Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03879
• Subject: NM_001369446.1
• Aligned Length: 2133
• Identities: 2130
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCAGTGTACCGCCTGTGTGTGACCACTGGTCCCTACCTGAGGGCCGGCACACTGGACAACATCTCTGTCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGTGTACCGCCTGTGTGTGACCACTGGTCCCTACCTGAGGGCCGGCACACTGGACAACATCTCTGTCAC  74

Query   75  ACTGGTGGGCACGTGTGGTGAAAGCCCCAAGCAGCGGCTAGATCGAATGGGCAGGGACTTCGCCCCTGGATCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACTGGTGGGCACGTGTGGTGAAAGCCCCAAGCAGCGGCTAGATCGAATGGGCAGGGACTTCGCCCCTGGATCGG  148

Query  149  TACAGAAGTACAAGGTGCGTTGCACAGCGGAGCTGGGTGAGCTCTTGCTGCTGCGTGTACACAAGGAGCGCTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TACAGAAGTACAAGGTGCGTTGCACAGCGGAGCTGGGTGAGCTCTTGCTGCTGCGTGTACACAAGGAGCGCTAC  222

Query  223  GCTTTCTTCCGCAAGGACTCTTGGTACTGTAGCCGCATCTGTGTCACCGAACCGGATGGTAGTGTATCCCACTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTTTCTTCCGCAAGGACTCTTGGTACTGTAGCCGCATCTGTGTCACCGAACCGGATGGTAGTGTATCCCACTT  296

Query  297  CCCCTGCTATCAGTGGATTGAAGGCTACTGCACCGTGGAGCTGAGGCCAGGAACAGCAAGAACTATTTGTCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCCTGCTATCAGTGGATTGAAGGCTACTGCACCGTGGAGCTGAGGCCAGGAACAGCAAGAACTATTTGTCAGG  370

Query  371  ACTCTCTTCCCCTCCTCCTGGATCACAGGACACGGGAGCTCCGGGCCCGACAAGAATGCTACCGCTGGAAGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTCTCTTCCCCTCCTCCTGGATCACAGGACACGGGAGCTCCGGGCCCGACAAGAATGCTACCGCTGGAAGATC  444

Query  445  TATGCCCCTGGCTTCCCCTGCATGGTAGACGTCAACAGCTTTCAGGAGATGGAGTCAGACAAGAAATTTGCCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGCCCCTGGCTTCCCCTGCATGGTAGACGTCAACAGCTTTCAGGAGATGGAGTCAGACAAGAAATTTGCCTT  518

Query  519  GACAAAGACGACAACTTGTGTAGACCAGGGTGACAGCAGTGGGAATCGGTACCTGCCCGGCTTCCCCATGAAAA  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACAAAGACGACAACTTGTGTAGACCAGGGTGA---CAGTGGGAATCGGTACCTGCCCGGCTTCCCCATGAAAA  589

Query  593  TTGACATCCCATCCCTGATGTACATGGAGCCCAATGTTCGATACTCAGCCACCAAGACGATCTCGCTGCTCTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  TTGACATCCCATCCCTGATGTACATGGAGCCCAATGTTCGATACTCAGCCACCAAGACGATCTCGCTGCTCTTC  663

Query  667  AATGCCATCCCTGCGTCCTTGGGAATGAAGCTTCGAGGGCTGTTGGATCGCAAGGGCTCCTGGAAGAAGCTGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  AATGCCATCCCTGCGTCCTTGGGAATGAAGCTTCGAGGGCTGTTGGATCGCAAGGGCTCCTGGAAGAAGCTGGA  737

Query  741  TGACATGCAGAACATCTTCTGGTGCCATAAGACCTTCACGACAAAGTATGTCACAGAGCACTGGTGTGAAGATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  TGACATGCAGAACATCTTCTGGTGCCATAAGACCTTCACGACAAAGTATGTCACAGAGCACTGGTGTGAAGATC  811

Query  815  ACTTCTTTGGGTACCAGTACCTGAATGGTGTCAATCCCGTCATGCTCCACTGCATCTCTAGCTTGCCCAGCAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  ACTTCTTTGGGTACCAGTACCTGAATGGTGTCAATCCCGTCATGCTCCACTGCATCTCTAGCTTGCCCAGCAAG  885

Query  889  CTGCCTGTCACCAATGACATGGTGGCCCCCTTGCTGGGACAGGACACATGCCTGCAGACAGAGCTAGAGAGGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  CTGCCTGTCACCAATGACATGGTGGCCCCCTTGCTGGGACAGGACACATGCCTGCAGACAGAGCTAGAGAGGGG  959

Query  963  GAACATCTTCCTAGCGGACTACTGGATCCTGGCGGAGGCCCCCACCCACTGCCTAAACGGCCGCCAGCAGTACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GAACATCTTCCTAGCGGACTACTGGATCCTGGCGGAGGCCCCCACCCACTGCCTAAACGGCCGCCAGCAGTACG  1033

Query 1037  TGGCCGCCCCACTGTGCCTGCTGTGGCTCAGCCCCCAGGGGGCGCTGGTGCCCTTGGCCATCCAGCTCAGCCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  TGGCCGCCCCACTGTGCCTGCTGTGGCTCAGCCCCCAGGGGGCGCTGGTGCCCTTGGCCATCCAGCTCAGCCAG  1107

