Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03868
• Subject: NM_021239.3
• Aligned Length: 2529
• Identities: 2529
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCTTTTCCACCTCATTTGAATCGCCCTCCCATGGGAATCCCAGCACTCCCACCAGGGATCCCACCCCCGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTTTCCACCTCATTTGAATCGCCCTCCCATGGGAATCCCAGCACTCCCACCAGGGATCCCACCCCCGCA  74

Query   75  GTTTCCAGGATTTCCTCCACCTGTACCTCCAGGGACCCCAATGATTCCTGTACCAATGAGCATTATGGCTCCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTTCCAGGATTTCCTCCACCTGTACCTCCAGGGACCCCAATGATTCCTGTACCAATGAGCATTATGGCTCCTG  148

Query  149  CTCCAACTGTCTTAGTACCCACTGTGTCTATGGTTGGAAAGCATTTGGGCGCAAGAAAGGATCATCCAGGCTTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCCAACTGTCTTAGTACCCACTGTGTCTATGGTTGGAAAGCATTTGGGCGCAAGAAAGGATCATCCAGGCTTA  222

Query  223  AAGGCTAAAGAAAATGATGAAAATTGTGGTCCTACTACCACTGTTTTTGTTGGCAACATTTCCGAGAAAGCTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGCTAAAGAAAATGATGAAAATTGTGGTCCTACTACCACTGTTTTTGTTGGCAACATTTCCGAGAAAGCTTC  296

Query  297  AGACATGCTTATAAGACAACTCTTAGCTAAATGTGGTTTGGTTTTGAGCTGGAAGAGAGTACAAGGTGCTTCCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACATGCTTATAAGACAACTCTTAGCTAAATGTGGTTTGGTTTTGAGCTGGAAGAGAGTACAAGGTGCTTCCG  370

Query  371  GAAAGCTTCAAGCCTTCGGATTCTGTGAGTACAAGGAGCCAGAATCTACCCTCCGTGCACTCAGATTATTACAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAAGCTTCAAGCCTTCGGATTCTGTGAGTACAAGGAGCCAGAATCTACCCTCCGTGCACTCAGATTATTACAT  444

Query  445  GACCTGCAAATTGGAGAGAAAAAGCTACTCGTTAAAGTTGATGCAAAGACAAAGGCACAGCTGGATGAATGGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACCTGCAAATTGGAGAGAAAAAGCTACTCGTTAAAGTTGATGCAAAGACAAAGGCACAGCTGGATGAATGGAA  518

Query  519  AGCAAAGAAGAAAGCTTCTAATGGGAATGCAAGGCCAGAAACTGTCACTAATGACGATGAAGAAGCCTTGGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCAAAGAAGAAAGCTTCTAATGGGAATGCAAGGCCAGAAACTGTCACTAATGACGATGAAGAAGCCTTGGATG  592

Query  593  AAGAAACAAAGAGGAGAGATCAGATGATTAAAGGGGCTATTGAAGTTTTAATTCGTGAATACTCCAGTGAGCTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAAACAAAGAGGAGAGATCAGATGATTAAAGGGGCTATTGAAGTTTTAATTCGTGAATACTCCAGTGAGCTA  666

Query  667  AATGCCCCCTCACAGGAATCTGATTCTCACCCCAGGAAGAAGAAGAAGGAAAAGAAGGAGGACATTTTCCGCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATGCCCCCTCACAGGAATCTGATTCTCACCCCAGGAAGAAGAAGAAGGAAAAGAAGGAGGACATTTTCCGCAG  740

Query  741  ATTTCCAGTGGCCCCACTGATCCCTTATCCACTCATCACTAAGGAGGATATAAATGCTATAGAAATGGAAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTTCCAGTGGCCCCACTGATCCCTTATCCACTCATCACTAAGGAGGATATAAATGCTATAGAAATGGAAGAAG  814

Query  815  ACAAAAGAGACCTGATATCTCGAGAGATCAGCAAATTCAGAGACACACATAAGAAACTGGAAGAAGAGAAAGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAAAAGAGACCTGATATCTCGAGAGATCAGCAAATTCAGAGACACACATAAGAAACTGGAAGAAGAGAAAGGC  888

