Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03879
- Subject:
- XM_017024921.2
- Aligned Length:
- 2137
- Identities:
- 1830
- Gaps:
- 296
Alignment
Query 1 ATGGCAGTGTACCGCCTGTGTGTGACCACTGGTCCCTACCTGAGGGCCGGCACACTGGACAACATCTCTGTCAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGTGTACCGCCTGTGTGTGACCACTGGTCCCTACCTGAGGGCCGGCACACTGGACAACATCTCTGTCAC 74
Query 75 ACTGGTGGGCACGTGTGGTGAAAGCCCCAAGCAGCGGCTAGATCGAATGGGCAGGGACTTCGCCCCTGGATCGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTGGTGGGCACGTGTGGTGAAAGCCCCAAGCAGCGGCTAGATCGAATGGGCAGGGACTTCGCCCCTGGATCGG 148
Query 149 TACAGAAGTACAAGGTGCGTTGCACAGCGGAGCTGGGTGAGCTCTTGCTGCTGCGTGTACACAAGGAGCGCTAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TACAGAAGTACAAGGTGCGTTGCACAGCGGAGCTGGGTGAGCTCTTGCTGCTGCGTGTACACAAGGAGCGCTAC 222
Query 223 GCTTTCTTCCGCAAGGACTCTTGGTACTGTAGCCGCATCTGTGTCACCGAACCGGATGGTAGTGTATCCCACTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTTTCTTCCGCAAGGACTCTTGGTACTGTAGCCGCATCTGTGTCACCGAACCGGATGGTAGTGTATCCCACTT 296
Query 297 CCCCTGCTATCAGTGGATTGAAGGCTACTGCACCGTGGAGCTGAGGCCAGGAACAGCAAGAACTATTTGTCAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCCCTGCTATCAGTGGATTGAAGGCTACTGCACCGTGGAGCTGAGGCCAGGAACAGCAAGAACTATTTGTCAGG 370
Query 371 ACTCTCTTCCCCTCCTCCTGGATCACAGGACACGGGAGCTCCGGGCCCGACAAGAATGCTACCGCTGGAAGATC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTCTCTTCCCCTCCTCCTGGATCACAGGACACGGGAGCTCCGGGCCCGACAAGAATGCTACCGCTGGAAGATC 444
Query 445 TATGCCCCTGGCTTCCCCTGCATGGTAGACGTCAACAGCTTTCAGGAGATGGAGTCAGACAAGAAATTTGCCTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TATGCCCCTGGCTTCCCCTGCATGGTAGACGTCAACAGCTTTCAGGAGATGGAGTCAGACAAGAAATTTGCCTT 518
Query 519 GACAAAGACGACAACTTGTGTAGACCAGGGTGACAGCAGTGGGAATCGGTACCTGCCCGGCTTCCCCATGAAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACAAAGACGACAACTTGTGTAGACCAGGGTGACAGCAGTGGGAATCGGTACCTGCCCGGCTTCCCCATGAAAA 592
Query 593 TTGACATCCCATCCCTGATGTACATGGAGCCCAATGTTCGATACTCAGCCACCAAGACGATCTCGCTGCTCTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGACATCCCATCCCTGATGTACATGGAGCCCAATGTTCGATACTCAGCCACCAAGACGATCTCGCTGCTCTTC 666
Query 667 AATGCCATCCCTGCGTCCTTGGGAATGAAGCTTCGAGGGCTGTTGGATCGCAAGGGCTCCTGGAAGAAGCTGGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AATGCCATCCCTGCGTCCTTGGGAATGAAGCTTCGAGGGCTGTTGGATCGCAAGGGCTCCTGGAAGAAGCTGGA 740
Query 741 TGACATGCAGAACATCTTCTGGTGCCATAAGACCTTCACGACAAAGTATGTCACAGAGCACTGGTGTGAAGATC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGACATGCAGAACATCTTCTGGTGCCATAAGACCTTCACGACAAAGTATGTCACAGAGCACTGGTGTGAAGATC 814
Query 815 ACTTCTTTGGGTACCAGTACCTGAATGGTGTCAATCCCGTCATGCTCCACTGCATCTCTAGCTTGCCCAGCAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACTTCTTTGGGTACCAGTACCTGAATGGTGTCAATCCCGTCATGCTCCACTGCATCTCTAGCTTGCCCAGCAAG 888
Query 889 CTGCCTGTCACCAATGACATGGTGGCCCCCTTGCTGGGACAGGACACATGCCTGCAGACAGAGCTAGAGAGGGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGCCTGTCACCAATGACATGGTGGCCCCCTTGCTGGGACAGGACACATGCCTGCAGACAGAGCTAGAGAGGGG 962
Query 963 GAACATCTTCCTAGCGGACTACTGGATCCTGGCGGAGGCCCCCACCCACTGCCTAAACGGCCGCCAGCAGTACG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAACATCTTCCTAGCGGACTACTGGATCCTGGCGGAGGCCCCCACCCACTGCCTAAACGGCCGCCAGCAGTACG 1036