Query 1111  ACCCCCGGGCCTGACAGCCCCATCTTCCTGCCCACTGACTCCGAATGGGACTGGCTGCTGGCCAAGACGTGGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  ACCCCCGGGCCTGACAGCCCCATCTTCCTGCCCACTGACTCCGAATGGGACTGGCTGCTGGCCAAGACGTGGGT  1181

Query 1185  GCGCAACTCTGAGTTCCTGGTGCACGAAAACAACACGCACTTTCTGTGCACGCATTTGCTGTGCGAGGCCTTCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  GCGCAACTCTGAGTTCCTGGTGCACGAAAACAACACGCACTTTCTGTGCACGCATTTGCTGTGCGAGGCCTTCG  1255

Query 1259  CCATGGCCACGCTGCGCCAGCTGCCGCTCTGCCACCCCATCTACAAGCTCCTACTCCCCCACACTCGATACACG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  CCATGGCCACGCTGCGCCAGCTGCCGCTCTGCCACCCCATCTACAAGCTCCTACTCCCCCACACTCGATACACG  1329

Query 1333  CTGCAGGTGAACACCATCGCGAGGGCCACGCTGCTCAACCCCGAGGGCCTCGTGGACCAGGTCACGTCCATCGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  CTGCAGGTGAACACCATCGCGAGGGCCACGCTGCTCAACCCCGAGGGCCTCGTGGACCAGGTCACGTCCATCGG  1403

Query 1407  GAGGCAAGGCCTCATCTACCTCATGAGCACGGGCCTGGCCCACTTCACCTACACCAATTTCTGCCTTCCGGACA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  GAGGCAAGGCCTCATCTACCTCATGAGCACGGGCCTGGCCCACTTCACCTACACCAATTTCTGCCTTCCGGACA  1477

Query 1481  GCCTGCGGGCCCGCGGCGTCCTGGCTATCCCCAACTACCACTACCGAGACGACGGCCTGAAGATCTGGGCGGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  GCCTGCGGGCCCGCGGCGTCCTGGCTATCCCCAACTACCACTACCGAGACGACGGCCTGAAGATCTGGGCGGCC  1551

Query 1555  ATTGAGAGCTTTGTCTCAGAAATCGTGGGCTACTATTATCCCAGTGACGCATCTGTGCAGCAGGATTCGGAGCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  ATTGAGAGCTTTGTCTCAGAAATCGTGGGCTACTATTATCCCAGTGACGCATCTGTGCAGCAGGATTCGGAGCT  1625

Query 1629  GCAGGCCTGGACTGGCGAGATTTTTGCTCAGGCGTTCCTGGGCCGGGAAAGCTCAGGTTTCCCAAGCCGGCTGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  GCAGGCCTGGACTGGCGAGATTTTTGCTCAGGCGTTCCTGGGCCGGGAAAGCTCAGGTTTCCCAAGCCGGCTGT  1699

Query 1703  GCACCCCAGGAGAGATGGTGAAGTTCCTCACTGCAATCATCTTCAATTGCTCTGCCCAGCACGCTGCTGTCAAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  GCACCCCAGGAGAGATGGTGAAGTTCCTCACTGCAATCATCTTCAATTGCTCTGCCCAGCACGCTGCTGTCAAC  1773

Query 1777  AGTGGGCAGCATGACTTTGGGGCCTGGATGCCCAATGCTCCATCATCCATGAGGCAGCCCCCACCCCAGACCAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  AGTGGGCAGCATGACTTTGGGGCCTGGATGCCCAATGCTCCATCATCCATGAGGCAGCCCCCACCCCAGACCAA  1847

Query 1851  GGGGACCACCACCCTGAAGACTTACCTAGACACCCTCCCTGAAGTGAACATCAGCTGTAACAACCTCCTCCTCT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  GGGGACCACCACCCTGAAGACTTACCTAGACACCCTCCCTGAAGTGAACATCAGCTGTAACAACCTCCTCCTCT  1921

Query 1925  TCTGGTTGGTTAGCCAAGAACCCAAGGACCAGAGGCCCCTGGGCACCTACCCAGATGAGCACTTCACAGAGGAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  TCTGGTTGGTTAGCCAAGAACCCAAGGACCAGAGGCCCCTGGGCACCTACCCAGATGAGCACTTCACAGAGGAG  1995

Query 1999  GCCCCGAGGCGGAGCATCGCCGCCTTCCAGAGCCGCCTGGCCCAGATCTCAAGGGACATCCAGGAGCGGAACCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  GCCCCGAGGCGGAGCATCGCCGCCTTCCAGAGCCGCCTGGCCCAGATCTCAAGGGACATCCAGGAGCGGAACCA  2069

Query 2073  GGGTCTGGCACTGCCCTACACCTACCTGGACCCTCCCCTCATTGAGAACAGCGTCTCCATC  2133
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  GGGTCTGGCACTGCCCTACACCTACCTGGACCCTCCCCTCATTGAGAACAGCGTCTCCATC  2130