Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03940
- Subject:
- XM_017002065.2
- Aligned Length:
- 2281
- Identities:
- 2111
- Gaps:
- 158
Alignment
Query 1 ATGTCTGGTAGCCGCCAGGCCGGGTCGGGCTCCGCTGGGACAAGCCCCGGGTCCTCGGCGGCCTCCTCGGTGAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTGGTAGCCGCCAGGCCGGGTCGGGCTCCGCTGGGACAAGCCCCGGGTCCTCGGCGGCCTCCTCGGTGAC 74
Query 75 TTCCGCCTCCTCGTCTTTATCCTCTTCCCCGTCGCCGCCTTCCGTGGCGGTTTCGGCGGCAGCGCTGGTGTCCG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCCGCCTCCTCGTCTTTATCCTCTTCCCCGTCGCCGCCTTCCGTGGCGGTTTCGGCGGCAGCGCTGGTGTCCG 148
Query 149 GCGGGGTGGCCCAGGCCGCCGGCTCGGGCGGCCTCGGGGGCCCGGTGCGGCCTGTGTTGGTGGCGCCCGCCGTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGGGGTGGCCCAGGCCGCCGGCTCGGGCGGCCTCGGGGGCCCGGTGCGGCCTGTGTTGGTGGCGCCCGCCGTA 222
Query 223 TCGGGTAGCGGCGGCGGGGCGGTGTCCACGGGCCTGTCCCGGCACAGCTGCGCGGCCAGGCCCAGCGCCGGCGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCGGGTAGCGGCGGCGGGGCGGTGTCCACGGGCCTGTCCCGGCACAGCTGCGCGGCCAGGCCCAGCGCCGGCGT 296
Query 297 AGGAGGCAGCAGCTCCAGCCTAGGCAGCGGCAGCAGGAAGCGACCTCTCCTCGCCCCCCTCTGCAACGGGCTCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGAGGCAGCAGCTCCAGCCTAGGCAGCGGCAGCAGGAAGCGACCTCTCCTCGCCCCCCTCTGCAACGGGCTCA 370
Query 371 TCAACTCCTACGAGGACAAAAGCAACGACTTCGTATGCCCCATCTGCTTTGATATGATTGAAGAAGCATACATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAACTCCTACGAGGACAAAAGCAACGACTTCGTATGCCCCATCTGCTTTGATATGATTGAAGAAGCATACATG 444
Query 445 ACAAAATGTGGCCACAGCTTTTGCTACAAGTGTATTCATCAGAGTTTGGAGGACAATAATAGATGTCCCAAGTG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACAAAATGTGGCCACAGCTTTTGCTACAAGTGTATTCATCAGAGTTTGGAGGACAATAATAGATGTCCCAAGTG 518
Query 519 TAACTATGTTGTGGACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGGTGAATGAACTCATTCTTAAACAGAAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAACTATGTTGTGGACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGGTGAATGAACTCATTCTTAAACAGAAGC 592
Query 593 AAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGACCACTCAGTGAGTAGCACCAATGGCCACAGGTGGCAGATATTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGACCACTCAGTGAGTAGCACCAATGGCCACAGGTGGCAGATATTT 666
Query 667 CAAGATTGGTTGGGAACTGACCAAGATAACCTTGATTTGGCCAATGTCAATCTTATGTTGGAGTTACTAGTGCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAAGATTGGTTGGGAACTGACCAAGATAACCTTGATTTGGCCAATGTCAATCTTATGTTGGAGTTACTAGTGCA 740
Query 741 GAAGAAGAAACAACTGGAAGCAGAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCAAGGTTGCAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGAAGAAACAACTGGAAGCAGAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCAAGGTTGCAA 814
Query 815 GAAGAAATAAGAGAGAGCAACTGGAACAGATCCAGAAGGAGCTAAGTGTTTTGGAAGAGGATATTAAGAGAGTG 888
|||||||||||||||||
Sbjct 815 GAAGAAATAAGAGAGAG--------------------------------------------------------- 831
Query 889 GAAGAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGCCTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATC 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 ---GAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGCCTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATC 902
Query 963 ACACAGTAGTATTATTGATTCCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGACAAAGAAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 ACACAGTAGTATTATTGATTCCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGACAAAGAAAC 976
Query 1037 AGCCTTGGTATAATAGCACGTTAGCATCAAGACGAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 AGCCTTGGTATAATAGCACGTTAGCATCAAGACGAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGT 1050
Query 1111 TACTTTTCTACAAGGATGTCTCGTATCTCAGATGACAGTCGAACTGCAAGCCAGTTGGATGAATTTCAGGAATG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051 TACTTTTCTACAAGGATGTCTCGTATCTCAGATGACAGTCGAACTGCAAGCCAGTTGGATGAATTTCAGGAATG 1124
