Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03940
• Subject: XM_017002071.1
• Aligned Length: 2335
• Identities: 1451
• Gaps: 872

Alignment

Query    1  ATGTCTGGTAGCCGCCAGGCCGGGTCGGGCTCCGCTGGGACAAGCCCCGGGTCCTCGGCGGCCTCCTCGGTGAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTCCGCCTCCTCGTCTTTATCCTCTTCCCCGTCGCCGCCTTCCGTGGCGGTTTCGGCGGCAGCGCTGGTGTCCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCGGGGTGGCCCAGGCCGCCGGCTCGGGCGGCCTCGGGGGCCCGGTGCGGCCTGTGTTGGTGGCGCCCGCCGTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCGGGTAGCGGCGGCGGGGCGGTGTCCACGGGCCTGTCCCGGCACAGCTGCGCGGCCAGGCCCAGCGCCGGCGT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGGAGGCAGCAGCTCCAGCCTAGGCAGCGGCAGCAGGAAGCGACCTCTCCTCGCCCCCCTCTGCAACGGGCTCA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCAACTCCTACGAGGACAAAAGCAACGACTTCGTATGCCCCATCTGCTTTGATATGATTGAAGAAGCATACATG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  ACAAAATGTGGCCACAGCTTTTGCTACAAGTGTATTCATCAGAGTTTGGAGGACAATAATAGATGTCCCAAGTG  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  TAACTATGTTGTGGACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGGTGAATGAACTCATTCTTAAACAGAAGC  592
                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct    1  -----ATGTTGTGGACAATATTGACCATCTGTATCCTAATTTCTTGG---------------------------  42

Query  593  AAAGATTTGAGGAAAAGAGGTTCAAATTGGACCACTCAGTGAGTAGCACCAATGGCCACAGGTGGCAGATATTT  666
                                                                                      
Sbjct   43  --------------------------------------------------------------------------  42

Query  667  CAAGATTGGTTGGGAACTGACCAAGATAACCTTGATTTGGCCAATGTCAATCTTATGTTGGAGTTACTAGTGCA  740
                                                                                      
Sbjct   43  --------------------------------------------------------------------------  42

Query  741  GAAGAAGAAACAACTGGAAGCAGAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCAAGGTTGCAA  814
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   43  ----------------------GAATCACATGCAGCCCAACTACAGATTCTTATGGAATTCCTCAAGGTTGCAA  94

Query  815  GAAGAAATAAGAGAGAGCAACTGGAACAGATCCAGAAGGAGCTAAGTGTTTTGGAAGAGGATATTAAGAGAGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   95  GAAGAAATAAGAGAGAGCAACTGGAACAGATCCAGAAGGAGCTAAGTGTTTTGGAAGAGGATATTAAGAGAGTG  168

Query  889  GAAGAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGCCTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  169  GAAGAAATGAGTGGCTTATACTCTCCTGTCAGTGAGGATAGCACAGTGCCTCAATTTGAAGCTCCTTCTCCATC  242

Query  963  ACACAG------------------------------------------------------TAGTATTATTGATT  982
            ||||||                                                      ||||||||||||||
Sbjct  243  ACACAGCCTTGAATTCAGTTCTGATATGCACAGGATCTTTGTCAATGGAATACTTATTATTAGTATTATTGATT  316

Query  983  CCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGACAAAGAAACAGCCTTGGTATAATAGCACG  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  317  CCACAGAATACAGCCAACCTCCAGGTTTCAGTGGCAGTTCTCAGACAAAGAAACAGCCTTGGTATAATAGCACG  390

Query 1057  TTAGCATCAAGACGAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGTTACTTTTCTACAAGGATGTC  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  391  TTAGCATCAAGACGAAAACGACTTACTGCTCATTTTGAAGACTTGGAGCAGTGTTACTTTTCTACAAGGATGTC  464

Query 1131  TCGTATCTCAGATGACAGTCGAACTGCAAGCCAGTTGGATGAATTTCAGGAATGCTTGTCCAAGTTTACTCGAT  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  TCGTATCTCAGATGACAGTCGAACTGCAAGCCAGTTGGATGAATTTCAGGAATGCTTGTCCAAGTTTACTCGAT  538

