Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03863
- Subject:
- NM_001270407.1
- Aligned Length:
- 894
- Identities:
- 786
- Gaps:
- 108
Alignment
Query 1 ATGGCGAGGAGGAGCCGCCACCGCCTCCTCCTGCTGCTGCTGCGCTACCTGGTGGTCGCCCTGGGCTATCATAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGAGGAGGAGCCGCCACCGCCTCCTCCTGCTGCTGCTGCGCTACCTGGTGGTCGCCCTGGGCTATCATAA 74
Query 75 GGCCTATGGGTTTTCTGCCCCAAAAGACCAACAAGTAGTCACAGCAGTAGAGTACCAAGAGGCTATTTTAGCCT 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCCTATGGGTTTTCTGCCCCAAAAGACCAACAAGTAGTCACAGCAGTAGAGTAC------------------- 129
Query 149 GCAAAACCCCAAAGAAGACTGTTTCCTCCAGATTAGAGTGGAAGAAACTGGGTCGGAGTGTCTCCTTTGTCTAC 222
Sbjct 130 -------------------------------------------------------------------------- 129
Query 223 TATCAACAGACTCTTCAAGGTGATTTTAAAAATCGAGCTGAGATGATAGATTTCAATATCCGGATCAAAAATGT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 ---------------CAAGGTGATTTTAAAAATCGAGCTGAGATGATAGATTTCAATATCCGGATCAAAAATGT 188
Query 297 GACAAGAAGTGATGCGGGGAAATATCGTTGTGAAGTTAGTGCCCCATCTGAGCAAGGCCAAAACCTGGAAGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 GACAAGAAGTGATGCGGGGAAATATCGTTGTGAAGTTAGTGCCCCATCTGAGCAAGGCCAAAACCTGGAAGAGG 262
Query 371 ATACAGTCACTCTGGAAGTATTAGTGGCTCCAGCAGTTCCATCATGTGAAGTACCCTCTTCTGCTCTGAGTGGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 ATACAGTCACTCTGGAAGTATTAGTGGCTCCAGCAGTTCCATCATGTGAAGTACCCTCTTCTGCTCTGAGTGGA 336
Query 445 ACTGTGGTAGAGCTACGATGTCAAGACAAAGAAGGGAATCCAGCTCCTGAATACACATGGTTTAAGGATGGCAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 ACTGTGGTAGAGCTACGATGTCAAGACAAAGAAGGGAATCCAGCTCCTGAATACACATGGTTTAAGGATGGCAT 410
Query 519 CCGTTTGCTAGAAAATCCCAGACTTGGCTCCCAAAGCACCAACAGCTCATACACAATGAATACAAAAACTGGAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 CCGTTTGCTAGAAAATCCCAGACTTGGCTCCCAAAGCACCAACAGCTCATACACAATGAATACAAAAACTGGAA 484
Query 593 CTCTGCAATTTAATACTGTTTCCAAACTGGACACTGGAGAATATTCCTGTGAAGCCCGCAATTCTGTTGGATAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 CTCTGCAATTTAATACTGTTTCCAAACTGGACACTGGAGAATATTCCTGTGAAGCCCGCAATTCTGTTGGATAT 558
Query 667 CGCAGGTGTCCTGGGAAACGAATGCAAGTAGATGATCTCAACATAAGTGGCATCATAGCAGCCGTAGTAGTTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 CGCAGGTGTCCTGGGAAACGAATGCAAGTAGATGATCTCAACATAAGTGGCATCATAGCAGCCGTAGTAGTTGT 632
Query 741 GGCCTTAGTGATTTCCGTTTGTGGCCTTGGTGTATGCTATGCTCAGAGGAAAGGCTACTTTTCAAAAGAAACCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 GGCCTTAGTGATTTCCGTTTGTGGCCTTGGTGTATGCTATGCTCAGAGGAAAGGCTACTTTTCAAAAGAAACCT 706
Query 815 CCTTCCAGAAGAGTAATTCTTCATCTAAAGCCACGACAATGAGTGAAAATGATTTCAAGCACACAAAATCCTTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 CCTTCCAGAAGAGTAATTCTTCATCTAAAGCCACGACAATGAGTGAAAATGATTTCAAGCACACAAAATCCTTT 780
Query 889 ATAATT 894
||||||
Sbjct 781 ATAATT 786