Query  889  AAAAAGGAAAAAGAAAGACAGGAAATTGAGAAAGAACGGAGAGAAAGAGAGAGGGAGCGTGAAAGGGAACGAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAAAGGAAAAAGAAAGACAGGAAATTGAGAAAGAACGGAGAGAAAGAGAGAGGGAGCGTGAAAGGGAACGAGA  962

Query  963  AAGGCGAGAACGGGAACGAGAAAGGGAAAGAGAACGTGAACGAGAAAAGGAGAAAGAACGGGAGCGGGAACGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGGCGAGAACGGGAACGAGAAAGGGAAAGAGAACGTGAACGAGAAAAGGAGAAAGAACGGGAGCGGGAACGAG  1036

Query 1037  AACGGGATAGGGACCGTGACCGGACAAAAGAGAGAGACCGAGATCGGGATCGAGAGAGAGATCGTGACCGGGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AACGGGATAGGGACCGTGACCGGACAAAAGAGAGAGACCGAGATCGGGATCGAGAGAGAGATCGTGACCGGGAT  1110

Query 1111  AGAGAAAGGAGCTCAGATCGTAATAAGGATCGCAGTCGATCAAGAGAAAAAAGCAGAGATCGTGAAAGGGAACG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAGAAAGGAGCTCAGATCGTAATAAGGATCGCAGTCGATCAAGAGAAAAAAGCAGAGATCGTGAAAGGGAACG  1184

Query 1185  AGAGCGGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAACGAGAGCGAGAACGAGAACGGGAGCGAGAGAGAGAGCGAGAGAGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAGCGGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAACGAGAGCGAGAACGAGAACGGGAGCGAGAGAGAGAGCGAGAGAGGG  1258

Query 1259  AACGGGAGCGAGAAAGAGAAAAAGACAAAAAACGGGACCGAGAAGAAGATGAAGAAGATGCATACGAACGAAGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AACGGGAGCGAGAAAGAGAAAAAGACAAAAAACGGGACCGAGAAGAAGATGAAGAAGATGCATACGAACGAAGA  1332

Query 1333  AAACTTGAAAGAAAACTCCGAGAGAAAGAAGCTGCTTATCAAGAGCGCCTTAAGAATTGGGAAATCAGAGAACG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAACTTGAAAGAAAACTCCGAGAGAAAGAAGCTGCTTATCAAGAGCGCCTTAAGAATTGGGAAATCAGAGAACG  1406

Query 1407  AAAGAAAACCCGGGAATATGAGAAAGAAGCTGAAAGAGAAGAAGAAAGAAGAAGAGAAATGGCCAAAGAAGCTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAAGAAAACCCGGGAATATGAGAAAGAAGCTGAAAGAGAAGAAGAAAGAAGAAGAGAAATGGCCAAAGAAGCTA  1480

Query 1481  AACGACTAAAAGAATTCTTAGAAGACTATGATGATGATAGAGATGACCCCAAATATTACAGAGGAAGTGCTCTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AACGACTAAAAGAATTCTTAGAAGACTATGATGATGATAGAGATGACCCCAAATATTACAGAGGAAGTGCTCTT  1554

Query 1555  CAGAAAAGGTTGCGTGATAGAGAAAAGGAAATGGAAGCAGATGAACGAGATAGGAAGAGAGAGAAGGAGGAGCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGAAAAGGTTGCGTGATAGAGAAAAGGAAATGGAAGCAGATGAACGAGATAGGAAGAGAGAGAAGGAGGAGCT  1628

Query 1629  TGAGGAAATCAGGCAGCGCCTTCTGGCAGAAGGGCATCCAGATCCAGATGCAGAGCTCCAGAGGATGGAACAAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAGGAAATCAGGCAGCGCCTTCTGGCAGAAGGGCATCCAGATCCAGATGCAGAGCTCCAGAGGATGGAACAAG  1702