Query 1037 TGGCCGCCCCACTGTGCCTGCTGTGGCTCAGCCCCCAGGGGGCGCTGGTGCCCTTGGCCATCCAGCTCAGCCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGCCGCCCCACTGTGCCTGCTGTGGCTCAGCCCCCAGGGGGCGCTGGTGCCCTTGGCCATCCAGCTCAGCCAG 1110
Query 1111 ACCCCCGGGCCTGACAGCCCCATCTTCCTGCCCACTGACTCCGAATGGGACTGGCTGCTGGCCAAGACGTGGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACCCCCGGGCCTGACAGCCCCATCTTCCTGCCCACTGACTCCGAATGGGACTGGCTGCTGGCCAAGACGTGGGT 1184
Query 1185 GCGCAACTCTGAGTTCCTGGTGCACGAAAACAACACGCACTTTCTGTGCACGCATTTGCTGTGCGAGGCCTTCG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCGCAACTCTGAGTTCCTGGTGCACGAAAACAACACGCACTTTCTGTGCACGCATTTGCTGTGCGAGGCCTTCG 1258
Query 1259 CCATGGCCACGCTGCGCCAGCTGCCGCTCTGCCACCCCATCTACAAGCTCCTACTCCCCCACACTCGATACACG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCATGGCCACGCTGCGCCAGCTGCCGCTCTGCCACCCCATCTACAAGCTCCTACTCCCCCACACTCGATACACG 1332
Query 1333 CTGCAGGTGAACACCATCGCGAGGGCCACGCTGCTCAACCCCGAGGGCCTCGTGGACCAGGTCACGTCCATCGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGCAGGTGAACACCATCGCGAGGGCCACGCTGCTCAACCCCGAGGGCCTCGTGGACCAGGTCACGTCCATCGG 1406
Query 1407 GAGGCAAGGCCTCATCTACCTCATGAGCACGGGCCTGGCCCACTTCACCTACACCAATTTCTGCCTTCCGGACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGGCAAGGCCTCATCTACCTCATGAGCACGGGCCTGGCCCACTTCACCTACACCAATTTCTGCCTTCCGGACA 1480
Query 1481 GCCTGCGGGCCCGCGGCGTCCTGGCTATCCCCAACTACCACTACCGAGACGACGGCCTGAAGATCTGGGCGGCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GCCTGCGGGCCCGCGGCGTCCTGGCTATCCCCAACTACCACTACCGAGACGACGGCCTGAAGATCTGGGCGGCC 1554
Query 1555 ATTGAGAGCTTTGTCTCAGAAATCGTGGGCTACTATTATCCCAGTGACGCATCTGTGCAGCAGGATTCGGAGCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATTGAGAGCTTTGTCTCAGAAATCGTGGGCTACTATTATCCCAGTGACGCATCTGTGCAGCAGGATTCGGAGCT 1628
Query 1629 GCAGGCCTGGACTGGCGAGATTTTTGCTCAGGCGTTCCTGGGCCGGGAAAGCTCAGGTTTCCCAAGCCGGCTGT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCAGGCCTGGACTGGCGAGATTTTTGCTCAGGCGTTCCTGGGCCGGGAAAGCTCAGGTTTCCCAAGCCGGCTGT 1702
Query 1703 GCACCCCAGGAGAGATGGTGAAGTTCCTCACTGCAATCATCTTCAATTGCTCTGCCCAGCACGCTGCTGTCAAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCACCCCAGGAGAGATGGTGAAGTTCCTCACTGCAATCATCTTCAATTGCTCTGCCCAGCACGCTGCTGTCAAC 1776
Query 1777 AGTGGGCAGCATGACTTTGGGGC----CTGGATGCCCAATGCTCCATCATCCATGAGGCAGCCCCCACCCCAGA 1846
||||||||| ||| ||| .|||| ||||...|||
Sbjct 1777 AGTGGGCAG---GAC-----GGCAGAGGTGGA-------------ATCAGGGATG------------------- 1810
Query 1847 CCAAGGGGACCACCACCCTGAAGACTTACCTAGACACCCTCCCTGAAGTGAACATCAGCTGTAACAACCTCCTC 1920
.|||||| ..||.|||| |.|||
Sbjct 1811 -----------------GTGAAGA------------------GGGAGGTGA------------------TACTC 1831
Query 1921 CTCTTCTGGTTGGTTAGCCAAGAACCCAAGGACCAGAGGCCCCTGGGCACCTACCCAGATGAGCACTTCACAGA 1994
|.|||||| |||||.
Sbjct 1832 CCCTTCTG--------GCCAAC---------------------------------------------------- 1845
Query 1995 GGAGGCCCCGAGGCGGAGCATCGCCGCCTTCCAGAGCCGCCTGGCCCAGATCTCAAGGGACATCCAGGAGCGGA 2068
Sbjct 1846 -------------------------------------------------------------------------- 1845
Query 2069 ACCAGGGTCTGGCACTGCCCTACACCTACCTGGACCCTCCCCTCATTGAGAACAGCGTCTCCATC 2133
Sbjct 1846 ----------------------------------------------------------------- 1845