Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03879
• Subject: NM_001165960.1
• Aligned Length: 843
• Identities: 711
• Gaps: 132

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MPRGAFRPCLPALYFAFLTCPTPEQRMSGTQAPDIHLGEPARGTGCVRGKQTSIRVQDCGRREEARAASRELRR  74

Query   1  ----------------------------------------------------------MAVYRLCVTTGPYLRA  16
                                                                     ||||||||||||||||
Sbjct  75  EKAQEHPRESWAHPQPYPAPQPLALRPETQPCPACRSSPPGRLLLRPALPGHPFLLPIMAVYRLCVTTGPYLRA  148

Query  17  GTLDNISVTLVGTCGESPKQRLDRMGRDFAPGSVQKYKVRCTAELGELLLLRVHKERYAFFRKDSWYCSRICVT  90
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GTLDNISVTLVGTCGESPKQRLDRMGRDFAPGSVQKYKVRCTAELGELLLLRVHKERYAFFRKDSWYCSRICVT  222

Query  91  EPDGSVSHFPCYQWIEGYCTVELRPGTARTICQDSLPLLLDHRTRELRARQECYRWKIYAPGFPCMVDVNSFQE  164
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  EPDGSVSHFPCYQWIEGYCTVELRPGTARTICQDSLPLLLDHRTRELRARQECYRWKIYAPGFPCMVDVNSFQE  296

Query 165  MESDKKFALTKTTTCVDQGDSSGNRYLPGFPMKIDIPSLMYMEPNVRYSATKTISLLFNAIPASLGMKLRGLLD  238
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  MESDKKFALTKTTTCVDQGDSSGNRYLPGFPMKIDIPSLMYMEPNVRYSATKTISLLFNAIPASLGMKLRGLLD  370

Query 239  RKGSWKKLDDMQNIFWCHKTFTTKYVTEHWCEDHFFGYQYLNGVNPVMLHCISSLPSKLPVTNDMVAPLLGQDT  312
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  RKGSWKKLDDMQNIFWCHKTFTTKYVTEHWCEDHFFGYQYLNGVNPVMLHCISSLPSKLPVTNDMVAPLLGQDT  444

Query 313  CLQTELERGNIFLADYWILAEAPTHCLNGRQQYVAAPLCLLWLSPQGALVPLAIQLSQTPGPDSPIFLPTDSEW  386
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CLQTELERGNIFLADYWILAEAPTHCLNGRQQYVAAPLCLLWLSPQGALVPLAIQLSQTPGPDSPIFLPTDSEW  518

Query 387  DWLLAKTWVRNSEFLVHENNTHFLCTHLLCEAFAMATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTIARATLLNPEG  460
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  DWLLAKTWVRNSEFLVHENNTHFLCTHLLCEAFAMATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTIARATLLNPEG  592

Query 461  LVDQVTSIGRQGLIYLMSTGLAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRDDGLKIWAAIESFVSEIVGYYYPSD  534
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  LVDQVTSIGRQGLIYLMSTGLAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRDDGLKIWAAIESFVSEIVGYYYPSD  666

Query 535  ASVQQDSELQAWTGEIFAQAFLGRESSGFPSRLCTPGEMVKFLTAIIFNCSAQHAAVNSGQHDFGAWMPNAPSS  608
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  ASVQQDSELQAWTGEIFAQAFLGRESSGFPSRLCTPGEMVKFLTAIIFNCSAQHAAVNSGQHDFGAWMPNAPSS  740

Query 609  MRQPPPQTKGTTTLKTYLDTLPEVNISCNNLLLFWLVSQEPKDQRPLGTYPDEHFTEEAPRRSIAAFQSRLAQI  682
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  MRQPPPQTKGTTTLKTYLDTLPEVNISCNNLLLFWLVSQEPKDQRPLGTYPDEHFTEEAPRRSIAAFQSRLAQI  814

Query 683  SRDIQERNQGLALPYTYLDPPLIENSVSI  711
           |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  SRDIQERNQGLALPYTYLDPPLIENSVSI  843