATCGTCAGAAGTTCTTGGACACATTTGGTAAACAGGAAACTAATAAACGATATTTACAATATGCAGAG 2040
Query 2221 GGTCTCCAAATAGATTGGGAGAAAATCAAAGCCAAAATTGAGATGGAAATTACAAAAGAAAGAGAGCAATCATC 2294
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|.||||||
Sbjct 2041 GGCCTCCAAATAGACTGGGAGAAAATCAAAGCCAAAATTGAGATGGAAATTACTAAAGAACGAGACCGATCATC 2114
Query 2295 AAGCAGCCAATCCAGCAAGAGTATAGGTTTAAAGCCC 2331
.|||.||||.||||||||||||.|.||.|||||||.|
Sbjct 2115 CAGCGGCCAGTCCAGCAAGAGTGTGGGCTTAAAGCAC 2151