Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03947
- Subject:
- XM_017007036.1
- Aligned Length:
- 2047
- Identities:
- 1731
- Gaps:
- 281
Alignment
Query 1 ---------------------------------ATGGCC----------GGC---------GCTCGGGCCGCCG 22
||.||| ||| ||||.||||..|.
Sbjct 1 ATGGCAGCGGGACCGGCGGCTCTAAGTCGTCTTATCGCCAGACCTGGAGGGCTTCCTGTCAGCTCAGGCCATCC 74
Query 23 CCGCC----------GCTGCCTCGGCGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGC--AACCAGCCGCCTCAGGAGCT---- 80
||.|| ||||.|...|||| |.||..|||| || |.||.|||..|||| |
Sbjct 75 CCACCCTAAGCACTGGCTGGCAGTGCGG-----TGGGAATCTT---GCCGACCCTGCCATCTCA-----TTCCC 135
Query 81 ----GGGGCTTGGGGAGCT---GCTGGAGGAGTTCTCC---CGGACTCAGTACC-----GGGCCAAGGATGGCA 139
|.||.||.||.|||| ||...| ||||.||| .|.|.||.||.|| |..||| ||
Sbjct 136 CCACGTGGTTTTGGCAGCTTTAGCACCA--AGTTTTCCAGTGGAATTCTGTTCCATCCTGCACCA-------CA 200
Query 140 G----CGG----GACCGGCGGCTC------TAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCC 199
| |.| ||| ||| ||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 GAACTCTGATTTGAC------CTCAGAGATTACCGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCC 268
Query 200 GAGACTACTGTTTCAGCGTGATTCCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTC 273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269 GAGACTACTGTTTCAGCGTGATTCCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTC 342
Query 274 CTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAAGGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCT 347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 CTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAAGGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCT 416
Query 348 CATCCACCGCAGCAAGATGGCCCGGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACA 421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 CATCCACCGCAGCAAGATGGCCCGGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACA 490
Query 422 TTTGCAGGTCGGCCACACTGGCTGGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGG 495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 TTTGCAGGTCGGCCACACTGGCTGGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGG 564
Query 496 GGTGCAGATGATGCCTGGGCAGATGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCA 569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 GGTGCAGATGATGCCTGGGCAGATGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCA 638
Query 570 TCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCTATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGA 643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 639 TCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCTATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGA 712
Query 644 TGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAGTTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTAT 717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 TGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAGTTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTAT 786
Query 718 GCCGACTTCACTCTCCTCTCCATCCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACAT 791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 GCCGACTTCACTCTCCTCTCCATCCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACAT 860
Query 792 GGCAGAAGGGCTCATATTTAACTGGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTC 865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 GGCAGAAGGGCTCATATTTAACTGGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTC 934
Query 866 ACTCTCTGAACATTGACTGGAGCCAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTG 939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 ACTCTCTGAACATTGACTGGAGCCAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTG 1008
Query 940 CTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGATGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCC 1013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 CTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGATGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCC 1082
Query 1014 CCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCCTTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGA 1087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 CCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCCTTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGA 1156
Query 1088 TCCTCTACCTCACTGTGGCCTATGACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAG 1161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 TCCTCTACCTCACTGTGGCCTATGACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAG 1230
Query 1162 GAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAATTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAG 1235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 GAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAATTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAG 1304
Query 1236 GAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGGATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTG 1309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 GAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGGATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTG 1378
Query 1310 GCAGCACCACCAGCCTTGGCAGCGACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACC 1383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 GCAGCACCACCAGCCTTGGCAGCGACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACC 1452
Query 1384 TATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCCAGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCC 1457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 TATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCCAGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCC 1526
Query 1458 ACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGCCACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCA 1531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527 ACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGCCACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCA 1600
Query 1532 GGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCAAACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCC 1605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 GGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCAAACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCC 1674
Query 1606 AAACCCAGATCAGTGGACCATCCCCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGCTGGCAGATGGTAAC 1679
||||||||
Sbjct 1675 AAACCCAG------------------------------------------------------------------ 1682
Query 1680 GGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGCGGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAGCTTCCCGGATGAGC 1753
Sbjct 1683 -------------------------------------------------------------------------- 1682
Query 1754 TCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCAGCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTG 1827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683 ----------------GCTTGCAGCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTG 1740
Query 1828 GCTGCGTACAGCAGCACAGTGGGGCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGA 1901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GCTGCGTACAGCAGCACAGTGGGGCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGA 1814
Query 1902 GCAATTTGCCCGTGGTGTTGGACTCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG 1950
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 GCAATTTGCCCGTGGTGTTGGACTCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG 1863