Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_04017
- Subject:
- XM_017318142.1
- Aligned Length:
- 1908
- Identities:
- 1674
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGCCCCGCCGCTCCTGCTGCTGCTGCTGGCCAGTGGAGCGGCCGCCTGCCCGCTGCCCTGCGTCTGCCAGAA 74
|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCCCCGCCGCTCCTATTGCTGCTGCTGGCCAGTGGAGCCGCTGCTTGCCCGCTACCCTGTGTGTGCCAGAA 74
Query 75 CCTGTCCGAGTCGCTCAGCACCCTCTGTGCCCACCGAGGCCTGCTGTTTGTGCCGCCCAACGTGGACCGGCGCA 148
||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 75 CCTGTCGGAGTCACTCAGCACCCTTTGTGCCCACCGAGGCCTGCTGTTTGTGCCACCCAACGTGGACAGGCGCA 148
Query 149 CAGTGGAGCTGCGGCTGGCTGACAACTTCATCCAGGCCCTGGGGCCCCCTGACTTCCGCAACATGACGGGACTG 222
||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149 CAGTTGAACTGCGCCTGGCCGACAACTTCATCCAGGCCCTGGGACCACCTGACTTCCGCAACATGACAGGGCTG 222
Query 223 GTGGACCTGACACTGTCTCGCAATGCCATCACCCGCATTGGGGCCCGCGCCTTTGGGGACCTCGAGAGCCTGCG 296
||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 GTGGACCTAACATTGTCTCGAAATGCCATCACCCGCATTGGGGCTCGCTCCTTTGGGGACCTGGAGAGCCTGCG 296
Query 297 TTCCCTCCACCTTGACGGCAACAGGCTGGTGGAGCTGGGCACCGGGAGCCTCCGGGGCCCCGTCAATCTGCAGC 370
.|||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||.|||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 297 CTCCTTGCACCTGGATGGCAACAGGCTGGTGGAGCTGGGCAGCAGCAGCCTACGGGGGCCTGTCAACCTCCAGC 370
Query 371 ACCTCATCCTCAGCGGCAACCAGCTGGGCCGCATCGCGCCGGGAGCCTTCGACGACTTCCTAGAGAGCCTGGAG 444
|.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 371 ATCTCATTCTCAGTGGCAATCAACTGGGCCGCATCGCCCCCGGGGCCTTCGACGACTTCCTTGACAGTCTCGAG 444
Query 445 GACCTGGACCTGTCCTACAACAACCTCCGGCAGGTGCCCTGGGCCGGCATCGGCGCCATGCCTGCCCTGCACAC 518
||||||||..|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.||
Sbjct 445 GACCTGGATGTGTCCTATAACAACCTCCGGCAGGTTCCCTGGGCTGGCATAGGCTCCATGCCTGCCCTGCATAC 518
Query 519 CCTCAACCTGGACCATAACCTTATTGACGCACTGCCCCCAGGCGCCTTCGCCCAGCTCGGTCAGCTCTCCCGCC 592
|||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|.|||.||.||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 519 CCTGAACCTGGACCATAACCTCATCGATGCACTACCCCCAGGTGTCTTTGCTCAGCTCAGCCAGCTCTCCCGCC 592
Query 593 TGGACCTCACCTCCAACCGCCTGGCCACGCTGGCTCCGGACCCGCTTTTCTCTCGTGGGCGTGATGCAGAGGCC 666
|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 593 TTGACCTCACCTCCAACCGCCTGGCCACCCTGGCACCTGATCCACTCTTCTCCCGAGGCCGGGATGCTGAGGCC 666
Query 667 TCTCCCGCCCCCCTGGTGCTGAGCTTTAGCGGGAACCCCCTGCACTGCAACTGTGAGCTGCTGTGGCTGCGGCG 740
||.||..|.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCACCTTCTCCCCTGGTGCTGAGTTTCAGCGGGAACCCACTGCACTGCAACTGTGAGCTGCTGTGGCTGCGGCG 740
Query 741 GCTGGCGCGGCCGGACGACCTGGAAACGTGCGCCTCCCCGCCCGGCCTGGCCGGCCGCTACTTCTGGGCAGTGC 814
||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||...||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCTGGCCCGGCCCGATGACCTGGAAACCTGCGCTTCTCCACCAACCCTGGCAGGCCGCTACTTCTGGGCAGTGC 814
Query 815 CCGAGGGCGAGTTCTCCTGTGAGCCGCCCCTCATTGCCCGCCACACGCAGCGCCTCTGGGTGCTGGAAGGCCAG 888
|.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 815 CTGAGGGAGAGTTCTCCTGTGAGCCTCCGCTGATTGCCCGGCACACACAGCGCCTGTGGGTGCTAGAGGGCCAG 888
Query 889 CGGGCCACGCTGCGGTGCCGGGCCCTGGGTGACCCCGCGCCTACCATGCACTGGGTCGGTCCTGACGACCGGTT 962
