Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03940
Subject:
NM_001001740.3
Aligned Length:
731
Identities:
707
Gaps:
24

Alignment

Query   1  MSGSRQAGSGSAGTSPGSSAASSVTSASSSLSSSPSPPSVAVSAAALVSGGVAQAAGSGGLGGPVRPVLVAPAV  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MSGSRQAGSGSAGTSPGSSAASSVTSASSSLSSSPSPPSVAVSAAALVSGGVAQAAGSGGLGGPVRPVLVAPAV  74

Query  75  SGSGGGAVSTGLSRHSCAARPSAGVGGSSSSLGSGSRKRPLLAPLCNGLINSYEDKSNDFVCPICFDMIEEAYM  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  SGSGGGAVSTGLSRHSCAARPSAGVGGSSSSLGSGSRKRPLLAPLCNGLINSYEDKSNDFVCPICFDMIEEAYM  148

Query 149  TKCGHSFCYKCIHQSLEDNNRCPKCNYVVDNIDHLYPNFLVNELILKQKQRFEEKRFKLDHSVSSTNGHRWQIF  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||
Sbjct 149  TKCGHSFCYKCIHQSLEDNNRCPKCNYVVDNIDHLYPNFLVNELILKQKQRFEEKRFKLDHS----NGHRWQIF  218

Query 223  QDWLGTDQDNLDLANVNLMLELLVQKKKQLEAESHAAQLQILMEFLKVARRNKREQLEQIQKELSVLEEDIKRV  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct 219  QDWLGTDQDNLDLANVNLMLELLVQKKKQLEAESHAAQLQILMEFLKVARRNKR--------------------  272

Query 297  EEMSGLYSPVSEDSTVPQFEAPSPSHSSIIDSTEYSQPPGFSGSSQTKKQPWYNSTLASRRKRLTAHFEDLEQC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273  EEMSGLYSPVSEDSTVPQFEAPSPSHSSIIDSTEYSQPPGFSGSSQTKKQPWYNSTLASRRKRLTAHFEDLEQC  346

Query 371  YFSTRMSRISDDSRTASQLDEFQECLSKFTRYNSVRPLATLSYASDLYNGSSIVSSIEFDRDCDYFAIAGVTKK  444
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Sbjct 347  YFSTRMSRISDDSRTASQLDEFQECLSKFTRYNSVRPLATLSYASDLYNGSSIVSSIEFDRDCDYFAIAGVTKK  420

Query 445  IKVYEYDTVIQDAVDIHYPENEMTCNSKISCISWSSYHKNLLASSDYEGTVILWDGFTGQRSKVYQEHEKRCWS  518
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Sbjct 421  IKVYEYDTVIQDAVDIHYPENEMTCNSKISCISWSSYHKNLLASSDYEGTVILWDGFTGQRSKVYQEHEKRCWS  494

Query 519  VDFNLMDPKLLASGSDDAKVKLWSTNLDNSVASIEAKANVCCVKFSPSSRYHLAFGCADHCVHYYDLRNTKQPI  592
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Sbjct 495  VDFNLMDPKLLASGSDDAKVKLWSTNLDNSVASIEAKANVCCVKFSPSSRYHLAFGCADHCVHYYDLRNTKQPI  568

Query 593  MVFKGHRKAVSYAKFVSGEEIVSASTDSQLKLWNVGKPYCLRSFKGHINEKNFVGLASNGDYIACGSENNSLYL  666
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Sbjct 569  MVFKGHRKAVSYAKFVSGEEIVSASTDSQLKLWNVGKPYCLRSFKGHINEKNFVGLASNGDYIACGSENNSLYL  642

Query 667  YYKGLSKTLLTFKFDTVKSVLDKDRKEDDTNEFVSAVCWRALPDGESNVLIAANSQGTIKVLELV  731
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Sbjct 643  YYKGLSKTLLTFKFDTVKSVLDKDRKEDDTNEFVSAVCWRALPDGESNVLIAANSQGTIKVLELV  707