Query 1185 CTTGTCCAAGTTTACTCGATATAATTCAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125 CTTGTCCAAGTTTACTCGATATAATTCAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATG 1198
Query 1259 GTTCCAGTATAGTCTCTAGTATTGAATTTGACCGGGATTGTGACTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 GTTCCAGTATAGTCTCTAGTATTGAATTTGACCGGGATTGTGACTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAG 1272
Query 1333 ATTAAAGTCTATGAATATGACACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATGACCTG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273 ATTAAAGTCTATGAATATGACACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATGACCTG 1346
Query 1407 CAATTCGAAAATCAGCTGTATCAGTTGGAGTAGTTACCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1347 CAATTCGAAAATCAGCTGTATCAGTTGGAGTAGTTACCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCA 1420
Query 1481 CTGTTATTTTATGGGATGGATTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGAGCATGAGAAGAGGTGTTGGAGT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421 CTGTTATTTTATGGGATGGATTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGAGCATGAGAAGAGGTGTTGGAGT 1494
Query 1555 GTTGACTTTAATTTGATGGATCCTAAACTCTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGTGAAGCTGTGGTCTAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 GTTGACTTTAATTTGATGGATCCTAAACTCTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGTGAAGCTGTGGTCTAC 1568
Query 1629 CAATCTAGACAACTCAGTGGCAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTGTGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1569 CAATCTAGACAACTCAGTGGCAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTGTGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCA 1642
Query 1703 GATACCATTTGGCTTTCGGCTGTGCAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTAAACAGCCAATC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1643 GATACCATTTGGCTTTCGGCTGTGCAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTAAACAGCCAATC 1716
Query 1777 ATGGTATTCAAAGGACACCGTAAAGCAGTCTCTTATGCAAAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCCTC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717 ATGGTATTCAAAGGACACCGTAAAGCAGTCTCTTATGCAAAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCCTC 1790
Query 1851 AACAGACAGTCAGCTAAAACTGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCTTCAAGGGTCATATCAATG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 AACAGACAGTCAGCTAAAACTGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCTTCAAGGGTCATATCAATG 1864
Query 1925 AAAAAAACTTTGTAGGCCTGGCTTCCAATGGAGATTATATAGCTTGTGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1865 AAAAAAACTTTGTAGGCCTGGCTTCCAATGGAGATTATATAGCTTGTGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCTG 1938
Query 1999 TACTATAAAGGACTTTCTAAGACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAGTCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1939 TACTATAAAGGACTTTCTAAGACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAGTCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCG 2012
Query 2073 AAAAGAAGATGATACAAATGAATTTGTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGGAGTCC---AATG 2143
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| ||| |||
Sbjct 2013 AAAAGAAGATGATACAAATGAATTTGTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGTA-TCCTAGAAT- 2084
Query 2144 TGC-TG-----------------ATTGCTGCTAACAGTCAGGGTACAATTAAGGTGC--------------TAG 2185
||| || ||..||| |.||| |.||||...||.|| |||
Sbjct 2085 TGCATGGGAGAAGCAAAGATCCCATCTCTG-TCACA-------TCCAATCTTGGAGCCACCGGTGGAAATTTAG 2150
Query 2186 AATTGGTA----------------------------------------------------- 2193
||.||..|
Sbjct 2151 AAGTGCCAAAGTGTTTCCAACAGTCGCTGCCGCAAACCTATTCTTTCTTTACAGGAGTGAT 2211