Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03947
• Subject: NM_001077525.3
• Aligned Length: 1950
• Identities: 1950
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCGGCGCTCGGGCCGCCGCCGCCGCTGCCTCGGCGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGCAACCAGCCGCCTCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGGCGCTCGGGCCGCCGCCGCCGCTGCCTCGGCGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGCAACCAGCCGCCTCA  74

Query   75  GGAGCTGGGGCTTGGGGAGCTGCTGGAGGAGTTCTCCCGGACTCAGTACCGGGCCAAGGATGGCAGCGGGACCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGCTGGGGCTTGGGGAGCTGCTGGAGGAGTTCTCCCGGACTCAGTACCGGGCCAAGGATGGCAGCGGGACCG  148

Query  149  GCGGCTCTAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCCGAGACTACTGTTTCAGCGTGATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGGCTCTAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCCGAGACTACTGTTTCAGCGTGATT  222

Query  223  CCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTCCTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTCCTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAA  296

Query  297  GGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCTCATCCACCGCAGCAAGATGGCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCTCATCCACCGCAGCAAGATGGCCC  370

Query  371  GGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCT  444

Query  445  GGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGA  518

Query  519  TGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCT  592

Query  593  ATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAG  666

Query  667  TTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCAT  740

Query  741  CCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACT  814

Query  815  GGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTCACTCTCTGAACATTGACTGGAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTCACTCTCTGAACATTGACTGGAGC  888

Query  889  CAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGA  962

Query  963  TGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCC  1036

Query 1037  TTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTAT  1110

Query 1111  GACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAA  1184

Query 1185  TTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGG  1258

Query 1259  ATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGC  1332

Query 1333  GACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCC  1406

Query 1407  AGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCCACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCCACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGC  1480

Query 1481  CACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCAGGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCAGGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCA  1554

Query 1555  AACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCCAAACCCAGATCAGTGGACCATCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCCAAACCCAGATCAGTGGACCATCC  1628

Query 1629  CCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGCTGGCAGATGGTAACGGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGCTGGCAGATGGTAACGGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGC  1702

Query 1703  GGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAGCTTCCCGGATGAGCTCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAGCTTCCCGGATGAGCTCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCA  1776

Query 1777  GCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGG  1850

Query 1851  GCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGAC  1924

Query 1925  TCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG  1950
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG  1950