Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03831
• Subject: XM_017319702.1
• Aligned Length: 2331
• Identities: 1985
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGAGACTAAAGATATCTCTTTTAAAAGAACCAAAGCATCAAGAATTAGTAAGCTGTGTGGGCTGGACTACTGC  74
            ||||||||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGAGACTGAAGATATCTCTCTCAAAGGAACCAAAGCATCAAGAATTAGTGAGCTGTGTGGGTTGGACTACGGC  74

Query   75  TGAAGAGCTGTATTCATGTAGTGATGATCACCAGATAGTGAAGTGGAACTTGTTAACCAGTGAAACAACTCAAA  148
            .||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.|..|.||
Sbjct   75  GGAGGAGCTGTACTCATGCAGTGACGACCACCAGATCGTCAAGTGGAACCTGCTAACCAGTGAAACCAGCCTAA  148

Query  149  TAGTAAAGCTTCCTGATGATATTTACCCTATTGATTTTCACTGGTTTCCAAAAAGTTTGGGTGTAAAGAAACAA  222
            ||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||..||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||.
Sbjct  149  TAGTCAAGCTGCCTGATGACATCTACCCGATAGACCTTCACTGGTTTCCAAAGAGTTTAGGCATAAAGAAACAG  222

Query  223  ACCCAGGCAGAAAGCTTTGTCCTCACAAGTTCTGATGGTAAATTTCATCTGATTTCCAAGTTAGGAAGAGTGGA  296
            ||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACGCAGGCAGAAAGCTTCGTCCTCACAAGCTCTGATGGTAAGTTTCATCTGATTTCCAAGTTAGGAAGAGTGGA  296

Query  297  AAAAAGTGTAGAAGCTCACTGTGGAGCAGTACTTGCAGGAAGATGGAATTATGAAGGAACAGCATTAGTTACAG  370
            |||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  297  AAAGAGTGTAGAAGCTCACTGTGGGGCTGTGCTCGCAGGACGATGGAATTATGAGGGGACTGCATTAGTGACAG  370

Query  371  TTGGAGAAGATGGACAAATAAAAATTTGGTCAAAGACTGGGATGCTTAGATCAACTTTAGCTCAGCAAGGAACA  444
            |||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  TTGGAGAAGATGGACAAGTGAAAATCTGGTCAAAGACAGGGATGCTCAGATCAACTTTAGCCCAGCAAGGAACA  444

Query  445  CCAGTGTATTCAGTAGCGTGGGGCCCTGATTCAGAAAAGGTTCTTTATACAGCAGGCAAGCAGCTAATCATTAA  518
            ||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  445  CCAGTGTACTCAGTAGCCTGGGGCCCTGATTCAGAAAAGGTTCTTTATACAGCAGGCAAACAGCTCATCATTAA  518

Query  519  ACCTCTTCAACCAAATGCTAAAGTTTTGCAGTGGAAAGCTCATGATGGCATTATTTTAAAAGTAGATTGGAACT  592
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  ACCTCTTCAACCAAATGCTAAAGTTTTACAGTGGAAAGCCCATGATGGCATCATTTTAAAAGTCGACTGGAACT  592

Query  593  CGGTCAATGATCTTATTTTATCTGCTGGTGAAGACTGTAAATATAAGGTATGGGATAGTTACGGCCGCCCACTG  666
            |.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||...|||
Sbjct  593  CAGTGAATGACCTTATTTTATCTGCGGGTGAAGACTGTAAGTATAAGGTTTGGGATAGTTATGGCCGCGTGCTG  666

Query  667  TACAATTCACAACCTCATGAGCATCCCATTACTTCAGTTGCCTGGGCTCCAGATGGAGAATTATTTGCTGTTGG  740
            |||...||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  667  TACGGCTCCCAGCCTCATGAGCACCCCATCACCTCAGTGGCCTGGGCTCCAGATGGGGAGTTATTTGCCGTTGG  740

Query  741  ATCGTTTCATACTTTACGCTTGTGTGATAAAACTGGGTGGTCATATGCATTAGAAAAACCCAACACTGGCAGCA  814
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCGTTTCATACGTTACGCTTGTGTGATAAAACTGGGTGGTCATATGCTTTAGAGAAACCCAACACTGGCAGCA  814

