Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03940
- Subject:
- NM_001286644.1
- Aligned Length:
- 2193
- Identities:
- 1473
- Gaps:
- 720
Alignment
Query 1 ATGTCTGGTAGCCGCCAGGCCGGGTCGGGCTCCGCTGGGACAAGCCCCGGGTCCTCGGCGGCCTCCTCGGTGAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TTCCGCCTCCTCGTCTTTATCCTCTTCCCCGTCGCCGCCTTCCGTGGCGGTTTCGGCGGCAGCGCTGGTGTCCG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCGGGGTGGCCCAGGCCGCCGGCTCGGGCGGCCTCGGGGGCCCGGTGCGGCCTGTGTTGGTGGCGCCCGCCGTA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCGGGTAGCGGCGGCGGGGCGGTGTCCACGGGCCTGTCCCGGCACAGCTGCGCGGCCAGGCCCAGCGCCGGCGT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGGAGGCAGCAGCTCCAGCCTAGGCAGCGGCAGCAGGAAGCGACCTCTCCTCGCCCCCCTCTGCAACGGGCTCA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCAACTCCTACGAGGACAAAAGCAACGACTTCGTATGCCCCATCTGCTTTGATATGATTGAAGAAGCATACATG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 ACAAAATGTGGCCACAGCTTTTGCTACAAGTGTATTCATCAGAGTTTGGAGGACAATAATAGATGTCCCAAGTG 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TAACTATGTTGTGGACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGGTGAATGAACTCATTCTTAAACAGAAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----ATGTTGTGGACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGG--------------------------- 42
Query 593 AAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGACCACTCAGTGAGTAGCACCAATGGCCACAGGTGGCAGATATTT 666
Sbjct 43 -------------------------------------------------------------------------- 42
Query 667 CAAGATTGGTTGGGAACTGACCAAGATAACCTTGATTTGGCCAATGTCAATCTTATGTTGGAGTTACTAGTGCA 740
Sbjct 43 -------------------------------------------------------------------------- 42
Query 741 GAAGAAGAAACAACTGGAAGCAGAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCAAGGTTGCAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43 ----------------------GAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCAAGGTTGCAA 94
Query 815 GAAGAAATAAGAGAGAGCAACTGGAACAGATCCAGAAGGAGCTAAGTGTTTTGGAAGAGGATATTAAGAGAGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 95 GAAGAAATAAGAGAGAGCAACTGGAACAGATCCAGAAGGAGCTAAGTGTTTTGGAAGAGGATATTAAGAGAGTG 168
Query 889 GAAGAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGCCTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 GAAGAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGCCTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATC 242
Query 963 ACACAGTAGTATTATTGATTCCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGACAAAGAAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 ACACAGTAGTATTATTGATTCCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGACAAAGAAAC 316
Query 1037 AGCCTTGGTATAATAGCACGTTAGCATCAAGACGAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 AGCCTTGGTATAATAGCACGTTAGCATCAAGACGAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGT 390
Query 1111 TACTTTTCTACAAGGATGTCTCGTATCTCAGATGACAGTCGAACTGCAAGCCAGTTGGATGAATTTCAGGAATG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 391 TACTTTTCTACAAGGATGTCTCGTATCTCAGATGACAGTCGAACTGCAAGCCAGTTGGATGAATTTCAGGAATG 464
Query 1185 CTTGTCCAAGTTTACTCGATATAATTCAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465 CTTGTCCAAGTTTACTCGATATAATTCAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATG 538
Query 1259 GTTCCAGTATAGTCTCTAGTATTGAATTTGACCGGGATTGTGACTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 GTTCCAGTATAGTCTCTAGTATTGAATTTGACCGGGATTGTGACTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAG 612
Query 1333 ATTAAAGTCTATGAATATGACACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATGACCTG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 ATTAAAGTCTATGAATATGACACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATGACCTG 686
Query 1407 CAATTCGAAAATCAGCTGTATCAGTTGGAGTAGTTACCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 687 CAATTCGAAAATCAGCTGTATCAGTTGGAGTAGTTACCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCA 760
Query 1481 CTGTTATTTTATGGGATGGATTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGAGCATGAGAAGAGGTGTTGGAGT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 CTGTTATTTTATGGGATGGATTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGAGCATGAGAAGAGGTGTTGGAGT 834
Query 1555 GTTGACTTTAATTTGATGGATCCTAAACTCTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGTGAAGCTGTGGTCTAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 GTTGACTTTAATTTGATGGATCCTAAACTCTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGTGAAGCTGTGGTCTAC 908
Query 1629 CAATCTAGACAACTCAGTGGCAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTGTGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 CAATCTAGACAACTCAGTGGCAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTGTGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCA 982
Query 1703 GATACCATTTGGCTTTCGGCTGTGCAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTAAACAGCCAATC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 983 GATACCATTTGGCTTTCGGCTGTGCAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTAAACAGCCAATC 1056
Query 1777 ATGGTATTCAAAGGACACCGTAAAGCAGTCTCTTATGCAAAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCCTC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 ATGGTATTCAAAGGACACCGTAAAGCAGTCTCTTATGCAAAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCCTC 1130
Query 1851 AACAGACAGTCAGCTAAAACTGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCTTCAAGGGTCATATCAATG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 AACAGACAGTCAGCTAAAACTGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCTTCAAGGGTCATATCAATG 1204
Query 1925 AAAAAAACTTTGTAGGCCTGGCTTCCAATGGAGATTATATAGCTTGTGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 AAAAAAACTTTGTAGGCCTGGCTTCCAATGGAGATTATATAGCTTGTGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCTG 1278
Query 1999 TACTATAAAGGACTTTCTAAGACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAGTCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279 TACTATAAAGGACTTTCTAAGACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAGTCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCG 1352
Query 2073 AAAAGAAGATGATACAAATGAATTTGTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGGAGTCCAATGTGC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1353 AAAAGAAGATGATACAAATGAATTTGTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGGAGTCCAATGTGC 1426
Query 2147 TGATTGCTGCTAACAGTCAGGGTACAATTAAGGTGCTAGAATTGGTA 2193
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1427 TGATTGCTGCTAACAGTCAGGGTACAATTAAGGTGCTAGAATTGGTA 1473
