Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04013
• Subject: NM_001313978.1
• Aligned Length: 837
• Identities: 707
• Gaps: 27

Alignment

Query   1  ------ATGAGGGGGAATCTGGCCCTGGTGGGCGTTCTAATCAGCCTGGCCTTCCTGTCACTGCTGCCATCTGG  68
                 |||||||   |.|||||.||.|..|||.|.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct   1  ATGATGATGAGGG---ACCTGGCTCTTGCAGGCATGCTGATTAGCCTGGCTTTCCTGTCCCTGCTGCCATCTGG  71

Query  69  ACATCCTCAGCCGGCTGGCGATGACGCCTGCTCTGTGCAGATCCTCGTCCCTGGCCTCAAAGGGGATGCGGGAG  142
           |..||||||||.|.|....||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  72  ATGTCCTCAGCAGACCACAGAGGACGCCTGCTCTGTGCAGATTCTTGTCCCTGGCCTCAAAGGGGATGCAGGAG  145

Query 143  AGAAGGGAGACAAAGGCGCCCCCGGACGGCCTGGAAGAGTCGGCCCCACGGGAGAAAAAGGAGACATGGGGGAC  216
           |.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146  AAAAGGGAGACAAAGGAGCCCCAGGACGGCCAGGAAGAGTCGGCCCTACAGGAGAAAAAGGAGACATGGGGGAC  219

Query 217  AAAGGACAGAAAGGCAGTGTGGGTCGTCATGGAAAAATTGGTCCCATTGGCTCTAAAGGTGAGAAAGGAGATTC  290
           ||||||||||||||||.||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct 220  AAAGGACAGAAAGGCACTGTGGGCCGCCATGGAAAAATTGGTCCCATTGGCGCAAAAGGTGAAAAAGGAGATTC  293

Query 291  CGGTGACATAGGACCCCCTGGTCCTAATGGAGAACCAGGCCTCCCATGTGAGTGCAGCCAGCTGCGCAAGGCCA  364
           .|||||.||.|||||||||||.||.|.|||||||||.||..|.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|
Sbjct 294  TGGTGATATCGGACCCCCTGGCCCCAGTGGAGAACCTGGTATTCCATGTGAGTGCAGTCAGCTGAGGAAGGCTA  367

Query 365  TCGGGGAGATGGACAACCAGGTCTCTCAGCTGACCAGCGAGCTCAAGTTCATCAAGAAT---------------  423
           |.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|..|||||.||.|||||.||.|||               
Sbjct 368  TTGGGGAGATGGACAACCAGGTCACTCAACTGACAACTGAGCTAAAATTCATAAAAAATGCACTGCCCTCCCCT  441

Query 424  ---GCTGTCGCCGGTGTGCGCGAGACGGAGAGCAAGATCTACCTGCTGGTGAAGGAGGAGAAGCGCTACGCGGA  494
              |||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 442  GCAGCTGTTGCTGGCGTGCGCGAGACTGAGAGCAAGATCTACCTGCTGGTGAAGGAGGAGAAGCGGTACGCAGA  515

Query 495  CGCCCAGCTGTCCTGCCAGGGCCGCGGGGGCACGCTGAGCATGCCCAAGGACGAGGCTGCCAATGGCCTGATGG  568
           .|||||||||||||||||.|.|||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 516  TGCCCAGCTGTCCTGCCAAGCCCGAGGCGGCACACTGAGCATGCCCAAAGACGAGGCAGCCAATGGCCTGATGG  589

Query 569  CCGCATACCTGGCGCAAGCCGGCCTGGCCCGTGTCTTCATCGGCATCAACGACCTGGAGAAGGAGGGCGCCTTC  642
           |..||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 590  CTTCATACCTGGCACAGGCTGGCCTGGCCCGAGTCTTCATCGGTATCAATGACCTGGAGAAAGAAGGTGCTTTC  663

Query 643  GTGTACTCTGACCACTCCCCCATGCGGACCTTCAACAAGTGGCGCAGCGGTGAGCCCAACAATGCCTACGACGA  716
           ||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 664  GTGTACTCGGACCGCTCCCCCATGCAGACCTTCAACAAGTGGCGCAGTGGAGAGCCCAACAACGCCTATGATGA  737

Query 717  GGAGGACTGCGTGGAGATGGTGGCCTCGGGCGGCTGGAACGACGTGGCCTGCCACACCACCATGTACTTCATGT  790
           |||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 738  GGAGGACTGTGTGGAGATGGTGGCCTCAGGTGGCTGGAATGATGTGGCCTGCCACATTACCATGTACTTCATGT  811

Query 791  GTGAGTTTGACAAGGAGAACATG  813
           |.|||||||||||.||||||.||
Sbjct 812  GCGAGTTTGACAAAGAGAACTTG  834