Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03882
Subject:
NM_001282311.2
Aligned Length:
788
Identities:
634
Gaps:
154

Alignment

Query   1  ATGAGGTTGGCAGGCCCTCTCCGCATTGTGGTCCTAGTCGTCAGTGTGGGTGTCACATGGATCGTGGTCAGCAT  74
                                                                   ||||||||||||||||||
Sbjct   1  --------------------------------------------------------ATGGATCGTGGTCAGCAT  18

Query  75  CCTCCTGGGTGGGCCTGGCAGTGGCTTTCCTCGCATCCAGCAACTCTTCACCA---------------------  127
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  19  CCTCCTGGGTGGGCCTGGCAGTGGCTTTCCTCGCATCCAGCAACTCTTCACCAGCTGGAGTGCAGTGGTGCAAT  92

Query 128  --------------------------------------------------------------------------  127
                                                                                     
Sbjct  93  CTCGGTTCACTGCAACCTCTACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTAGTGCCCCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTA  166

Query 128  ---GTCCAGAGAGCTCGGTGACTGCAGCGCCACGGGCCAGGAAGTACAAGTGTGGCCTGCCCCAGCCGTGTCCT  198
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 167  CAGGTCCAGAGAGCTCGGTGACTGCAGCGCCACGGGCCAGGAAGTACAAGTGTGGCCTGCCCCAGCCGTGTCCT  240

Query 199  GAGGAGCACCTGGCCTTCCGCGTGGTCAGCGGGGCCGCCAACGTCATTGGGCCCAAGATCTGCCTCGAGGACAA  272
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241  GAGGAGCACCTGGCCTTCCGCGTGGTCAGCGGGGCCGCCAACGTCATTGGGCCCAAGATCTGCCTCGAGGACAA  314

Query 273  GATGCTGATGAGCAGCGTCAAGGACAACGTGGGCCGCGGGCTGAACATCGCCCTGGTGAACGGGGTCAGCGGCG  346
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315  GATGCTGATGAGCAGCGTCAAGGACAACGTGGGCCGCGGGCTGAACATCGCCCTGGTGAACGGGGTCAGCGGCG  388

Query 347  AGCTCATCGAGGCCCGGGCCTTTGACATGTGGGCCGGAGATGTCAACGACCTGTTGAAGTTTATTCGGCCACTG  420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389  AGCTCATCGAGGCCCGGGCCTTTGACATGTGGGCCGGAGATGTCAACGACCTGTTGAAGTTTATTCGGCCACTG  462

Query 421  CACGAAGGCACCCTGGTGTTCGTGGCATCCTACGACGACCCAGCCACCAAGATGAATGAAGAGACCAGAAAGCT  494
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 463  CACGAAGGCACCCTGGTGTTCGTGGCATCCTACGACGACCCAGCCACCAAGATGAATGAAGAGACCAGAAAGCT  536

Query 495  CTTCAGTGAGCTGGGCAGCAGGAACGCCAAGGAGCTGGCCTTCCGGGACAGCTGGGTGTTTGTCGGGGCCAAGG  568
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537  CTTCAGTGAGCTGGGCAGCAGGAACGCCAAGGAGCTGGCCTTCCGGGACAGCTGGGTGTTTGTCGGGGCCAAGG  610

Query 569  GTGTGCAGAACAAGAGCCCCTTTGAGCAGCACGTGAAGAACAGTAAGCACAGCAACAAGTACGAAGGCTGGCCC  642
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611  GTGTGCAGAACAAGAGCCCCTTTGAGCAGCACGTGAAGAACAGTAAGCACAGCAACAAGTACGAAGGCTGGCCC  684

Query 643  GAGGCGCTGGAGATGGAAGGCTGTATCCCGCGGAGAAGCACGGCCAGC  690
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 685  GAGGCGCTGGAGATGGAAGGCTGTATCCCGCGGAGAAGCACGGCCAGC  732