||||||||.||.||||||.|||||||.||||||||.|..|||||||||||||||||.||.|||||.|||.||.|
Sbjct 889 CGGGCCACCCTACGGTGCAGGGCCCTTGGTGACCCTGTACCTACCATGCACTGGGTTGGCCCTGATGACAGGCT 962
Query 963 GGTTGGCAACTCCTCCCGAGCCCGGGCTTTCCCCAACGGGACCTTAGAGATTGGGGTGACCGGCGCTGGGGACG 1036
||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 963 GGTTGGCAACTCTTCTCGAGCCTGGGCTTTCCCCAATGGGACCCTAGAGATTGGGGTGACGGGCGCTGGAGATG 1036
Query 1037 CTGGGGGCTACACCTGCATCGCCACCAACCCTGCTGGTGAGGCCACAGCCCGAGTAGAACTGCGGGTGCTGGCC 1110
|.||.|.|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 1037 CAGGAGCCTATACCTGCATTGCCACCAACCCTGCTGGTGAGGCCACAGCCCGAGTGGAGCTCCGGGTACTGGCC 1110
Query 1111 TTGCCCCATGGTGGGAACAGCAGTGCCGAGGGGGGCCGCCCCGGGCCCTCGGACATCGCCGCCTCCGCTCGCAC 1184
|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||.|.||
Sbjct 1111 TTGCCCCATGGTGGGAACACCAGTGCTGAGGGGGGCCGTCCTGGGCCTTCGGACATTGCTGCTTCTGCTAGAAC 1184
Query 1185 TGCTGCCGAGGGTGAGGGGACGCTGGAGTCTGAGCCAGCCGTGCAGGTGACGGAGGTGACCGCCACCTCAGGGC 1258
|||||||||.||.|||||.||..|.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1185 TGCTGCCGAAGGCGAGGGAACTTTAGAATCTGAACCAGCAGTGCAAGTGACGGAGGTGACTGCCACCTCTGGCC 1258
Query 1259 TGGTGAGCTGGGGTCCCGGGCGGCCAGCCGACCCAGTGTGGATGTTCCAAATCCAGTACAACAGCAGCGAAGAT 1332
|||||||||||||.|..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259 TGGTGAGCTGGGGCCTGGGGCGGCCAGCTGACCCAGTGTGGATGTTCCAAATCCAGTACAACAGCAGCGAGGAT 1332
Query 1333 GAGACCCTCATCTACCGGATTGTCCCAGCCTCCAGCCACCACTTCCTGCTGAAGCACCTCGTCCCCGGCGCTGA 1406
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1333 GAGACCCTCATCTACCGGATTGTACCAGCCTCCAGCCACCACTTCCTGCTGAAGCACCTGGTTCCCGGTGCTGA 1406
Query 1407 CTATGACCTCTGCCTGCTGGCCTTGTCACCGGCCGCTGGGCCCTCTGACCTCACGGCCACCAGGCTGCTGGGCT 1480
|||.||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1407 CTACGACCTCTGCCTGCTGGCCCTGTCACCTGCTGCTGGGCCCTCCGACCTCACGGCCACTAGACTGCTGGGCT 1480
Query 1481 GTGCCCATTTCTCCACGCTGCCGGCCTCGCCCCTGTGCCACGCCCTGCAGGCCCACGTGCTGGGCGGGACCCTG 1554
|||||||.|||||.|||||.||.|||.|.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GTGCCCACTTCTCTACGCTACCAGCCACCCCCCTGTGCCATGCCCTACAGGCCCATGTGCTGGGCGGGACCCTG 1554
Query 1555 ACCGTGGCCGTGGGGGGTGTGCTGGTGGCTGCCTTACTGGTCTTCACTGTGGCCTTGCTGGTTCGGGGCCGGGG 1628
||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACTGTGGCAGTGGGGGGCGTCCTAGTGGCTGCCTTACTGGTCTTCACTGTGGCCTTGCTGGTTCGGGGCCGGGG 1628
Query 1629 GGCCGGAAATGGCCGCCTCCCCCTCAAGCTCAGCCACGTCCAGTCCCAGACCAATGGAGGCCCCAGCCCCACAC 1702
.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|||||||||..|
Sbjct 1629 AGCTGGGAATGGCCGCCTCCCACTCAAACTCAGCCATGTCCAATCCCAGACCAATGGTGGCACCAGCCCCATGC 1702
Query 1703 CCAAGGCCCACCCGCCGCGGAGCCCCCCGCCCCGGCCGCAGCGCAGCTGCTCTCTGGACCTGGGAGATGCC--- 1773
|||||..||||||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||..||
Sbjct 1703 CCAAGAGCCACCCACCACGGAGCCCTCCACCCCGTCCTCAGCGCAGCTGCTCCCTGGACCTAGGAGACACCGGA 1776
Query 1774 GGGTGCTACGGTTATGCCAGGCGCCTGGGAGGAGCTTGGGCCCGACGGAGCCACTCTGTGCATGGGGGGCTGCT 1847
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777 GGATGCTACGGGTATGCCAGGCGCCTGGGAGGAGCCTGGGCCCGGCGGAGCCACTCTGTACATGGGGGGCTGCT 1850
Query 1848 CGGGGCAGGGTGCCGGGGGGTAGGAGGCAGCGCCGAGCGGCTGGAAGAGAGTGTGGTG 1905
.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1851 GGGAGCTGGGTGTCGGGGGGTGGGGGGCAGTGCGGAGCGGCTGGAGGAGAGTGTGGTG 1908