Query 1205  ATAATTCAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATGGTTCCAGTATAGTCTCTAGT  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539  ATAATTCAGTACGACCTTTAGCCACATTGTCATATGCTAGTGATCTCTATAATGGTTCCAGTATAGTCTCTAGT  612

Query 1279  ATTGAATTTGACCGGGATTGTGACTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAGATTAAAGTCTATGAATATGA  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  613  ATTGAATTTGACCGGGATTGTGACTATTTTGCGATTGCTGGAGTTACAAAGAAGATTAAAGTCTATGAATATGA  686

Query 1353  CACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATGACCTGCAATTCGAAAATCAGCTGTA  1426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  687  CACTGTCATCCAGGATGCAGTGGATATTCATTACCCTGAGAATGAAATGACCTGCAATTCGAAAATCAGCTGTA  760

Query 1427  TCAGTTGGAGTAGTTACCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCACTGTTATTTTATGGGATGGA  1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  761  TCAGTTGGAGTAGTTACCATAAGAACCTGTTAGCTAGCAGTGATTATGAAGGCACTGTTATTTTATGGGATGGA  834

Query 1501  TTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGAGCATGAGAAGAGGTGTTGGAGTGTTGACTTTAATTTGATGGA  1574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  TTCACAGGACAGAGGTCAAAGGTCTATCAGGAGCATGAGAAGAGGTGTTGGAGTGTTGACTTTAATTTGATGGA  908

Query 1575  TCCTAAACTCTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGTGAAGCTGTGGTCTACCAATCTAGACAACTCAGTGG  1648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  909  TCCTAAACTCTTGGCTTCAGGTTCTGATGATGCAAAAGTGAAGCTGTGGTCTACCAATCTAGACAACTCAGTGG  982

Query 1649  CAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTGTGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCAGATACCATTTGGCTTTCGGC  1722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  983  CAAGCATTGAGGCAAAGGCTAATGTGTGCTGTGTTAAATTCAGCCCCTCTTCCAGATACCATTTGGCTTTCGGC  1056

Query 1723  TGTGCAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTAAACAGCCAATCATGGTATTCAAAGGACACCG  1796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057  TGTGCAGATCACTGTGTCCACTACTATGATCTTCGTAACACTAAACAGCCAATCATGGTATTCAAAGGACACCG  1130

Query 1797  TAAAGCAGTCTCTTATGCAAAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCCTCAACAGACAGTCAGCTAAAAC  1870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131  TAAAGCAGTCTCTTATGCAAAGTTTGTGAGTGGTGAGGAAATTGTCTCTGCCTCAACAGACAGTCAGCTAAAAC  1204

Query 1871  TGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCTTCAAGGGTCATATCAATGAAAAAAACTTTGTAGGCCTG  1944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205  TGTGGAATGTAGGGAAACCATACTGCCTACGTTCCTTCAAGGGTCATATCAATGAAAAAAACTTTGTAGGCCTG  1278

Query 1945  GCTTCCAATGGAGATTATATAGCTTGTGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCTGTACTATAAAGGACTTTCTAA  2018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279  GCTTCCAATGGAGATTATATAGCTTGTGGAAGTGAAAATAACTCTCTCTACCTGTACTATAAAGGACTTTCTAA  1352

Query 2019  GACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAGTCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCGAAAAGAAGATGATACAAATG  2092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1353  GACTTTGCTAACTTTTAAGTTTGATACAGTCAAAAGTGTTCTCGACAAAGACCGAAAAGAAGATGATACAAATG  1426

Query 2093  AATTTGTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGGAGTCC---AATGTGC-TG--------------  2148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| |||   ||| ||| ||              
Sbjct 1427  AATTTGTTAGTGCTGTGTGCTGGAGGGCACTACCAGATGGGTA-TCCTAGAAT-TGCATGGGAGAAGCAAAGAT  1498

Query 2149  ---ATTGCTGCTAACAGTCAGGGTACAATTAAGGTGC--------------TAGAATTGGTA------------  2193
               ||..||| |.|||       |.||||...||.||              |||||.||..|            
Sbjct 1499  CCCATCTCTG-TCACA-------TCCAATCTTGGAGCCACCGGTGGAAATTTAGAAGTGCCAAAGTGTTTCCAA  1564

Query 2194  -----------------------------------------  2193
                                                     
Sbjct 1565  CAGTCGCTGCCGCAAACCTATTCTTTCTTTACAGGAGTGAT  1605