Query  815  TATTTAATATTGCATGGTCTATCGATGGCACTCAGATTGCTGGAGCCTGTGGAAATGGACATGTCGTTTTTGCA  888
            |||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||
Sbjct  815  TATTTAACATTGCGTGGTCTATTGATGGCACTCAGATCGCGGGAGCCTGTGGGAACGGGCATGTTGTCTTTGCA  888

Query  889  CATGTGGTGGAACAACATTGGGAGTGGAAAAATTTTCAAGTAACATTAACGAAAAGAAGAGCCATGCAGGTTCG  962
            |||||||||||.||.|..||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct  889  CATGTGGTGGAGCAGCGCTGGGAGTGGAAAAATTTTCAAGTAACGCTAACGAAGAGAAGGACCATGCAGGTTCG  962

Query  963  TAATGTTCTTAATGATGCAGTGGATTTACTGGAATTCCGTGATAGAGTCATTAAAGCATCTTTGAACTATGCAC  1036
            .||.|||||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.||||
Sbjct  963  CAACGTTCTCAATGATGCCGTGGATCTCCTGGAGTTCCGGGACAGAGTCATTAAAGCATCCTTAAACCACGCAC  1036

Query 1037  ACTTAGTTGTTTCAACGTCTCTTCAATGTTACGTGTTCTCCACGAAGAACTGGAACACACCAATTATATTTGAT  1110
            ||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||                                  
Sbjct 1037  ACTTGGTGGTCTCCACGTCCCTGCAGTGCTACGTGTTCTC----------------------------------  1076

Query 1111  CTCAAAGAAGGAACTGTTAGTTTGATTCTGCAGGCAGAAAGACATTTTCTTCTTGTAGATGGTAGTAGTATCTA  1184
                                                     ||||||||||||.||.|||||..|..|||||||
Sbjct 1077  -----------------------------------------ACATTTTCTTCTGGTGGATGGCGGGGGTATCTA  1109

Query 1185  TTTATATTCATATGAAGGGCGCTTTATTTCATCTCCAAAATTTCCTGGAATGAGAACAGATATTCTGAATGCAC  1258
            ..|..|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1110  CCTGCACTCTTATGAAGGGCGCTTCATTTCTTCTCCAAAGTTTCCTGGCATGAGAACAGACATCCTGAACGCTC  1183

Query 1259  AGACTGTGTCTTTGAGTAATGATACCATAGCAATAAGAGACAAAGCTGATGAAAAAATAATCTTCCTCTTTGAG  1332
            |||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||..|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1184  AGACTGTGTCTCTGAGCAATGACACGATAGCAATAAAGGACAAAGCTGACGAGAAGATAATCTTCCTCTTTGAG  1257

Query 1333  GCATCAACCGGAAAGCCGTTAGGTGATGGAAAGTTTCTTTCTCATAAGAATGAAATCTTGGAAATTGCTCTGGA  1406
            ||.|||||.|||||.||..||||.|||||.||..||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1258  GCGTCAACTGGAAAACCCCTAGGGGATGGGAAACTTCTTTCTCATAAGAATGAAATCTCAGAAATTGCTCTGGA  1331

Query 1407  TCAAAAAGGACTTACCAATGATAGAAAAATTGCTTTCATTGATAAAAATAGAGATCTCTGTATCACTTCTGTGA  1480
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||..|||||.|||||||
Sbjct 1332  TCAAAAAGGACTTACCAATGACAGAAAAATTGCTTTCATTGACAAGAACAGAGATCTCTACATCACCTCTGTGA  1405

Query 1481  AACGATTTGGGAAGGAAGAACAAATTATCAAGCTTGGAACAATGGTGCATACTTTGGCATGGAACGATACATGC  1554
            |||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||...|||||||||
Sbjct 1406  AACGATTTGGGAAAGAAGAACAGATTATTAAACTTGGAACCATGGTACATACTTTGGCATGGTGTGATACATGC  1479