Query 1703  AGGCTGAGAGGCGCAGGCAGCCACAAATAAAGCAAGAGCCAGAATCAGAAGAGGAGGAAGAAGAAAAGCAAGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGCTGAGAGGCGCAGGCAGCCACAAATAAAGCAAGAGCCAGAATCAGAAGAGGAGGAAGAAGAAAAGCAAGAA  1776

Query 1777  AAAGAAGAAAAACGAGAAGAACCCATGGAAGAGGAAGAGGAGCCAGAGCAAAAGCCTTGTCTGAAACCTACTCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAAGAAGAAAAACGAGAAGAACCCATGGAAGAGGAAGAGGAGCCAGAGCAAAAGCCTTGTCTGAAACCTACTCT  1850

Query 1851  GAGGCCCATCAGCTCTGCTCCATCTGTTTCCTCTGCCAGTGGCAATGCAACACCTAACACTCCTGGGGATGAGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAGGCCCATCAGCTCTGCTCCATCTGTTTCCTCTGCCAGTGGCAATGCAACACCTAACACTCCTGGGGATGAGT  1924

Query 1925  CTCCCTGTGGTATTATTATTCCTCATGAAAACTCACCAGATCAACAGCAACCTGAGGAGCATAGGCCAAAAATA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTCCCTGTGGTATTATTATTCCTCATGAAAACTCACCAGATCAACAGCAACCTGAGGAGCATAGGCCAAAAATA  1998

Query 1999  GGACTAAGTCTTAAACTGGGTGCTTCCAATAGTCCTGGTCAGCCTAATTCTGTGAAGAGAAAGAAACTACCTGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGACTAAGTCTTAAACTGGGTGCTTCCAATAGTCCTGGTCAGCCTAATTCTGTGAAGAGAAAGAAACTACCTGT  2072

Query 2073  AGATAGTGTCTTTAACAAATTTGAGGATGAAGACAGTGATGACGTACCCCGAAAAAGGAAACTGGTTCCCTTGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGATAGTGTCTTTAACAAATTTGAGGATGAAGACAGTGATGACGTACCCCGAAAAAGGAAACTGGTTCCCTTGG  2146

Query 2147  ATTATGGTGAAGATGATAAAAATGCAACCAAAGGCACTGTAAACACTGAAGAAAAGCGTAAACACATTAAGAGT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATTATGGTGAAGATGATAAAAATGCAACCAAAGGCACTGTAAACACTGAAGAAAAGCGTAAACACATTAAGAGT  2220

Query 2221  CTCATTGAGAAAATCCCTACAGCCAAACCTGAGCTCTTCGCTTATCCCCTGGATTGGTCTATTGTGGATTCTAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTCATTGAGAAAATCCCTACAGCCAAACCTGAGCTCTTCGCTTATCCCCTGGATTGGTCTATTGTGGATTCTAT  2294

Query 2295  ACTGATGGAACGTCGAATTAGACCATGGATTAATAAGAAAATCATAGAATATATAGGTGAAGAAGAAGCTACAT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ACTGATGGAACGTCGAATTAGACCATGGATTAATAAGAAAATCATAGAATATATAGGTGAAGAAGAAGCTACAT  2368

Query 2369  TAGTTGATTTTGTTTGTTCTAAGGTTATGGCTCATAGTTCACCCCAGAGCATTTTAGATGATGTTGCCATGGTA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TAGTTGATTTTGTTTGTTCTAAGGTTATGGCTCATAGTTCACCCCAGAGCATTTTAGATGATGTTGCCATGGTA  2442

Query 2443  CTTGATGAAGAAGCAGAAGTTTTTATAGTCAAAATGTGGAGATTATTGATATATGAAACAGAAGCCAAGAAAAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTTGATGAAGAAGCAGAAGTTTTTATAGTCAAAATGTGGAGATTATTGATATATGAAACAGAAGCCAAGAAAAT  2516

Query 2517  TGGTCTTGTGAAG  2529
            |||||||||||||
Sbjct 2517  TGGTCTTGTGAAG  2529