Query 1555  AATATCCTTTGTGGACTTCAAGATACTCGATTTATAGTGTGGTATTACCCCAATACAGTTTATGTGGACAGAGA  1628
            ||||||||.||||||.||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||
Sbjct 1480  AATATCCTCTGTGGAATTCAAGATACTCGATTCACAGTATGGTATTACCCTAATACCATTTATGTGGACAGAGA  1553

Query 1629  CATTTTGCCTAAAACATTATATGAAAGGGATGCAAGTGAATTTAGTAAAAATCCCCATATTGTGAGTTTTGTTG  1702
            ||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||.|||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1554  CATTCTGCCTAAAACATTGTACGAAAGAGATGCAAGTGAATATAGTAAAAACCCGCATATAGTGAGTTTTGTTG  1627

Query 1703  GAAATCAAGTAACTATTAGAAGAGCTGATGGCTCCCTGGTTCACATCAGCATAACACCATATCCTGCTATTCTC  1776
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||.||.|||
Sbjct 1628  GAAATCAGGTAACTATAAGAAGAGCTGATGGCTCCCTGGTGCACATCAGCATATCACCGTACCCCGCCATCCTC  1701

Query 1777  CATGAATATGTAAGCAGTTCAAAATGGGAAGATGCTGTGAGACTTTGTCGCTTTGTTAAGGAGCAAACCATGTG  1850
            |||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1702  CATGAGTATGTGAGCAGCTCCAAGTGGGAAGAGGCTGTAAGGCTTTGCCGCTTTGTTAAGGAGCAAAGCATGTG  1775

Query 1851  GGCTTGTCTAGCTGCTATGGCAGTTGCTAATCGAGATATGACTACTGCAGAAATAGCCTATGCAGCAATTGGTG  1924
            ||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1776  GGCTTGCCTAGCGGCTATGGCTGTTGCTAATCGAGATATGGTCACTGCAGAAATAGCCTATGCAGCAGTTGGGG  1849

Query 1925  AAATTGATAAGGTTCAGTACATCAATTCTATAAAAAATCTTCCATCTAAAGAATCAAAAATGGCCCACATACTA  1998
            ||||||||||.||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1850  AAATTGATAAAGTTCGGTACATCAATGCTATAAAAGATCTTCCATCTAGAGAGTCAAAAATGGCCCACATACTC  1923

Query 1999  CTGTTTAGTGGGAACATACAGGAGGCTGAAATAGTACTTCTTCAGGCTGGCCTTGTTTATCAAGCAATCCAGAT  2072
            .||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1924  ATGTTTAGTGGGAACATCCAGGAGGCTGAAACAGTCCTGCTCCAGGCTGGCCTTGTTTATCAAGCCATACAGAT  1997

Query 2073  CAATATTAATCTCTACAACTGGGAAAGGGCACTGGAATTGGCTGTAAAATACAAAACACATGTTGATACAGTTC  2146
            |||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1998  CAACATTAATCTCTATAACTGGGAAAGGGCGCTGGAGTTGGCTGTAAAATACAAAACCCACGTTGATACAGTGC  2071

Query 2147  TTGCTTACCGTCAAAAGTTTTTGGAGACATTTGGTAAACAGGAAACTAATAAACGATACTTGCATTATGCAGAA  2220
            |.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 2072  TCGCTTATCGTCAGAAGTTCTTGGACACATTTGGTAAACAGGAAACTAATAAACGATATTTACAATATGCAGAG  2145

Query 2221  GGTCTCCAAATAGATTGGGAGAAAATCAAAGCCAAAATTGAGATGGAAATTACAAAAGAAAGAGAGCAATCATC  2294
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|.||||||
Sbjct 2146  GGCCTCCAAATAGACTGGGAGAAAATCAAAGCCAAAATTGAGATGGAAATTACTAAAGAACGAGACCGATCATC  2219

Query 2295  AAGCAGCCAATCCAGCAAGAGTATAGGTTTAAAGCCC  2331
            .|||.||||.||||||||||||.|.||.|||||||.|
Sbjct 2220  CAGCGGCCAGTCCAGCAAGAGTGTGGGCTTAAAGCAC  2256